Arthrobacter alpinus R3.8 to psychrotolerancyjny szczep bakteryjny wyizolowany z próbki gleby w Rothera Point na wyspie Adelaide, w pobliżu Półwyspu Antarktycznego. Półwyspu Antarktycznego. Szczep R3.8 został poddany sekwencjonowaniu w celu odkrycia potencjalnych aktywnych enzymów o zastosowaniach biotechnologicznych. Analiza genomu zidentyfikowała różne geny adaptacji do zimna, w tym niektóre kodujące białka zapobiegające zamarzaniu i szoku zimna, geny zaangażowane w bioremediację związków ksenobiotycznych, w tym naftalenu. w tym naftalenu, oraz geny o właściwościach chitynolitycznych i N-acetyloglukozaminy a także właściwości wpływające na wzrost roślin. W niniejszym przedstawiamy kompletną sekwencję genomu szczepu A. alpinus R3.8 i jego dane adnotacyjne, które ułatwią wykorzystanie potencjalnych nowych enzymów aktywnych w niskich temperaturach. --- Informacje o autorze: (1)Department of Applied Chemistry, Graduate School of Engineering, University of Hyogo, Himeji, Hyogo, Japonia. of Hyogo, Himeji, Hyogo, Japonia. (2)Graduate School of Science and Engineering, Kagoshima University, Korimoto, Kagoshima, Japonia. (3) Wydział Chemii Stosowanej, Graduate School of Engineering, University of Hyogo, Himeji, Japonia. of Hyogo, Himeji, Hyogo, Japonia negoro@eng.uhyogo.ac.jp. --- Informacje o autorze: (1)State Key Laboratory of Urban Water Resource and Environment, Harbin Institute of Technology, 150090, Harbin, Chiny; Sekcja Inżynierii Sanitarnej, Department of Water Management, Delft University of Technology, 2628CN, Delft, Holandia. (2)Państwowe Kluczowe Laboratorium Miejskich Zasobów Wodnych i Środowiska, Harbin Institute of Technology, 150090, Harbin, Chiny. (3)Sekcja Inżynierii Sanitarnej, Wydział Gospodarki Wodnej, Delft University of Technology, 2628CN, Delft, Holandia. (4) Państwowe Kluczowe Laboratorium Miejskich Zasobów Wodnych i Środowiska, Harbin Institute of Technology, 150090, Harbin, Chiny. Adres elektroniczny: yangxj@hit.edu.cn. (5)State Key Laboratory of Urban Water Resource and Environment, Harbin Institute of Technology, 150090, Harbin, Chiny. Adres elektroniczny: wli@hit.edu.cn. --- Informacje o autorze: (1)Department of Biology, University of Florence, Florencja, Włochy. (2)Department of Experimental and Clinical Medicine, University of Florence, Florencja, Włochy. (3)Centrum Medycyny Integracyjnej, Szpital Uniwersytecki Careggi, Uniwersytet we Florencji, Florencja, Włochy. Florencja, Florencja, Włochy. (4) Wydział Chirurgii i Medycyny Translacyjnej, Uniwersytet Florencki, Florencja, Włochy. (5) Oddział Mikrobiologii Klinicznej i Wirusologii, Szpital Uniwersytecki Careggi, Florencja, Włochy. (6)Wydział Biologii, Uniwersytet Florencki, Florencja, Włochy renato.fani@unifi.it. --- Arthrobacter sp. B6 jest Gram-dodatnią, nieruchliwą, fakultatywną bakterią tlenową wyizolowaną z zanieczyszczonego arsenem osadu warstwy wodonośnej w dorzeczu Datong w Chinach. w dorzeczu Datong w Chinach. Szczep ten wykazuje wysoką odporność na arsen i może dynamicznie przekształcać arsen w warunkach tlenowych. Tutaj opisaliśmy wysokiej jakości wstępną sekwencję genomu, adnotacje i cechy Arthrobacter sp. B6. Zawartość G + C w genomie wynosi 64,67%. Szczep ten ma wielkość genomu 4,663,437 bp; genom jest ułożony w 8 rusztowań, które zawierają 25 kontigów. Z sekwencji zidentyfikowano 3956 genów kodujących białka, 264 pseudogeny i 89 zidentyfikowano geny kodujące tRNA/rRNA. Analiza genomu tego szczepu pomaga lepiej zrozumieć mechanizm, dzięki któremu mikroorganizm skutecznie toleruje arsen w środowisku zanieczyszczonym arsenem. --- Arthrobacter phenanthrenivorans jest typowym gatunkiem rodzaju i jest w stanie metabolizować fenantren jako jedyne źródło węgla i energii. A. phenanthrenivorans jest tlenową, niemotylną i Gram-dodatnią bakterią, wykazującą pręcikowo-kokusowy cykl wzrostu, która została pierwotnie wyizolowana z zanieczyszczonego kreozotem miejsca w Epirusie w Grecji. Tutaj opisujemy cechy tego organizmu, wraz z pełną sekwencją genomu i adnotacją.
Analizy proteomiczne wymagają wcześniejszej znajomości kompletnego genomu organizmu. Czy dostępny jest kompletny genom bakterii z rodzaju Arthrobacter?
Tak, kompletna sekwencja genomu Arthrobacter (dwa szczepy) jest zdeponowana w GenBank.