Goa Inquisition
गोवा इन्क्विजिशन पुर्तगाली भारत में पुर्तगाली इन्क्विजिशन का एक विस्तार था। इसका उद्देश्य कैथोलिक रूढ़िवादी और रोम के अपोस्टोलिक सी (पोंटिफेक्स) के प्रति निष्ठा को लागू करना था। हिंदुओं के उत्पीड़न और हिंदू मंदिरों को नष्ट करने के साथ गोवा धर्माधिकरण के माध्यम से धर्मांतरण हुए। यह पूछताछ मुख्य रूप से नए ईसाइयों पर केंद्रित थी जिन पर गुप्त रूप से अपने पूर्व धर्मों का पालन करने का आरोप था, और पुराने ईसाइयों पर 16वीं शताब्दी की प्रोटेस्टेंट क्रांति में शामिल होने का आरोप था। इसकी स्थापना 1560 में की गई थी, जिसे 1774 से 1778 तक कुछ समय के लिए दबा दिया गया था, इसके बाद यह तब तक जारी रहा जब तक कि इसे अंततः 1812 में समाप्त नहीं कर दिया गया। जबरन धर्मांतरण ने गुप्त-हिंदू धर्म (ईसाई होने का नाटक करते हुए गुप्त रूप से हिंदू धर्म का अभ्यास करना) को जन्म दिया और इसके अभियुक्तों को जेल में डाल दिया गया और आपराधिक आरोप के आधार पर, दोषी ठहराए जाने पर उन्हें मौत की सजा भी दी जा सकती थी। जाँचकर्ताओं ने संस्कृत, डच, अंग्रेजी या कोंकणी में लिखी गई किसी भी पुस्तक को इस संदेह पर जब्त कर लिया और जला दिया कि उनमें विचलनवादी या प्रोटेस्टेंट सामग्री है। एशिया में पुर्तगाली साम्राज्य का उद्देश्य इस्लाम को दबाना, ईसाई धर्म का प्रसार करना और मसालों का व्यापार करना था। पुर्तगाली मिशनरी उत्साह और असहिष्णुता से निर्देशित थे। इसके उदाहरणों में रॉबर्टो डी नोबिली का मदुरा मिशन (श्वेत ब्राह्मण उपनाम), साथ ही साथ मुगल सम्राट अकबर के दरबार में जेसुइट मिशन शामिल है, जिसके साथ धर्माधिकरण ने 1599 में डायमर के धर्मसभा में रोमन चर्च के लिए सीरियाई चर्च के अधीनता को लागू किया। 1561 में धर्माधिकरण की शुरुआत और 1774 में इसके अस्थायी उन्मूलन के बीच, लगभग 16,000 व्यक्तियों पर आरोप लगाए गए थे। गोवा इन्क्विजिशन के अधिकांश अभिलेख पुर्तगालियों द्वारा जला दिए गए थे जब 1812 में इन्क्विजिशन को समाप्त कर दिया गया था। इसलिए यह जानना असंभव है कि मुकदमा चलाने वालों की सही संख्या और उन्हें कितनी सजा दी गई थी। बचे हुए कुछ अभिलेखों से पता चलता है कि कम से कम 57 को धार्मिक अपराधों के लिए फांसी दी गई थी, और अन्य 64 को पुतला जलाया गया था क्योंकि वे सजा सुनाने से पहले ही जेल में मर चुके थे। यह अनुमान लगाया गया है कि 17वीं शताब्दी के अंत तक, गोवा के ईसाईकरण का मतलब था कि 250,000 की गोवा की कुल आबादी में से 20,000 से भी कम लोग गैर-ईसाई थे। 1590 के दशक के बाद से, गोवा की जांच सबसे तीव्र थी, क्योंकि स्थानीय देवताओं को चढ़ाने जैसी प्रथाओं को जादू-टोना माना जाता था। यह 17वीं शताब्दी में पूर्व में धर्माधिकरण का केंद्रीय केंद्र बन गया। गोवा में, धर्माधिकरण ने हिंदू या मुस्लिम अनुष्ठानों या त्योहारों का पालन करने वाले उल्लंघनकर्ताओं और गैर-ईसाइयों को कैथोलिक धर्म में परिवर्तित करने के पुर्तगाली प्रयासों में हस्तक्षेप करने वाले व्यक्तियों पर भी मुकदमा चलाया। धर्माधिकरण कानूनों ने हिंदू धर्म, इस्लाम और यहूदी धर्म में धर्मांतरण और स्वदेशी कोंकणी भाषा और संस्कृत के उपयोग को एक आपराधिक अपराध बना दिया। हालाँकि गोवा धर्माधिकरण 1812 में समाप्त हो गया, लेकिन पुर्तगाली ईसाई शासन के तहत हिंदुओं के खिलाफ भेदभाव अन्य रूपों में जारी रहा जैसे कि 1705 से 1840 तक लागू किए गए ज़ेंदी कर, जो कि जिज़्या कर के समान था। 