La encefalitis viral del Rocío es una enfermedad flaviviral epidémica de humanos observada por primera vez en el estado de São Paulo, Brasil, en el año 1975.[1]​ Es probable que la transmisión enzoótica continúe a un bajo nivel en la zona epidémica, y con el aumento de la deforestación y la expansión de la población, epidemias adicionales causadas por el virus de Rocío sean altamente probables.[2]​ Si las especies de aves migratorias se involucran en el ciclo de transmisión del virus es desconocido, aunque la amplia variedad de especies de mosquitos competentes, que pueden transmitir el virus de Rocío, sugiere experimentalmente, que el virus puede distribuirse ampliamente.[2]​ El brote de encefalitis en el hemisferio occidental causado por el virus del Nilo Occidental, un flavivirus relacionado, destaca el potencial de los arbovirus para causar graves problemas, lejos de sus focos enzoóticos de origen.[2]​ 
El virus de Rocío pertenece al género Flavivirus (el mismo género que el virus Zika) de la familia Flaviviridae y está serológicamente relacionado con los virus de la encefalitis de San Luis, encefalitis japonesa y encefalitis del Valle de Murray.[2]​