El seu tractament pot ser tant farmacològic com quirúrgic depent de la gravetat de l'endometriosi, encara que el més eficaç és aquest últim. Mitjançant laparoscòpia o amb histerectomia s'extrau el teixit endometrial de l'òrgan on està creixent per aconseguir , en la majoria dels casos, la resolució del dolor i la restitució de l'anatomia per que la pacient es puga quedar embarassada