TŁO: Liczne badania wykorzystały mikromacierze do identyfikacji sygnatur genów do przewidywania wyników klinicznych pacjentów z rakiem i odpowiedzi na chemioterapię. Jednak potencjalny wpływ profilowania ekspresji genów w diagnostyce raka, rokowaniu i rozwoju spersonalizowanego leczenia może nie być w pełni wykorzystany ze względu na brak zgodnych sygnatur genów i słabe zrozumienie mechanizmów molekularnych mechanizmów molekularnych. METODY: Opracowaliśmy nowatorskie podejście do uzyskiwania sygnatur genów dla prognozowania raka piersi w kontekście znanych szlaków biologicznych. Korzystając z nienadzorowanych metod, pacjentki z rakiem zostały podzielone na odrębne grupy na podstawie wzorców ekspresji genów w jednej z następujących ścieżek wzorce ekspresji w jednym z następujących szlaków: apoptoza, cykl komórkowy, angiogeneza, przerzuty, p53, naprawa DNA i kilka szlaków sygnałowych, w tym w tym chemokiny, EGF, FGF, HIF, kinaza MAP, JAK i NF-kappaB. NF-kappaB. Prawdopodobieństwo przeżycia zostało następnie porównane między grupami pacjentów w celu ustalenia, czy zróżnicowana ekspresja genów w określonym szlaku jest skorelowana z różną przeżywalnością. WYNIKI: Nasze wyniki ujawniły, że ekspresja genów cyklu komórkowego jest silnie predykcyjna dla wyników leczenia raka piersi. Potwierdziliśmy tę obserwację poprzez budując model sygnatur genów cyklu komórkowego przy użyciu metod nadzorowanych. Zweryfikowano w wielu niezależnych zestawach danych, sygnatura genów cyklu komórkowego jest bardziej dokładniejszym predyktorem wyników klinicznych raka piersi niż wcześniej zidentyfikowana sygnatura 70 genów Amsterdamu, która została opracowana w zatwierdzonym przez FDA zatwierdzony przez FDA test kliniczny MammaPrint. WNIOSEK: Podsumowując, opracowany przez nas model sygnatury ekspresji genów z dobrze zdefiniowanych ścieżek jest nie tylko konsekwentnie silnym prognostykiem ale także mechanistycznie powiązany z biologią raka. Nasze podejście stanowi alternatywę dla obecnej metodologii identyfikacji markerów ekspresji genów dla prognozowania raka i odpowiedzi na leki przy użyciu ekspresji genów całego genomu dane. --- Seria wielogenowych klasyfikatorów, testów prognostycznych i predykcyjnych została niedawno jako potencjalnie użyteczne narzędzia wspomagające leczenie niedawno zdiagnozowanych pacjentek z rakiem piersi. zdiagnozowanych pacjentek z rakiem piersi. Testy te wykorzystują zarówno metody oparte na slajdach w tym immunohistochemię i fluorescencyjną hybrydyzację in situ oraz platformy molekularne, w tym ilościową multipleksową reakcję łańcuchową polimerazy reakcję łańcuchową polimerazy w czasie rzeczywistym i profilowanie mikromacierzy genomowych. W niniejszym przeglądzie, seria częściowo i całkowicie skomercjalizowanych testów wielogenowych jest porównano ze standardowymi zmiennymi kliniczno-patologicznymi raka piersi i biomarkerami i biomarkerami oraz ocenione pod kątem poziomu ich naukowej walidacji, bieżącej użyteczności klinicznej, statusu zatwierdzenia przez organy regulacyjne oraz szacowanych kosztów i korzyści. A Porównanie testów Oncotype Dx i MammaPrint wskazuje, że test Oncotype Dx ma zalety w postaci wcześniejszego wprowadzenia na rynek w USA, szerokiej akceptacja płatności przez płatników zewnętrznych, łatwość użycia utrwalonych w formalinie tkanek utrwalonych w formalinie tkanek zatopionych w parafinie, zalecenie gotowości do użycia przez American Society of Clinical Oncology Breast Cancer Tumor Markers Update Committee, a także algorytm ciągły, a nie dychotomiczny, uwzględnienie zarówno receptora estrogenowego receptora estrogenowego (ER) i receptora 2 ludzkiego naskórkowego czynnika wzrostu w profilu mRNA, zdolność do służenia zarówno jako test prognostyczny, jak i predykcyjny dla niektórych hormonalnych i chemioterapeutycznych, wykazana efektywność kosztowa w 1 opublikowanym badaniu, a także wysoki wskaźnik naboru do prospektywnego badania klinicznego (Trial Assigning Individualized Options for Treatment Rx). Test MammaPrint ma zalety w postaci zatwierdzenia 510(k) przez amerykańską Agencję ds. Food and Drug Administration, większej liczby genów, co może zwiększyć jego użyteczność, oraz potencjalnie szerszy zakres kwalifikowalności pacjentów, w tym węzły chłonne dodatnie, ER-ujemne i młodsze pacjentki włączane do prospektywnego badania (the Microarray in Node-negative Disease may Avoid ChemoTherapy). Szereg innych testów ma określone cele predykcyjne, które najczęściej koncentrują się na skuteczności tamoksyfenu u pacjentek ER-dodatnich, takich jak test stosunku dwóch genów i test Test genotypowania cytochromu P450 CYP2D6. --- W ciągu ostatnich 5 lat wiele skomercjalizowanych wielogenowych testów prognostycznych i i predykcyjnych weszło w złożony i rozwijający się krajobraz diagnostyki towarzyszącej raka piersi. diagnostyki towarzyszącej raka piersi. Testy te wykorzystywały różne formaty, począwszy od od znanych testów opartych na slajdach immunohistochemii i fluorescencji in hybrydyzacji in situ do platform molekularnych nie opartych na morfologii, takich jak ilościową multipleksową reakcję łańcuchową polimerazy w czasie rzeczywistym i profilowanie mikromacierzy genomowych. profilowanie mikromacierzy. W niniejszym przeglądzie oceniono 14 testów wielogenowych pod kątem ich naukowej walidacji, bieżącej użyteczności klinicznej, statusu zatwierdzenia regulacyjnego i szacowanego stosunku kosztów do korzyści. Nacisk położono na dwa testy: oncotype DX i MammaPrint. Obecne dowody wskazują, że test oncotype DX ma zalety wcześniejszego wprowadzenia na rynek, szerokiej akceptacji płatności przez płatników zewnętrznych w USA, łatwość użycia utrwalonych w formalinie tkanek zatopionych w parafinie. tkanek, niedawne umieszczenie na liście American Society of Clinical Oncology Breast Cancer Tumor Markers Update Committee jako zalecany do stosowania, ciągły algorytm systemu oceny algorytm systemu, możliwość służenia zarówno jako test prognostyczny, jak i test predykcyjny dla niektórych środków hormonalnych i chemioterapeutycznych, wykazana efektywność kosztową w jednym opublikowanym badaniu oraz wysoki wskaźnik naboru do prospektywnego badania klinicznego (Trial Assigning Individualized Options for Treatment). for Treatment). Zaletą testu MammaPrint jest zatwierdzenie 510(k) przez przez Amerykańską Agencję ds. Żywności i Leków, większą liczbę genów, co może zwiększyć użyteczność i potencjalnie szerszy zakres kwalifikowalności pacjentek, w tym pacjentki węzłów chłonnych, receptor estrogenowy (ER) - ujemny i młodsze pacjentki, które są do prospektywnego badania (Microarray in Node-Negative Disease May uniknąć chemioterapii). Wiele innych testów ma określone cele predykcyjne które najczęściej koncentrują się na skuteczności tamoksyfenu u pacjentek ER-dodatnich. takich jak test stosunku dwóch genów i test genotypowania cytochromu P450 CYP2D6. test genotypowania. --- Testy ekspresji genów, które są stosowane w codziennej praktyce klinicznej w leczeniu pacjentów z wczesnym rakiem piersi wczesnego raka piersi zostały wprowadzone do klinik dopiero niedawno. W niniejszym przeglądzie omówiono rozwój tych macierzy, podsumowano walidację tych, które są dostępne komercyjnie i wskazano, w jaki sposób informacje tych, które są dostępne komercyjnie i wskazuje, w jaki sposób informacje dostarczane przez te testy mogą pomóc w opiece nad pacjentami. Przegląd zawiera również zapewnia również obszerny przegląd dostępnych na rynku testów, koncentrując się na MammaPrint, pierwszy i jedyny test do leczenia raka piersi, który został zatwierdzony przez FDA. zatwierdzony przez FDA. --- Jak biologia molekularna może poprawić zarządzanie kliniczne: doświadczenie MammaPrint doświadczenie.
Czy Mammaprint został zatwierdzony przez amerykańską Agencję Żywności i Leków?
Tak, Mammaprint został zatwierdzony przez amerykańską Agencję Żywności i Leków.