Okrągłe RNA są nowymi graczami w regulacji posttranskrypcyjnej ekspresji genów ekspresji. Genomy zwierząt wyrażają wiele kolistych RNA z różnych lokalizacji genomowych. genomowych. Niedawne badania potwierdziły dość dużą liczbę kolistych RNA u ludzi, myszy i nicieni. Okrągłe RNA odgrywają kluczową rolę w dostrajaniu poziomie regulacji ekspresji genów za pośrednictwem miRNA poprzez sekwestrację miRNA. miRNA. Ich interakcja z miRNA związanymi z chorobą wskazuje, że koliste RNA są ważne dla regulacji choroby. W tym artykule zbadaliśmy potencjalny związek kolistych RNA (circRNA) z chorobami ludzkimi na dwa różne sposoby. różne sposoby. Po pierwsze, zidentyfikowano interakcje circRNA z miRNA związanymi z chorobą. miRNA, po czym obliczono prawdopodobieństwo powiązania circRNA z chorobą. związane z chorobą. Dla miRNA powiązanych z z poszczególnymi chorobami, skonstruowaliśmy sieć przewidywanych interakcji między miRNA a genami kodującymi białka, długimi niekodującymi i kolistymi RNA. My przeprowadziliśmy analizę wzbogacenia ontologii genów (GO) na zestawie genów kodujących białko kodujących białka w interakcjach miRNA- circRNA w poszczególnych chorobach, aby sprawdzić wzbogacenie genów związanych z określonymi procesami biologicznymi. Po drugie, SNP związane z chorobą zostały zmapowane na loci circRNA, a miejsca interakcji Argonaute (Ago) zidentyfikowano miejsca interakcji na kolistych RNA. Skompilowaliśmy bazę danych w Circ2Traits (http://gyanxet-beta.com/circdb/), pierwszą kompleksową bazę wiedzy o potencjalnym powiązaniu kolistych RNA z chorobami u ludzi.
Czy circRNA są powiązane z chorobami i cechami?
Tak. Okrągłe RNA (circRNA) odgrywają kluczową rolę w dostrajaniu poziomu regulacji ekspresji genów za pośrednictwem miRNA poprzez sekwestrację miRNA. Ich interakcja z miRNA związanymi z chorobą wskazuje, że koliste RNA są ważne dla regulacji choroby.