U Escherichia coli i pokrewnych bakterii jelitowych, naprawa niedopasowań zasad-baza jest wykonywana przez dwa nakładające się na siebie procesy biochemiczne, naprawę niedopasowania metylowego (ang. methyl-directed mismatch (MMR) i naprawę bardzo krótkich łatek (VSP). Podczas gdy MMR naprawia błędy replikacji replikacji, naprawa VSP koryguje błędy C*G powstałe w wyniku deaminacji 5-metylocytozyny do T. deaminacji 5-metylocytozyny do T. Wydajność tych dwóch ścieżek zmienia się podczas cyklu życia bakterii. cyklu życiowego bakterii; MMR jest bardziej wydajny podczas wzrostu wykładniczego, a naprawa VSP jest bardziej wydajna podczas fazy stacjonarnej. Naprawa VSP i MMR współdzielą dwa białka, MutS i MutL, i chociaż obie ścieżki naprawy nie są w równym stopniu zależne od tych białek, ich w równym stopniu zależne od tych białek, ich podwójne zastosowanie tworzy konkurencję w komórkach w komórkach między procesami naprawy. Dane strukturalne i biochemiczne dotyczące endonukleazy, która inicjuje naprawę VSP, Vsr, sugerują, że białko to odgrywa rolę podobną do rolę podobną do MutH (również endonukleazy) w MMR. Badania biochemiczne i genetyczne i genetyczne tych dwóch szlaków naprawczych pomogły wyeliminować niektóre modele MMR i nałożyć ograniczenia na modele, które można opracować w odniesieniu do każdego z procesów naprawy. procesu naprawy. Dokonujemy tutaj przeglądu najnowszych informacji na temat biochemii obu procesów naprawy procesów naprawczych i opisujemy balansowanie wykonywane przez komórki w celu optymalizacji konkurencyjnych procesów w różnych fazach cyklu życiowego bakterii. --- Stosując królicze przeciwciała poliklonalne, wykazaliśmy, że metylaza cytozyny Dcm Escherichia coli jest utrzymywana na stałym poziomie podczas wzrostu komórki, podczas gdy poziom endonukleazy wzrostu, podczas gdy poziom endonukleazy Vsr jest zależny od fazy wzrostu. Zmniejszona produkcji Vsr w stosunku do Dcm podczas fazy logarytmicznej może przyczyniać się do znacząco do mutowalności 5-metylocytozyny.
Czy regulacja endonukleazy Vsr jest niezależna od fazy wzrostu bakterii?
Regulacja poziomów endonukleazy Vsr jest zależna od fazy wzrostu.