Jaka jest funkcjonalność pakietu Triplex R/bioconductor?
Triplex to pakiet R/Bioconductor służący do identyfikacji i wizualizacji potencjalnych wewnątrzcząsteczkowych wzorów tripleksów w sekwencjach DNA. Pakiet zapewnia funkcje, które można wykorzystać do przeszukiwania genomów Bioconductor i innych danych sekwencji DNA pod kątem występowania wzorców nukleotydów zdolnych do tworzenia wewnątrzcząsteczkowych tripleksów (H-DNA). Funkcje tworzące diagramy 2D i 3D zidentyfikowanych tripleksów umożliwiają natychmiastową wizualizację wyników wyszukiwania. Wykorzystując moc klas Biostrings i GRanges, wyniki są w pełni zintegrowane z istniejącą strukturą Bioconductor, umożliwiając ich przejście do innych pakietów wizualizacji i adnotacji genomu, takich jak GenomeGraphs, rtracklayer lub Gviz.