As with the INTERREG III programmes in the EU, and on the basis of the territorial objective of the Structural Funds, the Regions of Knowledge programme must also incorporate solutions to cross-border hindrances and mechanisms to encourage cross-border regional co-operation in the research area, independently of whether the actions fall under a convergence or regional competitiveness objective.
Saskaņā ar Interreg III programmām Eiropas Savienībā un, pamatojoties uz struktūrfondu teritoriālo mērķi, programmai „Zināšanu reģioni” jāietver arī risinājumi pārrobežu šķēršļu novēršanai un mehānismi, lai sekmētu pārrobežu reģionālo sadarbību pētniecības jomā neatkarīgi no tā, vai tas ir konverģences vai reģionālās konkurētspējas mērķis.