In questi ultimi tempi il filtro Bayer è però profondamente in discussione, essendo alla base di alcuni difetti tipici della fotografia digitale. Attraverso l'operazione di demosaicing il processore d'immagine, basandosi sui dati di un pixel e su quelli dei pixel adiacenti con colore diverso, riesce a determinare (qualcuno oserebbe dire 'indovinare') l'entità delle tre diverse lunghezze d'onda fondamentali in ogni pixel.