1838 के पुर्तगाली संविधान और उसके बाद गोवा और दमोन के पुर्तगाली नागरिक संहिता के माध्यम से धर्मनिरपेक्षता की शुरुआत के साथ धार्मिक भेदभाव समाप्त हो गया। पृष्ठभूमि पुर्तगाल में धर्माधिकरण फर्डिनेंड और इसाबेला की शादी 1469 में हुई थी, जिससे आरागॉन और कैस्टिले के इबेरियन राज्यों को स्पेन में एकजुट किया गया था। 1492 में, उन्होंने स्पेन की यहूदी आबादी को निष्कासित कर दिया, जिनमें से कई तब पुर्तगाल चले गए। पाँच वर्षों के भीतर, पुर्तगाल में यहूदी-विरोधी और धर्माधिकरण के विचारों को अपनाया गया। एक और निष्कासन के बजाय, पुर्तगाल के राजा ने 1497 में यहूदियों के जबरन धर्मांतरण का आदेश दिया, और इन्हें नए ईसाई या क्रिप्टो-यहूदी कहा जाता था। उन्होंने निर्धारित किया कि दो दशकों तक उनके धर्मांतरण की वैधता की जांच नहीं की जाएगी। 1506 में लिस्बन में, कई सौ 'कन्वर्सो' या 'मार्रानोस' का नरसंहार हुआ, जैसा कि नए परिवर्तित यहूदियों या नए ईसाइयों को कहा जाता था, जो दो स्पेनिश डोमिनिकन के प्रचार से उकसाया गया था। कुछ उत्पीड़ित यहूदी पुर्तगाल से अमेरिका में नई दुनिया के लिए भाग गए। अन्य लोग व्यापारियों के रूप में एशिया चले गए और भारत में बस गए। कैथोलिक चर्च के पवित्र कार्यालय की ओर से इन विचारों और धर्माधिकरण की प्रथा को पुर्तगाल के मिशनरियों और औपनिवेशिक प्रशासकों द्वारा एस्टाडो दा इंडिया जैसे पुर्तगाली उपनिवेशों में फैलाया गया था। सबसे उल्लेखनीय नए ईसाइयों में से एक गार्सिया डी ओर्टा थे, जो 1534 में गोवा चले गए थे। उन्हें मरणोपरांत यहूदी धर्म के लिए दोषी ठहराया गया था। पुर्तगाली ईसाइयों द्वारा लागू गोवा इन्क्विजिशन असामान्य नहीं था, क्योंकि इसी तरह के न्यायाधिकरण उन्हीं शताब्दियों के दौरान दक्षिण अमेरिकी उपनिवेशों में संचालित थे जैसे कि लीमा इन्क्विजिशन और लिस्बन न्यायाधिकरण के तहत ब्राजील इन्क्विजिशन। गोवा इन्क्विजिशन की तरह, इन न्यायाधिकरणों ने संदिग्धों को गिरफ्तार किया, उनसे पूछताछ की और उन्हें दोषी ठहराया, और ईसाई धर्म से अलग धार्मिक मान्यताओं का गुप्त रूप से पालन करने के लिए सजा जारी की। पुर्तगाली आगमन और विजय गोवा की स्थापना और निर्माण प्राचीन हिंदू राज्यों द्वारा किया गया था और यह कदंब राजवंश की राजधानी के रूप में कार्य करता था। 13वीं शताब्दी के अंत में, एक मुस्लिम आक्रमण के कारण अलाउद्दीन खिलजी की ओर से मलिक काफूर द्वारा गोवा को लूटा गया और एक इस्लामी कब्जा किया गया। 14वीं शताब्दी में, विजयनगर के हिंदू शासकों ने इसे जीत लिया और कब्जा कर लिया। यह 15वीं शताब्दी में बहमनी सल्तनत का हिस्सा बन गया, उसके बाद बीजापुर के सुल्तान आदिल शाह के शासन में था जब वास्को डी गामा 1498 में भारत के कोझिकोड (कालीकट) पहुंचे। दा गामा की वापसी के बाद, पुर्तगाल ने भारत पर विजय प्राप्त करने और एक उपनिवेश बनाने के लिए एक सशस्त्र बेड़ा भेजा। 1510 में, पुर्तगाली एडमिरल अफोंसो डी अल्बुकर्क (सी. 1453-1515) ने गोवा पर कब्जा करने के लिए अभियानों की एक श्रृंखला शुरू की, जिसमें पुर्तगालियों ने अंततः जीत हासिल की। ईसाई पुर्तगालियों को मुस्लिम शासक आदिल शाह से गोवा पर कब्जा करने के प्रयास में हिंदू विजयनगर साम्राज्य के क्षेत्रीय एजेंट तिम्मय्या द्वारा सहायता प्रदान की गई थी। गोवा भारत में पुर्तगाली औपनिवेशिक संपत्ति और एशिया के अन्य हिस्सों में गतिविधियों का केंद्र बन गया। यह पुर्तगालियों और हिंदू विजयनगर साम्राज्य और इसके पूर्व में मुस्लिम बीजापुर सल्तनत के बीच प्रमुख और आकर्षक व्यापार केंद्र के रूप में भी कार्य करता था। बीजापुर सल्तनत और पुर्तगाली सेनाओं के बीच दशकों तक युद्ध जारी रहे। भारत में धर्माधिकरण का परिचय दा गामा के भारत की अपनी पहली यात्रा से पुर्तगाल लौटने के बाद, पोप निकोलस पंचम ने पोप बैल रोमनस पोंटिफेक्स जारी किया। इसने होली सी से एक पादरोडो प्रदान किया, जिससे पुर्तगाल को रोमन कैथोलिक साम्राज्य की ओर से एशिया में व्यापार के विशेष अधिकारों के साथ-साथ नए खोजे गए क्षेत्रों में कैथोलिक ईसाई धर्म के प्रचार के लिए जिम्मेदारी, एकाधिकार अधिकार और संरक्षण मिला। 