COMPOSITIONS FOR THE DETECTION AND TREATMENT OF COLORECTAL CANCERThe invention provides methods of identifying proteins and polypeptides and their cognate polynucleotides that are expressed by cells under one environmental condition and not under a second environmental condition. The invention also provides compositions for the treatment and detection of cancer, including colorectal cancer.A method of detecting cancer or a predisposition to developing cancer in a subject, comprising determining an expression level of a cancer-associated protein, polypeptide or polynucleotide selected from the group consisting of myeloblastin precursor (e.g., SEQ ID NO:29); Titin; HBAl; Insulin-like growth factor 1 receptor (IGFlR); Isoform 3 of zonadhesin precursor; latent transforming growth factor beta binding protein 4 (LTBP4); ASXLl (additional sex combs like 1); beta globin (HBB); BMP15-bone morphogenetic protein; TRIM49; DNAJ homolog subfamily B member 11 precursor; uncharacterized hematopoietic stem/progenitor cells protein MDS027; uncharacterized protein ALB; isoform 3 of sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1 precursor; isoform 2 of peripherin; mitochondrial 28S ribosomal protein S22; translation initiation factor EIF-2B subunit epsilon; estradiol 17-beta-dehydrogenase 1; XRCC6BP1; brain-specific angiogenesis inhibitor 1 precursor; isoform 2 of ring finger and CCCH-type zinc finger domain-containing protein 2; hemoglobin subunit beta; isoform 1 of far upstream element- binding protein 1; GALECTIN-3; lysozyme C precursor; actin, alpha skeletal muscle; isoform M2 of pyruvate kinase isozymes M1/M2; AGR2; neutrophil defensin 1 precursor; uncharacterized protein PSME2; tubulin beta-2C chain; thiosulfate sulfurtransferase; heat shock 70 kDa protein 1; Ig kappa chain V-III region sie; macrophage migration inhibitory factor; isoform 1 of ATP synthase subunit D, mitochondrial; uncharacterized protein ENSP00000374051; isocitrate dehydrogenase [NADP] cytoplasmic; hemoglobin subunit delta; isoform 1 of splicing factor, arginine/serine-rich 7; isoform 1 of mRNA-capping enzyme; LON protease homolog, mitochondrial precursor; signal recognition particle 54 kDa protein; isoform long of galectin-9; integrin-linked protein kinase; bifunctional aminoacyl- tRNA synthetase; isoform 1 of zinc finger protein 207; inorganic pyrophosphatase; calponin- 