U kręgowców, konserwowane elementy niekodujące (CNE) są funkcjonalnie ograniczonymi sekwencjami, które mogą wykazywać uderzającą konserwację na przestrzeni sekwencje, które mogą wykazywać uderzającą konserwację przez >400 milionów lat ewolucyjnych i często znajdują się w megabazach z dala od docelowych genów rozwojowych. docelowych genów rozwojowych. Konserwowane sekwencje niekodujące (CNS) w roślinach są znacznie krótsze krótsze i trudno było wykryć konserwację wśród odległych pokrewnych genomów. W tym artykule pokazujemy nie tylko, że sekwencje CNS mogą być można wykryć w całym kladzie eudicot roślin kwitnących, ale także, że 37 CNS można znaleźć we wszystkich roślinach kwitnących (rozbieżnych ∼170 milionów lat temu). lat temu). Te CNS są funkcjonalnie podobne do CNE kręgowców, będąc wysoce związane z czynnikami transkrypcyjnymi i genami rozwojowymi oraz wzbogacone w miejsca wiązania czynników transkrypcyjnych. Niektóre z najbardziej konserwatywnych sekwencji występują w genach kodujących białka wiążące RNA, w szczególności RNA związanych ze splicingiem genów SR. Różnice w zachowaniu sekwencji między między roślinami i zwierzętami prawdopodobnie odzwierciedlają różnice w biologii tych organizmów. organizmów, przy czym rośliny są znacznie bardziej zdolne do tolerowania delecji genomowych i zdarzenia duplikacji całego genomu, częściowo ze względu na ich znacznie większą płodność w porównaniu z kręgowcami.
Czy istnieje związek między zachowanymi elementami niekodującymi a alternatywnym splicingiem u kręgowców?
Tak. Niektóre z najbardziej konserwatywnych sekwencji występują w genach kodujących białka wiążące RNA, w szczególności w genach SR związanych ze splicingiem RNA.