1515 के बाद से, गोवा ने एशिया में कैथोलिक ईसाई धर्म का विस्तार करने के लिए पुर्तगाल के शाही संरक्षण (पडरोडो) के तहत मिशनरी प्रयासों के केंद्र के रूप में कार्य किया। 16वीं शताब्दी में दक्षिण अमेरिका में स्पेन और पुर्तगाल के पक्ष में वैटिकन द्वारा भी इसी तरह के पादरोडो जारी किए गए थे। पादरोडो ने चर्चों के निर्माण और नए देशों में कैथोलिक मिशनों और प्रचार गतिविधियों के लिए समर्थन को अनिवार्य किया, और इन्हें वेटिकन के धार्मिक अधिकार क्षेत्र में लाया। जेसुइट यूरोप में सबसे अधिक सक्रिय धार्मिक वर्ग थे जिन्होंने 16वीं और 17वीं शताब्दी में पादरोडो जनादेश के तहत भाग लिया था। भारत के पश्चिमी तट पर पुर्तगालियों की स्थापना पुर्तगाल की नई ईसाई आबादी के लिए विशेष रुचि थी जो पुर्तगाली धर्माधिकरण के तहत कठोर रूप से पीड़ित थे। पुर्तगाल में धर्माधिकरण के गुप्त-यहूदी लक्ष्य गोवा की ओर बढ़ने लगे, और उनका समुदाय काफी अनुपात तक पहुँच गया। भारत उन यहूदियों के लिए आकर्षक था जिन्हें विभिन्न कारणों से पुर्तगाल में जबरन बपतिस्मा दिया गया था। इसका एक कारण यह था कि भारत प्राचीन, अच्छी तरह से स्थापित यहूदी समुदायों का घर था। जिन यहूदियों का जबरन धर्मांतरण किया गया था, वे इन समुदायों से संपर्क कर सकते थे, और अपने पूर्व धर्म में फिर से शामिल हो सकते थे, अगर वे ऐसा करने का विकल्प चुनते थे, तो अपने जीवन के लिए डरने की आवश्यकता नहीं थी क्योंकि ये क्षेत्र धर्माधिकरण के दायरे से बाहर थे। एक अन्य कारण व्यापार (मसाले, हीरे, आदि) में संलग्न होने का अवसर था जिससे पुर्तगाल में नए ईसाइयों को पुर्तगाली धर्माधिकरण की शुरुआत में प्रतिबंधित कर दिया गया था। लिस्बन विश्वविद्यालय के प्रोफेसर एंटोनियो सराइवा ने अपनी पुस्तक द मैरानो फैक्ट्री में वकील मार्टिन डी ज़ेलोरिगो द्वारा 1613 में लिखे गए दस्तावेज़ का हवाला देते हुए आर्थिक मोर्चे पर नए ईसाइयों की ताकत का विवरण दिया है। ज़ेलोरिगो "राष्ट्र के पुरुष" (यहूदी नए ईसाइयों के लिए इस्तेमाल किया जाने वाला एक शब्द) के बारे में लिखते हैंः "क्योंकि पूरे पुर्तगाल में एक भी व्यापारी (होम्ब्रे डी नेगोसियोस) नहीं है जो इस राष्ट्र का नहीं है। राजा हमारे स्वामी के सभी देशों और क्षेत्रों में इन लोगों के अपने संवाददाता हैं। लिस्बन के लोग व्यापारिक चौकियों को स्थापित करने के लिए ईस्ट इंडीज में रिश्तेदारों को भेजते हैं जहां वे पुर्तगाल से निर्यात प्राप्त करते हैं, जिसे वे घर वापस मांग में माल के लिए विनिमय करते हैं। भारतीय बंदरगाह शहरों गोवा और कोचीन और अंदरूनी इलाकों में उनकी चौकियां हैं। लिस्बन और भारत में इस राष्ट्र के व्यक्तियों के अलावा कोई भी माल का व्यापार नहीं कर सकता है। उनके बिना, महामहिम अब अपनी भारतीय संपत्ति का उपयोग नहीं कर पाएंगे, और जहाजों को लैस करने से लेकर नाविकों और सैनिकों को भुगतान करने तक पूरे उद्यम को वित्तपोषित करने वाले कर्तव्यों में एक वर्ष में 600,000 ड्यूकट खो देंगे। भारत में नए ईसाइयों के लिए पुर्तगाली प्रतिक्रिया शिकायत और विवाद के कड़वे पत्रों के रूप में आई