Niekodujący DNA w ortologicznych regionach międzygenowych człowieka i myszy zawiera "wyspy" konserwowanych sekwencji, których funkcje pozostają w dużej mierze nieznane. Postawiliśmy hipotezę, że niektóre z tych regionów mogą być regionami przyłączania matryca-kafold MAR (lub S/MAR). MAR stanowią jedną z niewielu klas eukariotycznego niekodującego DNA eukariotycznego niekodującego DNA z eksperymentalnie scharakteryzowaną funkcją, zaangażowaną w w przyłączanie chromatyny do macierzy jądrowej, przebudowę chromatyny i regulację transkrypcji. regulację transkrypcji. Aby przetestować naszą hipotezę, przeanalizowaliśmy współwystępowanie przewidywanych MAR z wysoce konserwatywnymi niekodującymi regionami DNA w ludzkich i mysich genomowych. Stwierdziliśmy, że 11% konserwowanego niekodującego DNA składa się z przewidywanych MAR. I odwrotnie, ponad połowa przewidywanych MAR współwystępuje z lub więcej niezależnie zidentyfikowanych bloków sekwencji. Nadmiar obserwuje się w regionach międzygenowych poprzedzających końce 5' genów, co sugeruje, że te MAR genów, co sugeruje, że te MAR są głównie zaangażowane w kontrolę transkrypcji. kontrolę transkrypcji.
Czy konserwowane elementy niekodujące współwystępują z regionami przyłączania macierzy?
Tak. Szacuje się, że 11% konserwowanego niekodującego DNA składa się z przewidywanych MAR. I odwrotnie, ponad połowa przewidywanych MAR współwystępuje z jednym lub więcej niezależnie zidentyfikowanymi konserwowanymi blokami sekwencji. Nadmiar konserwowanych przewidywanych MAR jest widoczny w regionach międzygenowych poprzedzających końce 5' genów, co sugeruje, że te MAR są głównie zaangażowane w kontrolę transkrypcji.