Które pakiety są używane do przeprowadzania analizy nakładania się regionów genomowych w R/bioconductor?
IRanges, GenomicRanges i GenomicFeatures zapewniają skalowalne struktury danych do reprezentowania adnotowanych zakresów w genomie, ze specjalnym wsparciem dla struktur transkryptów, wyrównań odczytów i wektorów pokrycia. Funkcje obliczeniowe obejmują wydajne algorytmy wykrywania nakładania się i najbliższego sąsiada, obliczania pokrycia i innych operacji zakresu. Infrastruktura ta bezpośrednio wspiera ponad 80 innych pakietów Bioconductor, w tym te do analizy sekwencji, analizy ekspresji różnicowej i wizualizacji.