जो धर्मनिरपेक्ष और चर्च के अधिकारियों द्वारा पुर्तगाल को भेजे गए थे, और ये शिकायतें व्यापार प्रथाओं और कैथोलिक धर्म के परित्याग के बारे में थीं। विशेष रूप से, गोवा के पहले आर्कबिशप डॉम गैस्पर डी लेओ परेरा, नए ईसाई उपस्थिति के बेहद आलोचक थे, और गोवा में धर्माधिकरण की स्थापना के लिए याचिका दायर करने में अत्यधिक प्रभावशाली थे। पुर्तगाल ने भी गोवा में मिशनरियों को भेजा, और इसकी औपनिवेशिक सरकार ने हिंदुओं और मुसलमानों को ईसाइयों में बपतिस्मा देने के लिए प्रोत्साहन के साथ ईसाई मिशन का समर्थन किया। 1534 में गोवा में एक धर्मप्रांत की स्थापना की गई थी। 1542 में मार्टिम अफोंसो डी सौसा को पुर्तगाली भारत का नया राज्यपाल नियुक्त किया गया। वह सोसाइटी ऑफ जीसस के सह-संस्थापक फ्रांसिस जेवियर के साथ गोवा पहुंचे। 1548 तक, पुर्तगाली उपनिवेशवादियों ने कॉलोनी में चौदह चर्चों को पूरा कर लिया था। 16वीं से 17वीं शताब्दी तक के मिशनरियों के जीवित रिकॉर्ड, डेलियो डी मेंडोंका कहते हैं, व्यापक रूप से रूढ़िवादी और गैर-यहूदियों की आलोचना करते हैं, एक ऐसा शब्द जो मोटे तौर पर हिंदुओं को संदर्भित करता है। यूरोपीय मिशनरियों के लिए, भारत के गैर-यहूदी जो पूरी तरह से शत्रुतापूर्ण नहीं थे, वे अंधविश्वासी, कमजोर और लालची थे। एक धर्मप्रचारक ने दावा किया कि भारतीयों ने नौकरी या कपड़ों के उपहार जैसे भौतिक लाभों के लिए ईसाई धर्म अपना लिया; हिंदुओं और मुसलमानों द्वारा रखे गए दासों के मामले में स्वतंत्रता; और अविवाहित गैर-ईसाई पुरुषों के मामले में ईसाई महिलाओं से शादी। बपतिस्मा के बाद, इन नए धर्मान्तरित लोगों ने गुप्त रूप से अपने पुराने धर्म का पालन करना जारी रखा, जैसा कि पहले पुर्तगाल में जबरन ईसाई धर्म में परिवर्तित किए गए क्रिप्टोक्यूरेंसी-यहूदियों ने किया था। जेसुइट मिशनरियों ने इसे कैथोलिक ईसाई विश्वास की शुद्धता के लिए एक खतरा माना और क्रिप्टोक्यूरेंसी-हिंदुओं, क्रिप्टोक्यूरेंसी-मुसलमानों और क्रिप्टोक्यूरेंसी-यहूदियों को दंडित करने के लिए धर्माधिकरण के लिए दबाव डाला, जिससे पाखंड समाप्त हो गया। गोवा धर्माधिकरण ने 1545 और 1563 के बीच ट्रेंट परिषद द्वारा गोवा और पुर्तगाल के अन्य भारतीय उपनिवेशों को जारी किए गए निर्देशों को अनुकूलित किया। इसमें हिंदू रीति-रिवाजों पर हमला करना, ईसाई धर्मान्तरित लोगों की संख्या बढ़ाने के लिए सक्रिय प्रचार करना, कैथोलिक ईसाइयों के दुश्मनों से लड़ना, उन व्यवहारों को उखाड़ फेंकना जिन्हें विधर्म माना जाता था और कैथोलिक विश्वास की शुद्धता को बनाए रखना शामिल था। मेंडोंका कहते हैं कि पुर्तगालियों ने जाति प्रणाली को स्वीकार किया और इस तरह स्थानीय समाज के अभिजात वर्ग को आकर्षित किया, क्योंकि सोलहवीं शताब्दी के यूरोपीय लोगों की अपनी संपत्ति प्रणाली थी और उनका मानना था कि सामाजिक विभाजन और वंशानुगत राजत्व ईश्वरीय रूप से स्थापित थे। यह त्योहार, समन्वित धार्मिक प्रथाएं और अन्य पारंपरिक रीति-रिवाज थे जिन्हें एक निवारक और दंडात्मक न्याय की आवश्यकता वाले मूल निवासियों के विधर्म, पुनरावृत्ति और कमियों के रूप में पहचाना गया था। सेंट फ्रांसिस जेवियर की भागीदारी के बारे में विवाद सेंट फ्रांसिस जेवियर ने एशिया में एक व्यापक मिशन का नेतृत्व किया, मुख्य रूप से पूर्व में पुर्तगाली साम्राज्य, और प्रचार कार्य में प्रभावशाली था, विशेष रूप से प्रारंभिक आधुनिक भारत में। वे पुर्तगाली भारत में मिशनरी गतिविधियों में व्यापक रूप से शामिल थे। 