COMPOSITIONS AND METHODS FOR DETECTING HUMAN PAPILLOMAVIRUSProvided are compositions and methods for detecting and/or identifying the genotype of a human papillomavirus (HPV) in a biological sample obtained from a subject in need thereof. Particularly, provided are primers, probes and kits for simultaneously detecting multiple HPV genotypes in a single-tube PCR reaction.A combination of primers and probes for detecting and/or identifying human papillomavirus (hpv) genotypes, wherein the combination of primers and probes comprises one or more sets of primers and probes selected from the group consisting of:(1) a forward primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 1, a reverse primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 2, and a probe comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 37;(2) a forward primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 3, a reverse primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no.4, and a probe comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 38;(3) a forward primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 5, a reverse primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 6, and a probe comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 39;(4) a forward primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 7, a reverse primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 8, and a probe comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 39;(5) a forward primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 9, a reverse primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 10, and a probe comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 39;(6) a forward primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 11, a reverse primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 12, and a probe comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 40;(7) a forward primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 13, a reverse primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 14, and a probe comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 41;(8) a forward primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 15, a reverse primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 16, and a probe comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 42;(9) a forward primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 17, a reverse primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 18, and a probe comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 42;(10) a forward primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucleotide sequence of seq id no. 19, a reverse primer comprising an oligonucleotide sequence at least 85%, at least 90%, at least 95%, or 100% identical to the oligonucl...
인간 유두종바이러스를 검출하기 위한 조성물 및 방법인간 유두종바이러스 (HPV)의 유전자형을 검출 및/또는 식별을 필요로 하는 대상체로부터 수득된 생물학적 샘플에서 인간 유두종바이러스 (HPV)의 유전자형을 검출 및/또는 식별하기 위한 조성물 및 방법을 제공한다. 특히, 단일-튜브 PCR 반응에서 다중 HPV 유전자형을 동시에 검출하기 위한 프라이머, 프로브 및 키트를 제공한다.인간 유두종바이러스 (HPV)의 유전자형을 검출 및/또는 식별하기 위한 프라이머 및 프로브의 조합으로서, 상기 프라이머 및 프로브의 조합은 다음으로 이루어진 군으로부터 선택된 하나 이상의 프라이머 및 프로브의 그룹을 포함하는 것인, 프라이머 및 프로브의 조합:(1) 서열번호 1의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 정방향 프라이머, 서열번호 2의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 역방향 프라이머, 및 서열번호 37의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 프로브;(2) 서열번호 3의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 정방향 프라이머, 서열번호 4의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 역방향 프라이머, 및 서열번호 38의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 프로브;(3) 서열번호 5의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 정방향 프라이머, 서열번호 6의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 역방향 프라이머, 및 서열번호 39의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 프로브;(4) 서열번호 7의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 정방향 프라이머, 서열번호 8의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 역방향 프라이머, 및 서열번호 39의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 프로브;(5) 서열번호 9의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 정방향 프라이머, 서열번호 10의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 역방향 프라이머, 및 서열번호 39의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 프로브;(6) 서열번호 11의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 정방향 프라이머, 서열번호 12의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 역방향 프라이머, 및 서열번호 40의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 프로브;(7) 서열번호 13의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 정방향 프라이머, 서열번호 14의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 역방향 프라이머, 및 서열번호 41의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 프로브;(8) 서열번호 15의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 정방향 프라이머, 서열번호 16의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 역방향 프라이머, 및 서열번호 42의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 프로브;(9) 서열번호 17의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 정방향 프라이머, 서열번호 18의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 역방향 프라이머, 및 서열번호 42의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 프로브;(10) 서열번호 19의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 정방향 프라이머, 서열번호 20의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 역방향 프라이머, 및 서열번호 41의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 프로브;(11) 서열번호 21의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 정방향 프라이머, 서열번호 22의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 역방향 프라이머, 및 서열번호 39의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 프로브;(12) 서열번호 23의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 정방향 프라이머, 서열번호 24의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 역방향 프라이머, 및 서열번호 40의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 프로브;(13) 서열번호 25의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 정방향 프라이머, 서열번호 26의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 역방향 프라이머, 및 서열번호 41의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 프로브;(14) 서열번호 27의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 정방향 프라이머, 서열번호 28의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 역방향 프라이머, 및 서열번호 40의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 프로브;(15) 서열번호 29의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 정방향 프라이머, 서열번호 30의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 역방향 프라이머, 및 서열번호 40의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 프로브;(16) 서열번호 33의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 정방향 프라이머, 서열번호 34의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 역방향 프라이머, 및 서열번호 44의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 프로브;(17) 서열번호 35의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 정방향 프라이머, 서열번호 36의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 역방향 프라이머, 및 서열번호 45의 서열에 대해 85 %, 90 %, 95 % 또는 100 % 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 프로브; 및 이들의 임의의 조합.