У чэрвені 1879 года за свае грошы прыяджае ў Петрапаўскаўск-Камчатскі, дзе працуе доктарам і адначасова займаецца даследваннем фаўны краю. Ён пяць разоў аб’ехаў паўвостраў, тры разы пабываў з даследваннямі на Камандорскіх выспах, падчас экспедыцый займаецца не толькі сборам флоры і фаўны, але і этнаграфічнымі даследваннямі, запісвае, а пасля і выдае ітэльменскі і айнскі моўныя слоўнікі. У 1883 гаду, пасля завяршэння сваёй навуковай экспедыцыі, па запрашэнню Львоўскага ўніверсітэта, пераяджае на Украіну. З сабой з Камчаткі Бенедыкт Дыбоўскі перавозіў скарб усяго жыцця – разнастайную калекцыю вагой 116 цэнтнераў (ці 11 600 кг)!