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Pou asire ke ti efè negatif te fèt sou abita Reef natirèl, li nan konseye ke donatè koloni dwe atenn ak kontwole apre koleksyon yo te fè. Sa a kapab itil tou pou swiv ak kenbe diferan genotip nan pepinyè a. Sa a ka fè lè l sèvi avèk yon GPS ak regilye nèf semenn klas substra a adjasan a koloni an ak yon makè inik oswa tag. Done yo dwe kolekte pandan evènman an fwagmantasyon inisyal yo ta dwe gen ladan: gwosè koloni (dyamèt maksimòm ak wotè), pousan tisi ap viv (nan 10 ki pi pre a), ak kondisyon koloni (egzanp, blesi, predatè oswa prezans damises).
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Afin de réduire au minimum les effets néfastes sur les habitats de récifs naturels, il est conseillé de marquer et de surveiller les colonies de donneurs après la collecte. Cela peut également être utile pour suivre et maintenir différents génotypes dans la pépinière. Cela peut être fait en utilisant un GPS et en marquant le substrat adjacent à la colonie avec un marqueur ou une étiquette unique. Les données à collecter lors de la fragmentation initiale devraient inclure: la taille de la colonie (diamètre et hauteur maximum), le pourcentage de tissu vivant (au% 10 le plus proche) et l’état de la colonie (lésions, présence de prédateurs ou de demoiselles).