Wykorzystaliśmy genotypowanie SNP o wysokiej rozdzielczości, aby zidentyfikować regiony wzmocnienia i utraty genomu w genomach 212 rdzeniaków, złośliwych dziecięcych guzów mózgu. Znaleźliśmy ogniskowe amplifikacje 15 znanych onkogenów i ogniskowe delecje 20 znanych genów supresorowych nowotworów. znanych genów supresorowych nowotworów (TSG), z których większość nie była wcześniej związana ze medulloblastoma. W szczególności zidentyfikowaliśmy nieznane wcześniej amplifikacje i homozygotyczne delecje, w tym powtarzające się, wzajemnie wykluczające się, wysoce ogniskowe genetyczne w genach ukierunkowanych na metylację lizyny histonowej, w szczególności histonu histonu 3, lizyny 9 (H3K9). Potranslacyjna modyfikacja białek histonowych białek histonowych ma kluczowe znaczenie dla regulacji ekspresji genów, może uczestniczyć w określaniu losów komórek macierzystych i ma związek z kancerogenezą. Zgodnie z naszymi danymi genetycznymi, przywrócenie ekspresji genów kontrolujących metylację H3K9 znacznie zmniejsza proliferację rdzeniaka zarodkowego in vitro. Aberracje liczby kopii genów odgrywających krytyczną rolę w pisaniu, czytaniu, usuwaniu i blokowaniu stanu metylacji lizyny histonowej, szczególnie przy H3K9, sugerują, że wadliwa kontrola kodu histonowego przyczynia się do patogenezy rdzeniaka zarodkowego.
Jakie jest znaczenie metylacji lizyny histonów w medulloblastoma?
Wykazano, że nieprawidłowe wzorce metylacji lizyny histonów H3K4, H3K9 i H3K27 skutkują zmianami kodu histonów, które indukują zmiany w ekspresji genów i wpływają na szybkość proliferacji komórek rdzeniaka.