In delen van The Last of Us krijg je te maken met The Infected: mensen die aangetast zijn door een parasiet. Er bestaan twee soorten in de game, te weten: Runners en Clickers. Runners bevinden zich in het beginstadium van de ziekte. Hun hersens zijn al aangetast, maar ze bewegen zich snel voort, vaak in groepen. De Clickers zitten in het laatste, derde stadium, waardoor ze niet meer kunnen zien. Met behulp van echolocatie, het maken van een klikkend geluid, kunnen ze echter wel de omgeving scannen en indringers lokaliseren.