Los efectos de los plaguicidas en la salud humana pueden ser agudos o retrasados en aquellos que están expuestos.[1]​
La aplicación de plaguicidas y fertilizantes impacta sobre la salud humana, existiendo relaciones directas entre varios tipos de cáncer,[2]​ problemas en la piel, problemas neurológicos,[3]​ trastornos en el desarrollo neurológico,[4]​ defectos congénitos y muerte fetal.[3]​ En particular, los trabajadores rurales que deben aplicar los productos agroquímicos son quienes sufren el mayor riesgo[5]​ y se ven afectados por el contacto directo,[6]​ llegando a sufrir daños genéticos.[7]​ La situación es particularmente grave para quienes trabajan en cultivos intensivos en el Tercer Mundo.[5]​[8]​ La OMS también advierte que quienes se encuentran en áreas cercanas a la aplicación también se encuentran en una situación de mayor riesgo de exposición.[9]​ 
Una revisión sistemática de la literatura científica encontró en 2007 que «la mayoría de los estudios sobre el linfoma y la leucemia no Hodgkin mostraron asociaciones positivas con la exposición a pesticidas» y por lo tanto concluyó que el uso de pesticidas se debería reducir.[10]​ 
Según datos de la OMS, unas 10 personas mueren al año por el uso de plaguicidas y 20 quedan intoxicadas de forma aguda por su utilización en la agricultura y la ganadería.[cita requerida] Según la Convención de Estocolmo sobre Contaminantes Orgánicos Persistentes (2001), 9 de los 12 productos químicos más peligrosos y persistentes eran pesticidas,[11]​[12]​ algunos de los cuales se han retirado de circulación.[cita requerida]