Kompleksy białkowe zaangażowane w epigenetyczną regulację transkrypcji wyewoluowały jako molekularne strategie radzenia sobie ze stresem środowiskowym u roślin. SAGA (acetylotransferaza Spt-Ada-Gcn5) jest kompleksem koaktywatora transkrypcji, który reguluje liczne procesy komórkowe poprzez koordynację wielu potranslacyjnych modyfikacji histonów, w tym acetylacji, deubikwitynację i rozpoznawanie chromatyny. Różnorodne funkcje kompleksu SAGA obejmują różne moduły, które są wysoce konserwatywne między drożdżami, muchami i ssakami, i ssakami. W niniejszym przeglądzie opisano skład kompleksu SAGA u roślin i jego rolę w ekspresji genów. opisano jego rolę w regulacji ekspresji genów w warunkach stresowych podsumowano. Niektóre z tych białek są prawdopodobnie zaangażowane w regulację indukowalnej ekspresji genów w warunkach stresowych. indukowalnej ekspresji genów w warunkach stresu świetlnego, zimna, suszy, soli i żelaza, chociaż funkcje kilku jego składników pozostają nieznane. --- Organizacja molekularna drożdżowego koaktywatora transkrypcyjnego Spt-Ada-Gcn5 (SAGA) analizowano za pomocą mikroskopii elektronowej pojedynczych cząstek. Całkowita lub częściowa delecja podjednostki Sgf73 odłącza podjednostkę moduł deubikwitynacji (DUB) od SAGA i sprzyja w naszych warunkach rozszczepieniu C-końcowych końców podjednostki Spt7 i utracie podjednostki Spt8 podjednostki. Porównanie strukturalne SAGA typu dzikiego z dwoma mutantami delecyjnymi pozycjonowało moduł DUB i umożliwiło dopasowanie dostępnych modeli atomowych. modeli atomowych. Lokalizacja modułu DUB w pobliżu Gcn5 definiuje interfejs wiążący chromatynę w SAGA. interfejs wiążący chromatynę w SAGA, co można wykazać poprzez wiązanie cząsteczek rdzenia nukleosomu. Białko wiążące TATA-box (TBP) stwierdzono, że podjednostka Spt8 znajduje się w pobliżu DUB, ale w innej domenie niż Spt3. innej domenie niż Spt3, o której również wiadomo, że kontaktuje się z TBP. Elastyczne ramię białkowe zbliża obie podjednostki na tyle, by mogły oddziaływać jednocześnie z TBP. --- NuA4 (acetylotransferaza nukleosomowa H4) promuje inicjację transkrypcji TFIID (kompleks TBP i czynników związanych z TBP [TAF]) zależnych od genów białek rybosomalnych geny białek zaangażowane w biogenezę rybosomów. Nie jest jednak jasne, w jaki sposób w jaki sposób NuA4 reguluje transkrypcję genów białek rybosomalnych. Tutaj pokazujemy, że NuA4 jest rekrutowany do promotorów genów białek rybosomalnych, takich jak genów białek rybosomalnych, takich jak RPS5, RPL2B i RPS11B, do rekrutacji TFIID w celu zainicjowania transkrypcji transkrypcji, a rekrutacja NuA4 do tych promotorów jest upośledzona w brak jego składnika Eaf1p. Co ciekawe, upośledzona rekrutacja NuA4 w promotorze Δeaf1 wyczerpuje rekrutację TFIID (forma TBP zależna od TAF), ale nie niezależna od TAF forma TBP do promotorów genów białek rybosomalnych. Jednak pod nieobecność NuA4, SAGA (Spt-Ada-Gcn5-acetylotransferaza) jest zaangażowana w ukierunkowanie jest zaangażowana w kierowanie niezależnej od TAF formy TBP do promotorów genów białek rybosomalnych. genów białek rybosomalnych w celu inicjacji transkrypcji. Tak więc NuA4 odgrywa ważną rolę w kierowaniu TFIID do promotorów genów białek rybosomalnych dla inicjacji transkrypcji in vivo. Taka funkcja jest pośredniczona przez ukierunkowaną aktywność acetylotransferazy histonowej. W przypadku braku NuA4, geny białek rybosomalnych geny białek rybosomalnych tracą zależność od TFIID i stają się zależne od SAGA dla inicjacji transkrypcji. Łącznie wyniki te dostarczają znaczących wgląd w regulację ekspresji genów białek rybosomalnych, a tym samym biogenezy i funkcji rybosomów, biogenezy i funkcji rybosomów.
Co oznacza skrót SAGA complex?
SAGA to skrót od Spt-Ada-Gcn5-acetylotransferazy (SAGA).