Analizujemy minisatelity pochodzące z fragmentów Alu odpowiadających w przybliżeniu pierwszym 44 zasadom ludzkich sekwencji konsensusowych Alu z różnych podrodzin podrodzin. Pochodzenie minisatelitów pochodzących od Alu wydaje się być przez krótkie flankujące powtórzenia, jak po raz pierwszy zaproponowali Haber i Louis [Haber, J.E., Louis, E.J., 1998. Pochodzenie minisatelitów u drożdży i ludzi. Genomics 48, 132-135.]. Przedstawiamy również dowody na substytucje zasad i delecje wprowadzonych do minisatelitów przez konwersję genów z częściowo podobnymi, ale niepowiązanymi regionami flankującymi. Segmenty otoczone krótkimi bezpośrednimi powtórzeniami są stosunkowo powszechne w różnych regionach Alu i innych sekwencji powtarzalnych. Nasza analiza pokazuje, że mogą one być skutecznie wykorzystywane w badaniach porównawczych kontekstu sekwencji, który może przyczyniać się do niestabilności segmentów DNA otoczonych krótkimi bezpośrednimi powtórzeniami. --- Określiliśmy sekwencje amplifikowanych metodą PCR elementów B1 od chomika i szczura (Myomorpha), wiewiórki (Sciuromorpha) i świnki morskiej (Caviomorpha). Pomiędzy znaleziono od trzech do sześciu podrodzin B1 u tych gatunków. W analizie filogenetycznej analizy B1 sekwencje chomika, myszy i szczura grupowały się oddzielnie od tych wiewiórki i świnki morskiej. Jest to zgodne z niezależną ewolucją elementów B1 w oddzielnych liniach gryzoni. Wykluczamy możliwość konwergentnych mutacji w celu wyjaśnienia niektórych cech diagnostycznych w obrębie współczesnych quasi-dimerów B1 i postrzegamy te elementy jako struktury mozaikowe łączące wcześniej istniejących mutacji. Ponadto obecność motywów strukturalnych podobnych do Alu wspiera hipotezę monofiletycznego pochodzenia powtórzeń Alu i B1, tj, ze wspólnego retropozycyjnego elementu monomerycznego pochodzącego z 7SL RNA. --- Sekwencje Alu są często spotykane podczas badania ludzkiego genomowego kwasu nukleinowego i stanowią główny składnik powtarzalnego DNA. Niniejszy przegląd opisuje pochodzenie sekwencji Alu oraz ich późniejszą amplifikację i ewolucję do różne podrodziny. W ostatnich latach opisano wiele różnych funkcjonalnych ról sekwencji Alu. Sekwencje Alu zostały opisane. Wieloraki wpływ sekwencji Alu na ekspresję genów za pośrednictwem polimerazy RNA II i obecność sekwencji Alu w omówiono obecność sekwencji Alu w transkryptach generowanych przez polimerazę RNA III.
Z której sekwencji pochodzi powtórzenie Alu?
Obecność motywów strukturalnych podobnych do Alu wspiera hipotezę o monofiletycznym pochodzeniu powtórzeń Alu i B1, tj. ze wspólnego 7SL RNA pochodzącego z retropozycji monomerycznego elementu, Pochodzenie podrodzin Alu w populacjach ludzkich może być związane z ewolucją chromosomu Y.