2; isoform 1 of muscleblind-like protein 3; cathepsin G precursor; zinc finger and BTB domain-containing protein 34; adenine phosphoribosyltransferase; 4OS ribosomal protein S9; TALIN-I; leucine-rich repeat-containing protein 59; ATP synthase subunit alpha, mitochondrial precursor; isoform 7 of protein transport protein SEC31A; dihydroxyacetone kinase; protein similar to heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2 (HNRNP Cl/HNRNP C2) isoform 4; 18 kDa protein (e.g., UNIPARC Accession Number IPI00796554; cold agglutinin FS-I L-chain; isoform 1 of heterogeneous nuclear ribonucleoprotein dθ; DAZAP 1/MEF2D fusion protein; POTE2; Keratin 18 (KRT 18); PSME4 Isoform 1 of Proteasome activator complex subunit; Mitogen-activated protein kinase-activated protein kinase(MAPKAPK33); Complement component 1, s subcomponent (CIS); Lysozyme C precursor (LYZ); Keritin Type Cytoskeletal 20 (KRT20); RNASE3; Aldehyde dehydrogenase X, mitochondrial precursor (ALDHlBl); CDNA FLJ25506 fis, clone CBR05185; Isoform B of fϊbulin-1 precursor (FBLNl); Nucleobindin 1 (NUCBl); Histone cluster 2, H2ba (HIST2H2BA); Tripartite motif-containing 28 (TRIM28); Peroxisomal D3, D2 enoyl-CoA isomerase (PECI); Peptidylprolyl isomerase B (PPIB); Similar to 4OS ribosomal protein S 17; Eukaryotic translation elongation factor 1 gamma (EEFlG); Keratin 8 (KRT8); Fibulin 2 (FBLN2); VIM; Fibrinogen alpha chain (FGA); Annexin A2 (ANXA2); H2A histone family, member J (H2AFJ); Actin alpha, cardiac muscle 1 (ACTCl); Keratin 19 (KRT 19); Immunoglobin lambda locus (IGL@protein); Immunoglobulin heavy constant mu (IGHM); EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1 (EFEMPl); Tripartite motif-containing protein 34; Isoform 3 of APl-subunit Gamma Binding Protein 1; Proflin-1; Histone H4; Hemoglobin subunit alpha; Transgelin); Lumican precursor; Hemoglobin Beta; Fibrinogen Beta Chain Precursor; Immunoglobulin kappa constant (IGKC); Uncharacterized Protein ALB; ApoAl; C4A; C3 187 kDa protein; Actin, Cytoplasmic 1 (actin beta); Hemoglobin beta; Hemoglobin subunit alpha; POTE-2 alpha actin; SLC4A10; Ribonuclease P Protein Subunit P20 (POP7); Nuclear RNA export factor 1 (NXFl); UVEAL Autoantigen With Coiled-Coil Domains And Ankyrin Repeats, UACA; Uncharacterized Protein C13ORF27; Isoform 3 of Sushi, Nidogen And EGF-Like Domain-Containing Protein 1 Precursor; Isoform 