Met het opstellen van een nieuw werkplan (2012-2015) wil GEO ook gelijk een aantal organisatorische verbeterpunten doorvoeren. Het streven is een kleiner aantal taken die een bijdrage leveren aan de realisatie van de doelen van één of meerdere maatschappelijke thema's , de zogeheten Societal Benefit Areas.
Het voorstel is die taken te groeperen in 3 thema's: "Infrastructure", waar het gaat om het kunnen waarnemen en verspreiden van de data; "Institutions and Development", waar het gaat om het kunnen delen en gebruiken van de data; "Information Services", waar het gaat om de informatiediensten en systemen voor de eindgebruikers. De eerste twee themagroepen vormen de randvoorwaarden om informatie en diensten te kunnen leveren aan de eindgebruiker. In de nulversie van het werkplan totaal zijn er voorlopig 24 taken gedefinieerd (voorheen 44) onder de 3 thema's.
Met deze nieuwe werkindeling komt er ook een nieuwe organisatiestructuur. Twee verschillende bestuursmodellen zijn voorgesteld en worden in 2011 nader onderzocht. Eind 2011 worden zowel het nieuwe GEO Werkplan en het nieuwe bestuuring voorgelegd voor akkoord aan de GEO jaarvergadering.
De projecten GEO BON en GEO Forest Carbon Tracking (GEO FCT) worden als voorbeeld projecten van de nieuwe GEO project aanpak genoemd.