Które narzędzie jest używane do eksploracji promotoromu przy użyciu danych CAGE?
Pomimo wysokiej rozdzielczości i znaczenia funkcjonalnego, opublikowane dane CAGE są nadal niedostatecznie wykorzystywane w analizie promotorów ze względu na brak narzędzi umożliwiających ich efektywną manipulację i integrację z innymi typami danych genomowych. CAGEr to implementacja w języku R nowatorskich metod analizy zróżnicowanego wykorzystania TSS i dynamiki promotorów, zintegrowana z przetwarzaniem danych CAGE i eksploracją promotorów w pierwszym kompleksowym zestawie narzędzi CAGE na wspólnej platformie analitycznej.