1 Of Dynein Heavy Chain 10, Axonemal (DNAHlO); Gap junction alpha-1 protein (GJAl /Connexion 43); Isoform 1 Of Kinesin-Like Protein KIF25 (KIF25); GAPDH- Glyceraldehyde-3 -Phosphate Dehydrogenase; Uncharacterized Protein ALB; Galectin-3, LGALS3; Similar to NAC -Alpha Domain- Containing Protein 1 (NACAD); Acetyl-CoA Acetyltransferase, Mitochondrial , ACATl; KH-Type Splicing Regulatory Protein, FUBP2; Profilin 1 (PFNl); Chloride Intracellular Channel Protein 1, CLICl; Zinc Finger Protein 831; Endoplasmin; Ribosomal Protein SlO (RPSlO); Splicing Factor, Arginine/Serine-Rich 3; ACTA2 Protein ( alpha actin, smooth muscle); Isoform 1 of Sodium Chann...
결장직장암의 검출 및 치료를 위한 조성물본원 발명은 한 환경 조건하에서 세포에 의해 발현되나 제 2 환경 조건하에서 세포에 의해 발현되지 않는 단백질, 폴리펩티드 및 이들의 동족 폴리뉴클레오티드를 확인하는 방법을 제공한다. 본원 발명은 또한 결장직장암을 포함하는, 암의 치료 및 검출을 위한 조성물을 제공한다.피검체에서 암 또는 암 발생에 대한 소인(predisposition)을 검출하는 방법으로서, 상기 피검체로부터의 생물학적 샘플 중의 하기한 것들로 구성된 군에서 선택된 암 관련 단백질, 폴리펩티드 또는 폴리뉴클레오티드, 또는 이들의 임의의 조합물의 발현 수준을 측정하는 단계를 포함하며, 대조 샘플과 비교할 때 상기 생물학적 샘플 중의 상기 암 관련 단백질, 폴리펩티드, 또는 폴리뉴클레오티드의 발현 수준의 증가가 상기 피검체가 암을 지니거나 암 발단에 대한 소인을 지님을 나타내는, 암 또는 암 발생에 대한 소인을 검출하는 방법: 미엘로블라스틴 전구체(예를 들어, SEQ ID NO: 29); 티틴; HBA1; 인슐린-유사 성장인자 1 수용체(IGF1R); 존어드헤신(zonadhesin) 전구체의 이소형 3; 잠복 변형성장인자 베타 결합 단백질 4(latent transforming growth factor beta binding 4, LTBP4); ASXL1(additional sex combs like 1); 베타 글로빈(HBB); BMP15-골형성단백질; TRIM49; DNAJ 상동체 서브패밀리 B 일원 11 전구체; 특성불규명된(uncharacterized) 조혈 줄기/선조 세포 단백질 MDS027; 특성불규명된 단백질 ALB; 스시, 니도젠 및 EGF-유사 도메인 함유 단백질 1 전구체의 이소형 3; 페리페린(peripherin)의 이소형 2; 미토콘드리아 28S 리보좀 단백질 S22; 번역 개시 인자 EIF-2B 서브유닛 엡실론; 에스트라디올 17-베타-탈수소효소 1; XRCC6BP1; 뇌-특이적 혈관신생 억제자 1 전구체; 링 핑거 및 CCCH-형 징크 핑거 도메인-함유 단백질 2의 이소형 2; 헤모글로빈 서브유닛 베타; 파 업스트림 엘리먼트-결합 단백질 1의 이소형 1; 갈렉틴-3; 리소자임 C 전구체; 액틴, 알파 골격근; 피루베이트 키나아제 이소자임 M1/M2의 이소형 M2; AGR2; 뉴트로필 디펜신 1 전구체; 특성불규명된 단백질 PSME2; 튜불린 베타-2C 쇄(chain); 티오설페이트 설퍼전이효소; 열 충격 70 kDa 단백질 1; Ig 카파 쇄 V-III 영역 sie; 대식세포 이동 억제 인자; 미토콘드리아의, ATP 합성효소 서브유닛 D의 이소형 1; 특성불규명된 단백질 ENSP00000374051; 세포질의 이소시트레이트 탈수소효소[NADP]; 헤모글로빈 서브유닛 델타; 스플라이싱 인자의 이소형 1, 아르기닌/세린-풍부 7; mRNA-캡핑 효소의 이소형 1; LON 프로테아제 상동체, 미토콘드리아 전구체; 신호 인식 입자 54 kDa 단백질; 갈렉틴-9의 긴 이소형; 인테그린-연결 단백질 키나아제; 이작용성 아미노아실-tRNA 합성효소; 징크 핑거 단백질 207의 이소형 1; 무기 피로포스파타아제; 칼포닌-2; 머슬블라인드(muscleblind)-유사 단백질 3의 이소형 1; 카텝신 G 전구체; 징크 핑거 및 BTB 도메인-함유 단백질 34; 아데닌 포스포리보실전이효소; 4OS 리보좀 단백질 S9; TALIN-1; 류신-풍부 반복부-함유 단백질 59; ATP 합성효소 서브유닛 