STRESZCZENIE: Cechy rozpoznawania molekularnego (MoRF) są małymi, wewnętrznie nieuporządkowanymi regionami w białkach. nieuporządkowane regiony w białkach, które przechodzą przejście od nieuporządkowania do uporządkowania na wiążąc się ze swoimi partnerami. MoRF są zaangażowane w interakcje białko-białko i mogą funkcjonować jako początkowy etap rozpoznawania molekularnego. Celem tej pracy było pracy było zebranie, zorganizowanie i przechowywanie wszystkich białek błonowych, które zawierają MoRFs. Białka błonowe stanowią ∼30% w pełni zsekwencjonowanych proteomów i są odpowiedzialne za wiele różnych funkcji komórkowych. MoRF zostały sklasyfikowane zgodnie z ich strukturą drugorzędową, po interakcji z ich partnerami. Zidentyfikowaliśmy MoRFs w białkach błon transbłonowych i obwodowych. Pozycja białek transbłonowych MoRF określono w odniesieniu do topologii białka. topologii białka. Wszystkie informacje były przechowywane w publicznie dostępnej bazie danych mySQL z przyjaznym dla użytkownika interfejsem internetowym. Zintegrowano aplet Jmol do wizualizacji struktur. mpMoRFsDB dostarcza cennych informacji związanych z topologią białek. z interakcjami białko-białko opartymi na zaburzeniach w białkach błonowych. DOSTĘPNOŚĆ: http://bioinformatics.biol.uoa.gr/mpMoRFsDB
Jaka jest baza danych cech rozpoznawania molekularnego w białkach błonowych?
mpMoRFsDB dostarcza cennych informacji związanych z interakcjami białko-białko opartymi na zaburzeniach w białkach błonowych.