1546 में, फ्रांसिस जेवियर ने पुर्तगाली राजा, जॉन तृतीय को संबोधित एक पत्र में गोवा धर्माधिकरण की स्थापना का प्रस्ताव रखा, जिसमें उन्होंने लिखा था, "एक अन्य मार्ग से मैंने आपको भारत में प्रचारकों की बड़ी आवश्यकता के बारे में लिखा है। भारत में दूसरी आवश्यकता जो प्राप्त होती है, अगर वहाँ रहने वाले लोग अच्छे ईसाई होने हैं, तो यह है कि महामहिम को पवित्र न्यायनिर्णयन की स्थापना करनी चाहिए; क्योंकि ऐसे कई लोग हैं जो मूसा के कानून या मुहम्मद के कानून के अनुसार भगवान के डर या लोगों के सामने शर्म के बिना रहते हैं "उन्होंने इसके अलावा गोवा में ईसाई धर्म के प्रचार के लिए पुर्तगाली राज्यपाल द्वारा अधिक कार्रवाई की वकालत की, जहां तक कि विफलता की स्थिति में अधिकारी को गंभीर सजा देने की धमकी दी गई" राजा राज्यपाल को चेतावनी दें कि] "यदि वह हमारे विश्वास की बड़ी वृद्धि के लिए सक्रिय कदम उठाने में विफल रहता है, तो आप उसे दंडित करने के लिए दृढ़ हैं, और उसे एक गंभीर शपथ के साथ सूचित करें कि पुर्तगाल लौटने पर, उसकी सारी संपत्ति सांता एम के लाभ के लिए जब्त कर ली जाएगी। यह सुनिश्चित करने का इससे बेहतर कोई तरीका नहीं है कि भारत में सभी ईसाई बन जाएं कि महामहिम राज्यपाल को कड़ी सजा दें "उनके गोवा छोड़ने के दो दशक बाद जांच की घोषणा की गई थी, और उनके जाने के लगभग 25 साल बाद 1567 में मुख्य कानून लागू किए गए थे। उनकी मृत्यु और अवशेषों को पुराने गोवा में वापस स्थानांतरित किए हुए लगभग 15 साल बीत गए। जिस पत्र का उल्लेख किया गया है, वह 20 जनवरी 1545 (गोवा छोड़ने के 3 साल बाद) को मलय द्वीपसमूह के मलक्का से पुर्तगाल के राजा जॉन तृतीय को लिखा गया था, जो बंदरगाह शहर को घर बनाने वाले पुर्तगाली नाविकों की निंदनीय जीवन शैली के जवाब में था, जहां वह जॉन तृतीय की आलोचना करता है (उस समय कुछ बहुत ही दुर्लभ) अपने अधिकारियों के बारे में जो केवल कर एकत्र करने की परवाह करते हैं और अपनी प्रजा के बीच अनुशासन बनाए रखने के बारे में नहीं, और इसलिए कहता है कि नए धर्मांतरित लोगों को अनुशासनहीन पुर्तगाली कमांडेंटों से दुर्व्यवहार से बचाने के लिए पुराने बिशप की सहायता के लिए शक्तियों के साथ एक अलग अधिकारी भेजा जाए। वह राजा से अपना खजाना भरने के बारे में सोचना बंद करने और इसके बजाय ईस्ट इंडीज में कमाए गए धन का एक हिस्सा नए धर्मान्तरित लोगों के लाभ के लिए रखने के लिए कहता है। हिसोरियन और पूर्व पादरी टियोटोनियो डी सूजा इंगित करते हैं कि तैनात सिविल सेवकों के अलावा, "जिन लोगों को 'खोजकर्ताओं' के रूप में भेजा गया था, उनमें से अधिकांश पुर्तगाली समाज के रिफ-रैफ थे, जिन्हें पुर्तगाली जेलों से उठाया गया था।" न ही सैनिक, नाविक, या व्यापारी मिशनरी कार्य करने के लिए आते थे, और शाही नीति ने असंतुष्ट कुलीन वर्ग के प्रवाह की अनुमति दी। कई आगंतुकों ने स्थानीय महिलाओं के साथ संबंध बनाए और स्थानीय संस्कृति को अपनाया। मिशनरी अक्सर अपने साथी ईसाइयों के "निंदनीय और अनुशासनहीन" व्यवहार के खिलाफ लिखते थे। भारत में इन्क्विजिशन की शुरुआत इन्क्विजिशन शुरू होने से पहले ही, गोवा में स्थानीय सरकार ने धार्मिक अपराधों के लिए व्यक्तियों पर मुकदमा चलाया और दोषी ठहराए गए लोगों को दंडित किया, साथ ही साथ यहूदीकरण को लक्षित किया। हिंदू मंदिरों की संपत्तियों को जब्त करने और उन्हें कैथोलिक मिशनरियों को हस्तांतरित करने के साथ-साथ हिंदू मंदिरों को नष्ट करने का एक पुर्तगाली आदेश 30 जून 1541 का है। 