Jaka jest zasada działania techniki ATAC (Assay for Transposase-Accessible Chromatin)?
ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin) to test na chromatynę dostępną dla transpozazy przy użyciu sekwencjonowania, oparty na bezpośredniej transpozycji in vitro adaptorów sekwencjonowania do natywnej chromatyny. ATAC jest szybką i czułą metodą integracyjnej analizy epigenomicznej. ATAC-seq rejestruje miejsca otwartej chromatyny przy użyciu prostego dwuetapowego protokołu z 500-50 000 komórek i ujawnia wzajemne oddziaływanie między genomowymi lokalizacjami otwartej chromatyny, białkami wiążącymi DNA, poszczególnymi nukleosomami i zagęszczeniem chromatyny z rozdzielczością nukleotydów.