알파, 미토콘드리아 전구체; 단백질 수송 단백질 SEC31A의 이소형 7; 디히드록시아세톤 키나아제; 이종성 핵 리보핵단백질 C1/C2(HNRNP C1/HNRNP C2) 이소형 4과 유사한 단백질; 18 kDa 단백질(예를 들어, UNIPARC 접근 번호 IPI00796554; 한랭 응집소 FS-I L-쇄; 이종성 핵 리보핵단백질 d0의 이소형 1; DAZAP1/MEF2D 융합 단백질; POTE2; 케라틴 18(KRT 18); 프로테아좀 활성자 복합체 서브유닛의 PSME4 이소형 1; 마이토젠-활성화 단백질 키나아제-활성화 단백질 키나아제(MAPKAPK33); 보체 구성성분 1, s 부구성성분(CIS); 리소자임 C 전구체(LYZ); 케리틴 형 사이토스켈레탈 20(KRT20); RNASE3; 알데히드 탈수소효소 X, 미토콘드리아 전구체(ALDH1B1); CDNA FLJ25506 fis, 클론 CBR05185; 피불린-1 전구체(FBLN1)의 이소형 B; 뉴클레오빈딘 1(NUCB1); 히스톤 클러스터 2, H2ba(HIST2H2BA); 트리파타이트 모티프-함유 28(TRIM28); 퍼옥시좀의 D3, D2 엔오일-CoA 이소머라아제(PECI); 펩티딜프롤릴 이소머라아제 B(PPIB); 4OS 리보좀 단백질 S17과 유사한 단백질; 진핵생물 번역 신장 인자 1 감마(EEF1G); 케라틴 8(KRT8); 피불린 2(FBLN2); VIM; 피브리노겐 알파 쇄(FGA); 아넥신 A2(ANXA2); H2A 히스톤 패밀리, 일원 J(H2AFJ); 액틴 알파, 심근 1(ACTC1); 케라틴 19(KRT 19); 면역글로불린 람다 로커스(IGL@Protein); 면역글로불린 중쇄 불변 뮤(mu)(IGHM); EGF-함유 피불린-유사 세포외 매트릭스 단백질 1(EFEMP1); 트리파타이트 모티프-함유 단백질 34; AP1-서브유닛 감마 결합 단백질 1의 이소형 3; 프로플린-1; 히스톤 H4; 헤모글로빈 서브유닛 알파; 트랜스젤린); 루미칸 전구체; 헤모글로빈 베타; 피브리노겐 베타 쇄 전구체; 면역글로불린 카파 불변(IGKC) 영역; 특성불규명된 단백질 ALB; ApoA1; C4A; C3 187 kDa 단백질; 액틴, 세포질 1(액틴 베타); 헤모글로빈 베타; 헤모글로빈 서브유닛 알파; POTE-2 알파 액틴; SLC4A10; 리보뉴클레아제 P 단백질 서브유닛 P20(POP7); 핵 RNA 이출 인자 1(NXF1); 꼬인-코일 도메인과 안키린 반복부를 지니는 UVEAL 자가유래 항원, UACA; 특성불규명된 단백질 C13ORF27; 스시, 니도젠 및 EGF-유사 도메인 함유 단백질 1 전구체의 이소형 3; 악소임(Axonemal)의 다이네인(Dynein) 중쇄 10(DNAHlO)의 이소형 1; 갭 접합 알파-1 단백질(GJA1/Connexion 43); 키네신-유사 단백질 KIF25(KIF25)의 이소형 1; GAPDH-글리세르알데히드-3-인산탈수소효소; 특성불규명된 단백질 ALB; 갈렉틴-3, LGALS3; NAC-알파 도메인-함유 단백질 1(NACAD)과 유사한 단백질; 미토콘드리아의, 아세틸-CoA 아세틸기전이효소, ACAT1; KH-형 스플라이싱 조절 단백질, FUBP2; 프로필린 1(PFN1); 클로라이드 세포내 채널 단백질 1, CLIC1; 징크 핑거 단백질 831; 엔도플라스민; 리보좀 단백질 S10(RPS10); 스플라이싱 인자, 아르기닌/세린-풍부 3; ACTA2 단백질(알파 액틴, 평활근); 나트륨 채널 단백질 8형 서브유닛 알파(SCN8A)의 이소형 1; 갈렉틴-9의 긴 이소형; T-복합체 단백질 1 서브유닛 엡실론, CCT5; 폐-특이적, 알파-엔올라아제; 원발-암유전자 세린/트레오닌-단백질 키나아제 MOS; 베타-아듀신(ADD2)의 이소형 1; 아포리포단백질 E(APOE); 유비퀼린-4(UBQLN4)(아탁신-1 유비퀴틴-유사 상호작용 단백질); 수모-컨주게이팅 효소 UB21(효모의 UBC9 상동체); 미오신-15(MYH15); FLJ93091, 호모 사피엔스(HomoSapiens) UMP-CMP 키나아제(UMP-CMPK); 인텔렉틴-1(ITLN1); 아포리포단백질 A-IV(APOA4); 미토콘드리아 피루베이트 탈수소효소(리포아미드) 알파 1(PDHA1); 류신-풍부 반복부-함유 단백질 59(LRRC59); 60S 리보좀 단백질 L37A(RPL37A); 우리딘-시티딘 키나아제 1-유사 1(UCKL1); 알데히드 탈수소효소 9A1(ALDH9A1); 세포질의, 티오레독신 환원효소 1(TXNRD1)의 이소형 3; 핵 수용체 서브패밀리 2 그룹 E 일원 1(NR2E1); 양이온 채널 정액-관련 단백질 3(CATSPER3); 막통과 EMP24 도메인-함유 단백질 1(TMED1); 단백질 FAM154A(FAM 154A); 및 전사 리프레서 NF-X1(NFX1)의 이소형 1.