No cpDNA, existem vários gradientes de desaminação A → G. O DNA se torna suscetível a eventos de desaminação quando é de cadeia simples. Quando os garfos de replicação se formam, o fio que não está sendo copiado tem um fio simples e, portanto, corre o risco de desaminação A → G. Portanto, os gradientes em desaminação indicam que os garfos de replicação provavelmente estavam presentes e a direção em que foram abertos inicialmente (o gradiente mais alto provavelmente está mais próximo do local de início, porque ficou em uma única fita por um longo período de tempo). Esse mecanismo ainda é a teoria principal hoje; no entanto, uma segunda teoria sugere que a maioria do cpDNA é na verdade linear e se replica por recombinação homóloga. Além disso, afirma que apenas uma minoria do material genético é mantida em cromossomos circulares, enquanto o restante está em estruturas ramificadas, lineares ou outras estruturas complexas.
Como a teoria secundária diz que a maioria dos cpDNA está estruturada?
linear