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반면에 분자동역학은 first-principle에 비하여 화학적 구조를 정확하게 관찰하지는 못하지만 보다 상대적으로 큰 스케일의 근사화된 해석을 수행할 수 있기 때문에 다양한 연구에 활용되고 있다.
一方、分子動力学はfirst-principleに比べて、化学的構造を正確に観察することはできないが、より相対的に大きいスケールの近似化された解釈を遂行できるため、多様な研究に活用されている。