Aonde já trabalhou sob o comando do presidente José Luis Roca, Villar foi eleito seu sucessor em 1988, e ficou no cargo por duas décadas seguintes, sendo responsável pelo título da Espanha no Campeonato Europeu de Futebol de 2008.Villar também ocupou vários cargos da UEFA e também da FIFA, a ser nomeado vice-presidente das organizações, respectivamente em 1992 e 2002.