1560 में गोवा में धर्माधिकरण कार्यालय को अधिकृत करने से पहले, पुर्तगाल के राजा जॉन तृतीय ने 8 मार्च 1546 को हिंदू धर्म को प्रतिबंधित करने, हिंदू मंदिरों को नष्ट करने, हिंदू दावतों के सार्वजनिक उत्सव को प्रतिबंधित करने, हिंदू पुजारियों को निष्कासित करने और भारत में पुर्तगाली संपत्ति में कोई भी हिंदू छवि बनाने वालों को कड़ी सजा देने का आदेश जारी किया। पुर्तगाली क्षेत्र के भीतर मुस्लिम मस्जिदों पर 1550 से पहले एक विशेष धार्मिक कर लगाया गया था। अभिलेखों से पता चलता है कि 1539 में पुर्तगालियों द्वारा एक नए ईसाई को "विधर्मी बयानों" के धार्मिक अपराध के लिए मार दिया गया था। 1543 में गोवा इन्क्विजिशन ट्रिब्यूनल के गठन से पहले, पुर्तगालियों द्वारा जेरोनिमो डायस नामक एक यहूदी कन्वर्सो या ईसाई धर्मान्तरित को यहूदीकरण के धार्मिक पाखंड के लिए गोवा में सूली पर लटका कर जला दिया गया था। पुर्तगाल के धर्माधिकरण कार्डिनल हेनरिक की शुरुआत ने अलेक्सो डियाज़ फाल्काओ को पहले जांचकर्ता के रूप में भेजा और पहले न्यायाधिकरण की स्थापना की। गोवा धर्माधिकरण कार्यालय सुल्तान आदिल शाह के पूर्व महल में स्थित था। गोवा इन्क्विजिशन द्वारा जारी किए गए विभिन्न आदेशों में शामिल थेः 1567 में सभी कादियों को पुर्तगाली क्षेत्र से बाहर किसी भी सार्वजनिक पद पर कब्जा करने का आदेश दिया गया था, और केवल एक ईसाई को ऐसा पद धारण करने से मना किया गया था; हिंदुओं को किसी भी ईसाई भक्ति वस्तुओं या प्रतीकों को पेश करने से मना किया गया था; हिंदू बच्चों जिनके पिता की मृत्यु हो गई थी, उन्हें ईसाई धर्म में परिवर्तन के लिए जेसुइट्स को सौंपना आवश्यक था; हिंदू महिलाएं जो ईसाई धर्म में परिवर्तित हो गईं, वे अपने माता-पिता की सभी संपत्ति का उत्तराधिकारी हो सकती थीं; सभी ग्राम परिषदों में हिंदू क्लर्कों को ईसाईयों के साथ बदल दिया गया था; ईसाई गणवर (स्वतंत्र धारक) बिना किसी हिंदू गणवरों की उपस्थिति के गाँव के निर्णय ले सकते थे, हालाँकि हिंदू गणवर कोई भी गाँव के निर्णय नहीं ले सकते थे जब तक कि सभी ईसाई गणवर मौजूद न हों। ईसाई सदस्यों को किसी भी कार्यवाही पर पहले हस्ताक्षर करने थे, बाद में हिंदुओं को; कानूनी कार्यवाही में, हिंदू गवाह के रूप में अस्वीकार्य थे, केवल ईसाई गवाहों के बयान स्वीकार्य थे। पुर्तगाली गोवा में हिंदू मंदिरों को ध्वस्त कर दिया गया था और हिंदुओं को नए मंदिर बनाने या पुराने मंदिरों की मरम्मत करने से मना किया गया था। जेसुइट्स के एक मंदिर विध्वंस दस्ते का गठन किया गया था जिसने 16वीं शताब्दी से पहले के मंदिरों को सक्रिय रूप से ध्वस्त कर दिया था, 1569 के एक शाही पत्र में लिखा था कि भारत में पुर्तगाली उपनिवेशों में सभी हिंदू मंदिरों को ध्वस्त कर दिया गया है और जला दिया गया है (डेसिफ़िओस ई क्वीमाडस); हिंदू पुजारियों को हिंदू शादियों को अंजाम देने के लिए पुर्तगाली गोवा में प्रवेश करने से मना किया गया था। गोवा में रहने वाले सेफार्डिक यहूदी, जिनमें से कई स्पेनिश धर्माधिकरण की ज्यादतियों से बचने के लिए इबेरियन प्रायद्वीप से भाग गए थे, को भी उन मामलों में सताया गया था जब वे या उनके पूर्वज धोखाधड़ी से ईसाई धर्म में परिवर्तित हो गए थे। दा फोंसेका की कथा पूछताछ की हिंसा और क्रूरता का वर्णन करती है। अभिलेख अभियुक्तों को समायोजित करने के लिए सैकड़ों जेल कक्षों की मांग की बात करते हैं। 