Improved amino acid and metabolite biosynthesisBacterial strains that are engineered to increase the production of amino acids, including aspartate-derived amino acids (e.g., methionine, lysine, threonine, isoleucine, and S-adenosylmethionine (S-AM)) and cysteine, and related metabolites are described. The strains can be genetically engineered to harbor one or more nucleic acid molecules (e.g., recombinant nucleic acid molecules) encoding a polypeptide (e.g., a polypeptide that is heterologous or homologous to the host cell) and/or they may be engineered to increase or decrease expression and/or activity of polypeptides (e.g., by mutation of endogenous nucleic acid sequences).Enterobacteriaceae or rod-like stem bacterial type bacterium, it comprises at least a isolated nucleic acid molecule that is selected from down group:(a) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium vitriol abc transport albumin a tp-in conjunction with polypeptide or its functional variant;(b) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium vitriol movement system permease w polypeptide or its functional variant;(c) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium vitriol, thiosulphate movement system permease t polypeptide or its functional variant;(d) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium sulfate adenylyl transferase subunit 1 polypeptide or its functional variant;(e) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium sulfate adenylyl transferase subunit 2 polypeptide or its functional variant;(f) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium adenylylsulfate kinase polypeptide or its functional variant;(g) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium adenosine phosphate phosphoric acid sulfate reduction enzyme polypeptide or its functional variant;(h) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium sulfite reductase α subunit polypeptide or its functional variant;(i) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium sulfite reductase blood polypeptide β-component polypeptide or its functional variant;(j) nucleic acid molecule, it comprises coding bacterium sulfite reductase (nadph), the sequence of flavine polypeptide β subunit polypeptide or its functional variant;(k) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium adenylyl-sulfate reduction enzyme α subunit polypeptide or its functional variant;(l) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium phosphoglycerate dehydrogenase polypeptide or its functional variant;(m) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium phosphoserine transaminase polypeptide or its functional variant;(n) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium phosphoserine phosphatase polypeptide or its functional variant;(o) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterial serine o-transacetylase polypeptide or its functional variant;(p) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium cysteine synthase a polypeptide or its functional variant;(q) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium cysteine synthase b polypeptide or its functional variant;(r) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium abc-type vitamin b12 translocator permease component polypeptide or its functional variant;(s) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium abc-type vitamin b12 translocator adenosine triphosphatase component polypeptide or its functional variant;(t) nucleic acid molecule, it comprises coding bacterium abc-type cobalami/fe 3+the sequence of-siderophore movement system polypeptide or its functional variant; (u) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium adenosyl transferase polypeptide or its functional variant;(v) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium gtp cyclization hydrolase i polypeptide or its functional variant;(w) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium phoa, psia or psif gene product polypeptide or its functional variant;(x) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium dihydroneopterin aldolase polypeptide or its functional variant;(y) nucleic acid molecule, it comprises coding bacterium 7, the sequence of 8-dihydro-6-hydroxymethyl pterine-pyrophosphokinase polypeptide or its functional variant;(z) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium dihydropteroate synthase polypeptide or its functional variant;(aa) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium dihydrofolate synthetase polypeptide or its functional variant;(ab) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium tetrahydrofolate dehydrogenase polypeptide or its functional variant;(ac) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium leaf acyl polyglutamic acid synthetic enzyme polypeptide or its functional variant;(ad) nucleic acid molecule, it comprises coding bacterium methionine(met) (apc translocator superfamily) permease (yjeh) polypeptide of inferring or the sequence of its functional variant;(ae) nucleic acid molecule, it comprises the transcriptional activator polypeptide of coding bacterium mete/h or the sequence of its functional variant;(af) nucleic acid molecule, it comprises the sequence of coding bacterium 6-phosphogluconic dehydrogenase polypeptide or its functional variant;(ag) nucleic acid molecule, it comprises the sequence...
