Które narzędzie wykorzystuje samoorganizujące się mapy do analizy użycia kodonów synonimicznych?
INteractive Codon usage Analysis (INCA) zapewnia szereg funkcji przydatnych w analizie synonimicznego użycia kodonów w całych genomach. Oprócz obliczania częstotliwości kodonów i kilku wskaźników użycia, takich jak "odchylenie kodonu", efektywne Nc i CAI, podstawową siłą INCA jest wiele opcji interaktywnego graficznego wyświetlania obliczonych wartości, umożliwiając w ten sposób wizualne wykrywanie różnych trendów w użyciu kodonów. Wreszcie, INCA zawiera specjalny algorytm nienadzorowanej sieci neuronowej, samoorganizującą się mapę, używaną do grupowania genów zgodnie z preferowanym wykorzystaniem kodonów.