Un factor subyacente en las auditorías de GAGAS es que los gobiernos federales, estatales y locales y otras organizaciones cooperan en la auditoría de programas de interés común para que los auditores puedan utilizar el trabajo de otros y evitar esfuerzos de auditoría duplicados.
Las auditorías del GAGAS se caracterizan por su falta de cooperación entre los auditores.