Concerning the financial management of the Union's own resources, one problem is that this is carried out by the administrations of the Member States (VAT, customs duties), who may fail to collect certain sums because a taxpayer is going through financial difficulties or because the amounts involved are minimal or do not compensate the risks and costs of collection by the authorities.
Viena no Kopienas līdzekļu finanšu vadības no problēmām ir tā, ka to īsteno dalībvalstu pārvaldes (PVN, muitas nodevas), kas var neiekasēt zināmas summas, jo nodokļu maksātājam šobrīd ir finansiālas grūtības, vai arī attiecīgās summas ir minimālas, vai nekompensē riskus un izmaksas, kādi, tās iekasējot, rodas varas iestādēm.