Metylacja białek jest powszechną modyfikacją potranslacyjną, która najczęściej zachodzi głównie na resztach argininy i lizyny. Metylacja argininy została zgłoszona reguluje przetwarzanie RNA, transkrypcję genów, naprawę uszkodzeń DNA, translokację białek i transdukcję sygnałów. translokację białek i transdukcję sygnału. Metylacja lizyny jest najbardziej znana z tego, że histonów i jest zaangażowana w epigenetyczną regulację transkrypcji genów. transkrypcji genów. Aby lepiej zbadać metylację białek, opracowaliśmy wysoce specyficzne przeciwciała przeciwko monometylowej argininie; asymetrycznej dimetylowej argininie; oraz monometylowych, dimetylowych i trimetylowych motywów lizyny. Przeciwciała te zostały wykorzystano do przeprowadzenia oczyszczania peptydów metylowych metodą immunopowinowactwa, a następnie LC-MS/MS w celu identyfikacji i ilościowego określenia miejsc metylacji argininy i lizyny w kilku badaniach modelowych. Ogólnie zidentyfikowaliśmy ponad 1000 miejsc metylacji argininy w ludzkich liniach komórkowych i tkankach myszy oraz ∼160 miejsc metylacji lizyny w ludzkiej linii komórkowej HCT116. ludzkiej linii komórkowej HCT116. Liczba miejsc metylacji zidentyfikowanych w tym badaniu przekracza te znalezione w dotychczasowej literaturze. Szczegółowa analiza białek metylowanych argininą obserwowanych w mózgu myszy w porównaniu z tymi znalezionymi w zarodku myszy wykazuje tkankowo-specyficzny rozkład metylacji argininy, i rozszerza typy białek, o których wiadomo, że są metylowane argininą do o wiele nowych typów białek. Wiele białek metylowanych argininą, które zidentyfikowaliśmy w mózgu, w tym receptory, kanały jonowe, transportery i białka pęcherzykowe. białka pęcherzykowe, są zaangażowane w transmisję synaptyczną, podczas gdy najbardziej metylowanych białek zidentyfikowanych z zarodka myszy są transkrypcyjne regulatorami transkrypcji i białkami przetwarzającymi RNA.
Nazwa metody wzbogacania peptydów metylowanych argininą.
Oczyszczanie metodą immunopowinowactwa przy użyciu specyficznych przeciwciał zostało zastosowane w celu wzbogacenia metylowanych peptydów.