Zmiany w stanie metylacji DNA w komórkach nowotworowych charakteryzują się hipermetylacją promotorowych wysp CpG i rozproszoną hipometylacją genomową. Alu i długi element nukleotydowy-1 (LINE-1) są niekodującymi sekwencjami powtarzalnymi genomu, a metylacja powtarzalne sekwencje genomowe, a metylacja tych elementów może być stosowana jako zastępczy marker stanu metylacji w całym genomie. Niniejsze badanie zostało zaprojektowane w celu ocenić zmiany hipometylacji Alu i LINE-1 podczas raka piersi raka piersi od zmian prawidłowych do przedinwazyjnych i inwazyjnego raka piersi (IBC) oraz ich związku z charakterystyką IBC. Przeanalizowaliśmy stan metylacji Alu i LINE-1 w 145 przypadkach próbek piersi, w tym prawidłową tkankę piersi, atypową hiperplazję przewodową / atypię nabłonka płaskiego (ADH/FEA), raka przewodowego in situ (DCIS) i IBC, a także w innym zestawie 129 przypadków IBC za pomocą pirosekwencjonowania. Metylacja Alu nie wykazała znaczących zmian podczas wieloetapowej progresji raka piersi, chociaż miała tendencję do zmniejszania się podczas z DCIS do IBC. W przeciwieństwie do tego, metylacja LINE-1 znacząco zmniejszyła się z normalnej do ADH/FEA, podczas gdy była podobna w ADH/FEA, DCIS i IBC. W IBC hipometylacja Alu korelowała z ujemnym statusem receptora estrogenowego (ER), a hipometylacja LINE-1 a hipometylacja LINE-1 była związana z ujemnym statusem ER, amplifikacją ERBB2 (HER2) i nadekspresją p53. Status metylacji Alu i LINE-1 był znacząco różny między podtypami raka piersi, a podtyp wzbogacony o HER2 miał najniższe poziomy metylacji. W analizach przeżycia niski stan metylacji Alu miał tendencję do wiązania się ze słabym przeżyciem wolnym od choroby pacjentek. pacjentów. Nasze odkrycia sugerują, że hipometylacja LINE-1 jest wczesnym zdarzeniem a hipometylacja Alu jest prawdopodobnie późnym zdarzeniem podczas progresji raka piersi. progresji raka piersi, a znacząca hipometylacja Alu i LINE-1 w podtypie wzbogaconym o HER2 może być związana z niestabilnością chromosomalną tego specyficznego podtypu.
Czy hipometylacja Alu jest związana z rakiem piersi?
Tak, stwierdzono, że elementy Alu są hipometylowane w raku piersi, szczególnie w podtypie wzbogaconym o HER2. Co więcej, hipometylacja Alu została zidentyfikowana jako późne zdarzenie podczas progresji raka piersi, a w inwazyjnym raku piersi była związana z ujemnym statusem receptora estrogenowego i słabym przeżyciem pacjentów bez choroby.