Długie niekodujące RNA (lncRNA) wyłaniają się jako ważne regulatory szlaków rozwojowych. Jednak ich rola w ludzkich komórkach prekursorowych serca (CPC) pozostają niezbadane. Aby scharakteryzować długi niekodujący transkryptom podczas ludzkiego różnicowania sercowego CPC, profilowaliśmy transkryptom lncRNA w CPCs wyizolowanych z ludzkiego serca płodowego i zidentyfikowaliśmy 570 lncRNA, które były modulowane podczas różnicowania serca. Wiele z nich było powiązanych z aktywnymi wzmacniaczami serca i super wzmacniaczami (SE), a ich ekspresja była skorelowana z proksymalnymi genami serca. Jednym z najbardziej regulowanych w górę lncRNA był lncRNA związany z SE, który został nazwany CARMEN, (CAR)diac (M)esoderm (E)nhancer-associated (N)oncoding RNA. CARMEN wykazuje zależną od RNA aktywność wzmacniającą aktywność i znajduje się przed siecią regulacyjną genów określających mezodermę serca sieć. Co ciekawe, CARMEN oddziałuje z SUZ12 i EZH2, dwoma składnikami kompleksu represyjnego kompleksu represyjnego polycomb 2 (PRC2). Wykazaliśmy, że knockdown CARMEN hamuje specyfikację serca i różnicowanie w komórkach prekursorowych serca niezależnie od ekspresji MIR-143 i -145, dwóch mikroRNA zlokalizowanych proksymalnie do sekwencji wzmacniacza. sekwencji wzmacniających. Co ważne, ekspresja CARMEN była aktywowana podczas patologicznej przebudowy w mysich i ludzkich sercach i była niezbędna do utrzymania tożsamości serca w zróżnicowanych kardiomiocytach. Badanie to że CARMEN jest kluczowym regulatorem różnicowania i homeostazy komórek serca. różnicowania i homeostazy komórek serca.
Opracowanie roli CARMEN w specyfikacji serca.
CARMEN, (CAR)diac (M)esoderm (E)nhancer-associated (N)oncoding RNA, jest ludzkim długim niekodującym RNA związanym z super wzmacniaczem, kontrolującym specyfikację serca, różnicowanie i homeostazę. CARMEN wykazuje aktywność wzmacniającą zależną od RNA i znajduje się przed siecią regulacyjną genów określających mezodermę serca. CARMEN oddziałuje z SUZ12 i EZH2, dwoma składnikami kompleksu represyjnego polycomb 2 (PRC2). Ekspresja CARMEN jest aktywowana podczas patologicznej przebudowy w mysich i ludzkich sercach i jest niezbędna do utrzymania tożsamości serca w zróżnicowanych kardiomiocytach.