Enzymy deubikwitynujące (DUB) usuwają ubikwitynę (Ub) ze sprzężonych z Ub substratów, regulując funkcjonalny wynik ubikwitylacji. aby regulować funkcjonalny wynik ubikwitylacji. Poniżej przedstawiamy odkrycie nowej rodziny DUB, którą nazwaliśmy MINDY (motyw interacting with Ub-containing novel DUB family). Występuje u wszystkich eukariontów, DUB z rodziny MINDY są wysoce selektywne w rozszczepianiu poli-Ub związanego z K48, sygnału który kieruje białka do degradacji. Zidentyfikowaliśmy aktywność katalityczną, która jest aktywność katalityczna jest kodowana w uprzednio nieoznaczonej domenie, której struktura krystaliczna ujawnia odrębny fałd białkowy bez homologii do żadnego ze znanych DUB. Struktura krystaliczna Struktura krystaliczna MINDY-1 (znanego również jako FAM63A) w kompleksie z propargylowanym Ub ujawnia zmiany konformacyjne, które wyrównują miejsce aktywne dla katalizy. MINDY-1 preferuje rozszczepianie długich łańcuchów poli-Ub i działa poprzez przycinanie łańcuchy od dystalnego końca. Podsumowując, nasze wyniki ujawniają nową rodzinę DUB, które mogą pełnić wyspecjalizowane role w regulacji proteostazy.
Czym jest MINDY-1?
MINDY-1 (motyw oddziałujący z nową rodziną DUB zawierającą Ub) jest członkiem ewolucyjnie konserwowanej i strukturalnie odrębnej nowej rodziny enzymów deubikwitynujących. Występujące u wszystkich eukariontów DUB z rodziny MINDY są wysoce selektywne w rozszczepianiu poli-Ub związanego z K48, sygnału, który kieruje białka do degradacji. MINDY-1 preferuje rozszczepianie długich łańcuchów poliUb i działa poprzez przycinanie łańcuchów z dystalnego końca.