아미노산 및 대사산물의 개선된 생합성 방법본 발명은 아스파르테이트 유래 아미노산(예, 메티오닌, 라이신, 트레오닌, 이소루신 및 S-아데노실메티오닌(S-AM))과 시스테인을 포함한 아미노산과 관련 대사산물의 생산이 증가되도록 조작된 세균 균주에 관한 것이다. 상기 균주는 폴리펩티드(예, 숙주 세포에 이종적이거나 또는 상동적인 폴리펩티드)를 코딩하는 하나 이상의 핵산 분자(예, 재조합 핵산 분자)를 가지도록 유전자 조작될 수 있으며/있거나, 이는 (예, 내인성 핵산 서열의 돌연변이에 의해) 폴리펩티드의 발현 및/또는 활성이 증가 또는 감소되도록 조작될 수 있다. (a) 내지 (bs)로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 분리된 핵산 분자를 포함하는, 장내세균과(enterobacteriaceae) 또는 코리네형 세균(coryneform bacteria): (a) 세균성 설페이트 ABC 트랜스포터 ATP-결합성 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (b) 세균성 설페이트 수송 시스템 퍼미아제 W 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (c) 세균성 설페이트, 티오설페이트 수송 시스템 퍼미아제 T 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (d) 세균성 설페이트 아데닐릴트랜스퍼라제 서브유닛 1 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (e) 세균성 설페이트 아데닐릴트랜스퍼라제 서브유닛 2 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (f) 세균성 아데닐릴설페이트 키나제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (g) 세균성 포스포아데노신 포스포설페이트 리덕타제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (h) 세균성 설파이트 리덕타제 알파 서브유닛 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (i) 세균성 설파이트 리덕타제 헤모폴리펩티드 베타-컴포넌트 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (j) 세균성 설파이트 리덕타제(NADPH), 플라보폴리펩티드 베타 서브유닛 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (k) 세균성 아데닐릴-설페이트 리덕타제 알파 서브유닛 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (l) 세균성 포스포글리세레이트 디하이드로게나제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (m) 세균성 포스포세린 트랜스아미나제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (n) 세균성 포스포세린 포스파타제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (o) 세균성 세린 O-아세틸트랜스퍼라제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (p) 세균성 시스테인 신타제 A 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (q) 세균성 시스테인 신타제 B 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (r) 세균성 ABC-타입 비타민 B12 트랜스포터 퍼미아제 컴포넌트 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (s) 세균성 ABC-타입 비타민 B12 트랜스포터 ATPase 컴포넌트 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (t) 세균성 ABC-타입 코발라민/Fe3+-시데로포어(siderophore) 수송 시스템 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (u) 세균성 아데노실트랜스퍼라제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (v) 세균성 GTP 사이클로하이드롤라제 I 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (w) 세균성 phoA, psiA, 또는 psiF 유전자 산물 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (x) 세균성 디하이드로네오프테린 알돌라제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (y) 세균성 7,8-디하이드로-6-하이드록시메틸프테린-피로포스포키나제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (z) 세균성 디하이드로프테로에이트 신타제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (aa) 세균성 다이하이드로폴레이트 신테타제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (ab) 세균성 다이하이드로폴레이트 리덕타제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (ac) 세균성 폴릴폴리글루타메이트(folypolyglutamate) 신타제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (ad) 추정의 세균성 메티오닌(APC 트랜스포터 슈퍼패밀리) 퍼미아제(YjeH) 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (ae) MetE/H 폴리펩티드의 세균성 전사 활성자 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (af) 세균성 6-포스포글루코네이트 디하이드로게나제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (ag) 세균성 S-메틸메티오닌 호모시스테인 메틸트랜스퍼라제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (ah) 세균성 S-아데노실호모시스테인 하이드롤라제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (ai) 세균성 부위 특이적인 DNA 메틸라제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (aj) 세균성 메티오닌 유출 시스템 단백질(export sytem protein) 1 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (ak) 세균성 메티오닌 유출 시스템 단백질 2 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (al) 세균성 ABC 수송 시스템 ATP-결합성 단백질(MetN) 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (am) 세균성 ABC 수송 시스템 퍼미아제 단백질(MetP) 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (an) 세균성 ABC 수송 시스템 기질-결합성 단백질(MetQ) 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (ao) 세균성 아스파르토키나제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (ap) 세균성 아스파르테이트 세미알데하이드 디하이드로게나제 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (aq) 세균성 호모세린 디하이드로게나제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (ar) 세균성 O-호모세린 아세틸 트랜스퍼라제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (as) 세균성 O-아세틸호모세린 설프하이드릴라제 폴리펩티드를 코딩하는 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (at) 세균성 코발라민-의존성 메티오닌 신타제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (au) 세균성 코발라민-비의존성 메티오닌 신타제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (av) 세균성 호모세린 키나제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (aw) 세균성 메티오닌 아데노실트랜스퍼라제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (ax) 세균성 O-숙시닐호모세린(티오)-라이아제(lyase) 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (ay) 세균성 시스타티오닌 베타-라이아제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (az) 세균성 5,10-메틸렌테트라하이드로폴레이트 리덕타제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (ba) 세균성 디하이드로디피콜리네이트 신타제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (bb) 세균성 피루베이트 카르복실라제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (bc) 세균성 글루타메이트 디하이드로게나제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (bd) 세균성 디아미노피멜레이트 디하이드로게나제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (be) 세균성 메티오닌 및 시스테인 생합성 억제자(McbR) 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (bf) 세균성 라이신 유출자(exporter) 단백질 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (bg) 세균성 포스포에놀피루베이트 카르복시키나제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (bh) 세균성 포스포에놀피루베이트 카르복실라제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (bi) 세균성 글리신 디하이드로게나제(탈카르복시화) 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (bj) 세균성(글리신 절단 시스템에 관여하는) H 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (bk) 세균성 아미노메틸 트랜스퍼라제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (bl) 세균성 디하이드로리포아미드 디하이드로게나제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (bm) 세균성 리포에이트-단백질 리가제(ligase) A 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (bn) 세균성 리포산 신타제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (bo) 세균성 리포일-[아실-캐리어-단백질]-단백질-N-리포일트랜스퍼라제 폴리펩티드 또는 그의 기능적 변이체를 코딩하는 서열을 포함하는, 핵산 분자; (bp) 세균성 프럭토스 1,6 비스포스파타제 폴...