1560 से 1774 तक, कुल 16,172 व्यक्तियों पर इन्क्विजिशन के न्यायाधिकरणों द्वारा मुकदमा चलाया गया। जबकि इसमें विभिन्न राष्ट्रीयताओं के व्यक्ति भी शामिल थे, भारी बहुमत, लगभग तीन-चौथाई, मूल निवासी थे, जिनका लगभग समान रूप से कैथोलिक और गैर-ईसाई प्रतिनिधित्व करते थे। इनमें से कईयों को सीमा पार करने और वहां खेती करने के लिए ले जाया गया था। बेंटन के अनुसार, 1561 और 1623 के बीच, गोवा इन्क्विजिशन ने 3,800 मामले लाए। यह एक बड़ी संख्या थी क्योंकि 1580 के दशक में गोवा की कुल आबादी लगभग 60,000 थी, जिसमें अनुमानित हिंदू आबादी लगभग एक तिहाई या 20,000 थी। 71 ऑटो डी फे ("विश्वास का कार्य") दर्ज किया गया था, सार्वजनिक प्रायश्चित का भव्य तमाशा जिसके बाद अक्सर दोषी व्यक्तियों को विभिन्न प्रकार से दंडित किया जाता था और जिसमें दांव पर जलाना भी शामिल था। पहले कुछ वर्षों में ही 4000 से अधिक लोगों को गिरफ्तार किया गया था। मचाडो के अनुसार, गोवा में अपने अस्तित्व की ढाई शताब्दियों में, धर्माधिकरण ने 57 लोगों को दांव पर लगाकर और 64 लोगों के पुतलों को जलाकर मार डाला, जिनमें से 105 पुरुष और 16 महिलाएं थीं। "पुतला जलाने" की सजा उन लोगों पर लागू की गई थी जिन्हें अनुपस्थिति में दोषी ठहराया गया था या जिनकी जेल में मृत्यु हो गई थी; बाद के मामले में, उनके अवशेषों को पुतले के साथ एक ताबूत में जलाया गया था, जिसे सार्वजनिक प्रदर्शन के लिए लटका दिया गया था। विभिन्न दंडों की सजा पाए अन्य लोगों की कुल संख्या 4,046 थी, जिनमें से 3,034 पुरुष और 1,012 महिलाएँ थीं। क्रोनिस्टा डी टिस्यूरी (तिसवाड़ी का इतिहास) के अनुसार, अंतिम ऑटो डी फे 7 फरवरी 1773 को गोवा में आयोजित किया गया था। कार्यान्वयन और परिणाम पुर्तगाल के भारतीय उपनिवेशों में धर्माधिकरण शुरू करने की अपील विकर जनरल मिगुएल वाज द्वारा भेजी गई थी। भारत-पुर्तगाली इतिहासकार टियोटोनियो आर. डी सूजा के अनुसार, मूल अनुरोधों ने "मूर्स" (मुसलमानों), नए ईसाई, यहूदियों और उन हिंदुओं को लक्षित किया जो 'जेन्टिलिटी' और पाखंड के प्रचार में शामिल थे, और इसने गोवा को पुर्तगालियों द्वारा संचालित उत्पीड़न का केंद्र बना दिया। 1567 में जेसुइट्स और गोवा की चर्च प्रांतीय परिषद की मांगों के तहत औपनिवेशिक प्रशासन ने कैथोलिकों द्वारा विधर्मी आचरण को समाप्त करने और ईसाई धर्म में धर्मांतरण को प्रोत्साहित करने के लिए हिंदू विरोधी कानून बनाए। ईसाइयों को हिंदुओं को अपनी नौकरी में रखने पर प्रतिबंध लगाने वाले कानून पारित किए गए और हिंदुओं की सार्वजनिक पूजा को गैरकानूनी माना गया। हिंदुओं को ईसाई सिद्धांत सुनने या अपने धर्म की आलोचना करने के लिए समय-समय पर चर्चों में इकट्ठा होने के लिए मजबूर किया जाता था। संस्कृत और मराठी में हिंदू पुस्तकों को गोवा के धर्माधिकरण द्वारा जला दिया गया था। इसने हिंदू पुजारियों को हिंदू शादियों को आयोजित करने के लिए गोवा में प्रवेश करने से भी मना कर दिया। उल्लंघन के परिणामस्वरूप गैर-कैथोलिकों को विभिन्न प्रकार की सजा दी गई जैसे कि जुर्माना, सार्वजनिक कोड़े मारने, मोजाम्बिक को निर्वासित करना, कारावास, फांसी, दांव पर जलाना या ऑटो-डा-फे में ईसाई पुर्तगाली अभियोजकों के आदेश के तहत पुतला जलाना। इस पूछताछ ने हिंदुओं को बड़ी संख्या में गोवा से भागने के लिए मजबूर कर दिया और बाद में इसके ईसाइयों और मुसलमानों का गोवा से आसपास के क्षेत्रों में पलायन हो गया जो जेसुइट्स और पुर्तगाली भारत के नियंत्रण में नहीं थे। हिंदुओं ने अपने मंदिरों के विनाश का जवाब देते हुए अपने पुराने मंदिरों के खंडहरों से छवियों को बरामद किया और उनका उपयोग पुर्तगाली नियंत्रित क्षेत्रों की सीमाओं के ठीक बाहर नए मंदिरों का निर्माण करने के लिए किया। कुछ मामलों में जहां पुर्तगालियों ने नष्ट किए गए