Bovenburen ligt net ten noordwesten van het dorp Koudum, waar het ook onder valt. De plaatsnaam zou ook afgeleid zijn van het feit dat het ook ten noorden, dus boven Koudum gelegen is. Het heeft lang vrij los gelegen van Koudum maar kent sinds het einde van de 20e eeuw meer verbinding met het dorp door middel van sterkere bewoonde wegen die het dorp en de buurtschap verbinden. Bovenburen wordt daarom niet altijd meer als een eigen buurtschap gezien, meer als een eigen buurt aan de rand van het dorp Koudum.