Informacje o autorze: (1)Instytut Biologii Molekularnej Zakażeń, Uniwersytet w Würzburgu, Josef-Schneider-Straße 2, 97080 Würzburg, Niemcy. (2)Instytut Biologii Molekularnej Zakażeń, Uniwersytet w Würzburgu, Josef-Schneider-Straße 2, 97080 Würzburg, Niemcy. Adres elektroniczny: joerg.vogel@uni-wuerzburg.de. --- Czynnik transkrypcyjny POU OCT4 jest plejotropowym regulatorem ekspresji genów w embrionalnych komórkach macierzystych. Ostatnie badania wykazały, że OCT4 jest nieprawidłowo ekspresji w wielu typach nowotworów u ludzi; jednak podstawowy mechanizm molekularny pozostaje w dużej mierze nieznany. mechanizm pozostaje w dużej mierze nieznany. W tym badaniu donosimy, że OCT4-pg4, pseudogen pseudogen OCT4, jest nieprawidłowo aktywowany w raku wątrobowokomórkowym (HCC). Poziom ekspresji OCT4-pg4 jest dodatnio skorelowany z poziomem OCT4 i oba transkrypty genów mogą być bezpośrednio namierzane przez hamujący nowotwór mikro RNA miR-145. Stwierdziliśmy, że niekodujący RNA OCT4-pg4 jest biologicznie aktywny, ponieważ może zwiększać poziom białka OCT4 w HCC. Analiza mechanistyczna wykazała, że OCT4-pg4 funkcjonuje jako naturalna gąbka mikro RNA chroniąca transkrypt OCT4 przed hamowanego przez miR-145. Ponadto nasze badanie wykazało również, że OCT4-pg4 może promować wzrost i nowotworowość komórek HCC, wywierając w ten sposób onkogenną rolę w hepatokarcynogenezie. Ponadto analiza przeżycia sugeruje, że wysoki poziom OCT4-pg4 jest istotnie skorelowany ze złym rokowaniem u pacjentów z HCC. Podsumowując, nasze odkrycie dodaje nową warstwę regulacji potranskrypcyjnej OCT4 i rzuca nowe światło na leczenie ludzkiego HCC. --- Znaczna część genomu ssaków koduje liczne transkrypty, które które nie są tłumaczone na białka, określane jako długie niekodujące RNA. Początkowe badania identyfikujące długie niekodujące RNA wywnioskowały, że te sekwencje RNA były konsekwencją szumu transkrypcyjnego lub nietypowej aktywności polimerazy RNA II. Jednak w ostatniej dekadzie ostatnia dekada przyniosła rewolucję w rozumieniu regulacji i funkcji długich niekodujących RNA. i funkcji długich niekodujących RNA. Teraz stało się jasne, że długie niekodujące RNA odgrywają kluczową rolę w wielu różnych procesach biologicznych. W niniejszym przeglądzie opisujemy obecny stan wiedzy na temat długich niekodujących RNA. RNA w regulacji procesów komórkowych: różnicowania, rozwoju i chorób. choroby. --- Istnieje rosnąca lista przykładów, za pomocą których jeden mRNA może posttranskrypcyjnie wpływać na ekspresję innych. Może to obejmować RNA gąbki, które sekwestrują regulatorowe RNA mRNA w tym samym regulonie, ale podstawowy mechanizm molekularny molekularny mechanizm takiego wzajemnego oddziaływania mRNA pozostaje mało poznany. mało poznany. Tutaj opisujemy pośredniczoną przez gąbki krzyżową rozmowę mRNA w posttranskrypcyjnej sieci posttranskrypcyjnej sieci GcvB, konserwatywnego małego RNA zależnego od Hfq z jednym z największych regulonów znanych u bakterii. Pokazujemy, że rozpad mRNA z locus gltIJKL kodującego transporter aminokwasów ABC generuje stabilny fragment (SroC), który łączy się w pary zasad z GcvB. Ta interakcja wyzwala degradację GcvB przez RNazę E, łagodząc pośredniczoną przez GcvB represję mRNA innych genów związanych z transportem i metabolizmem aminokwasów. związanych z transportem aminokwasów i genów metabolicznych. Co ciekawe, ponieważ sam mRNA gltIJKL jest celem GcvB, gąbka SroC wydaje się umożliwiać zarówno wewnętrzną pętlę pętlę sprzężenia zwrotnego w celu aktywacji rodzicielskiego mRNA in cis i aktywacji wielu trans-kodowanych mRNA w tym samym szlaku. Wyłączenie tego wzajemnego oddziaływania mRNA wpływa na wzrost bakterii, gdy peptydy są jedynym źródłem węgla i azotu. --- Ostatnio opisano transkrypty RNA regionu Y determinującego płeć (Sry) i białka transkrypty RNA związane z degeneracją móżdżku 1 (CDR1as) zostały opisane jako funkcjonować jako nowa klasa posttranskrypcyjnych regulatorowych RNA, które zachowują się jak okrągłe endogenne gąbki RNA dla mikro RNA (miRNA) miR-138 i miR-7, odpowiednio. Szczególną cechą genu Sry jest jego zdolność do generowania liniowych i kolistych transkryptów, oba transkrybowane w orientacji sensownej. Tutaj zauważamy, że zarówno transkrypty sensowne (np. Sry RNA), jak i antysensowne (np. CDR1as) mogą kolistyfikować i zachowywać się jak gąbki miRNA, a co ważne, że również segmenty mRNA kodujące białka mogą również pełnić tę rolę. Tak więc, rozsądne jest rozsądnie sądzić, że liniowy transkrypt Sry sense może dodatkowo działać jako gąbka miRNA lub jako endogenny konkurencyjny RNA dla miR-138.
Jaka jest główna funkcja "gąbek RNA"?
Naturalne kręgi RNA funkcjonują jako wydajne gąbki mikroRNA. Ostatnio wykazano, że na aktywność miRNA wpływa obecność transkryptów gąbki miRNA, tak zwanego konkurującego endogennego RNA u ludzi i mimikry docelowej u roślin.