Białka chorionowe Lepidoptera mają trójdzielną strukturę, która składa się z domeny centralnej i dwóch, bardziej zmiennych, bocznych ramion. Domena centralna jest wysoce konserwatywna i jest wykorzystywana do klasyfikacji białek chorionu na dwie główne klasy, A i B. A i B. Sekwencje białek chorionowych Lepidoptera są dostępne w różnych bazach danych. są dostępne w różnych bazach danych. Baza danych o nazwie LepChorionDB, została skonstruowana poprzez przeszukanie 5 różnych baz danych białek przy użyciu Ukrytych Modeli Markowa (pHMM) specyficznych dla domeny centralnej klasy A i B, opracowanych w tej pracy. Łącznie 413 białek chorionowych Lepidoptera z 9 ćmy i 1 gatunku motyla. Dane te zostały wzbogacone i zorganizowane w celu zapełnienia LepChorionDB, pierwszej relacyjnej bazy danych, dostępną w Internecie, zawierającą białka chorionowe Lepidoptera pogrupowane w klasy A i B. LepChorionDB może zapewnić wgląd w przyszłe funkcjonalne i funkcjonalnych i ewolucyjnych białek chorionowych Lepidoptera, a zatem będzie to użytecznym narzędziem dla społeczności naukowej Lepidoptera i anotatorów genomów Lepidoptera. genomów Lepidoptera, ponieważ zapewnia również dostęp do dwóch pHMM opracowanych w tej pracy. które mogą być wykorzystane do rozróżnienia białek chorionowych klasy A i B. LepChorionDB jest dostępny bezpłatnie pod adresem http://bioinformatics.biol.uoa.gr/LepChorionDB.
Która baza danych jest dostępna do identyfikacji białek chorionowych w proteomach Lepidoptera?
LepChorionDB