La intolerancia a los alimentos es una reacción adversa provocada por el consumo de ciertos alimentos. Puede deberse a deficiencia de determinadas enzimas digestivas (como la intolerancia a la lactosa), a mecanismos farmacológicos (sustancias presentes en el alimento o liberadas por él que poseen acción farmacológica potencial, como la histamina, la tiramina, la putrescina o la cadaverina) o a mecanismos de causa desconocida.[1]​
La intolerancia a los alimentos se distingue de la alergia a alimentos en que esta última provoca una respuesta del sistema inmunitario y la intolerancia no.[1]​
Asimismo, es importante la distinción con la enfermedad celíaca que, si bien tiene como base una intolerancia permanente al gluten[2]​[3]​[4]​ y fue considerada tradicionalmente como un trastorno únicamente digestivo, actualmente se conoce que se trata de una enfermedad sistémica autoinmune.[5]​
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[7]​ En personas con predisposición genética,[5]​
[6]​ el gluten causa una respuesta inmunitaria anormal que puede dar lugar a la producción de diferentes autoanticuerpos que atacan y dañan diversos órganos y sistemas.[8]​ Especialmente en niños mayores de dos años y adultos, los síntomas digestivos son leves, intermitentes o ausentes,[5]​[9]​[10]​ y predominan síntomas no digestivos que pueden ser muy variados y diversos, por lo que actualmente aproximademante el 83% de celíacos permanece sin reconocer ni diagnosticar.[11]​