मंदिरों के स्थान पर चर्च बनाए थे, हिंदुओं ने वार्षिक जुलूस शुरू किए जो पुर्तगाली औपनिवेशिक युग के अंत के बाद अपने देवी-देवताओं को अपने नए मंदिरों को उस स्थान से जोड़ते हैं जहां चर्च खड़े हैं। हिंदुओं के उत्पीड़न को देशवासियों को ईसाई धर्म में परिवर्तित होने के लिए रोकने का प्रयास करने, गोवा के ईसाइयों को गोवा से भागने के लिए उकसाने, या परित्यक्त/अनाथ बच्चों को छिपाने के लिए गिरफ्तार किया जा सकता है, जिनकी सूचना अधिकारियों को नहीं दी गई थी। हिंदुओं के कैथोलिक वंशजों पर मुकदमा चलाए जाने की अधिक संभावना थी, हालांकि यह उनकी आबादी का अधिक अनुपात होने के कारण हो सकता है। सजा पाए लोगों में से लगभग 74 प्रतिशत पर क्रिप्टोक्यूरेंसी-हिंदू धर्म (आधिकारिक तौर पर ईसाई होने के बावजूद निजी तौर पर हिंदू धर्म का पालन करने) का आरोप लगाया गया था, जबकि क्रिप्टोक्यूरेंसी-मुसलमानों (आधिकारिक तौर पर ईसाई होने के बावजूद निजी तौर पर इस्लाम का पालन करने वाले) को लगभग डेढ़ प्रतिशत सजा सुनाई गई, डेढ़ प्रतिशत पर धर्माधिकरण के पवित्र कार्यालय के संचालन में बाधा डालने के लिए मुकदमा चलाया गया। लगभग 250 वर्षों के धर्माधिकरण परीक्षणों के अधिकांश अभिलेख पुर्तगालियों द्वारा धर्माधिकरण पर प्रतिबंध लगाने के बाद जला दिए गए थे। जो बच गए हैं, जैसे कि 1782-1800 के बीच के लोग कहते हैं कि लोगों पर मुकदमा चलाया जाता रहा और उन्हें दंडित किया जाता रहा। एंटोनियो जोस सराइवा के अनुसार, गोवा इन्क्विजिशन के दौरान गिरफ्तार किए गए, मुकदमा चलाया गया और सजा सुनाए गए लोगों का एक बड़ा हिस्सा सबसे निचले सामाजिक वर्ग से था। मुकदमे के अभिलेखों से पता चलता है कि पीड़ित केवल हिंदू नहीं थे, बल्कि भारत में पाए जाने वाले अन्य धर्मों के सदस्यों के साथ-साथ कुछ यूरोपीय भी थे। फा. डियोगो दा बोरबा और उनके सलाहकार विकर जनरल मिगुएल वाज ने हिंदुओं का धर्म परिवर्तन करने के मिशनरी लक्ष्यों का पालन किया। जेसुइट और फ्रांसिसकन मिशनरियों के सहयोग से, गोवा में पुर्तगाली प्रशासन और सेना को हिंदुओं और अन्य भारतीय धर्मों की सांस्कृतिक और संस्थागत जड़ों को नष्ट करने के लिए तैनात किया गया था। उदाहरण के लिए, वायसराय और कैप्टन जनरल एंटोनियो डी नोरोन्हा और बाद में कैप्टन जनरल कॉन्स्टेंटिनो डी सा डी नोरोन्हा ने पुर्तगाली संपत्ति में हिंदू और बौद्ध मंदिरों को व्यवस्थित रूप से नष्ट कर दिया और भारतीय उपमहाद्वीप पर नई विजय के प्रयास किए। ईसाई मिशनरियों और पुर्तगाली सरकार द्वारा नष्ट किए गए हिंदू मंदिरों की प्रकृति और संख्या के बारे में सटीक जानकारी उपलब्ध नहीं है। 1566 तक गोवा द्वीप पर लगभग 160 मंदिरों को ध्वस्त कर दिया गया था। 1566 और 1567 के बीच, फ्रांसिसकन मिशनरियों के एक अभियान ने बारदेज़ (उत्तरी गोवा) में 300 अन्य हिंदू मंदिरों को नष्ट कर दिया। साल्सेट (दक्षिण गोवा) में, लगभग 300 अन्य हिंदू मंदिरों को धर्माधिकरण के ईसाई अधिकारियों द्वारा नष्ट कर दिया गया था। पुर्तगाली अधिकारियों द्वारा असोलना और कुंकोलिम में कई हिंदू मंदिरों को नष्ट कर दिया गया था। पुर्तगाली अभिलेखागार में 1569 के एक शाही पत्र में लिखा है कि भारत में इसकी कॉलोनियों में सभी हिंदू मंदिरों को जला दिया गया था और ध्वस्त कर दिया गया था। उलरिच लेहनर के अनुसार, "सोलहवीं शताब्दी में गोवा एक सहिष्णु स्थान रहा था, लेकिन गोवा के धर्माधिकरण ने इसे हिंदुओं और अन्य एशियाई धर्मों के सदस्यों के लिए एक शत्रुतापूर्ण स्थान में बदल दिया था। मंदिरों को ध्वस्त कर दिया गया था, सार्वजनिक हिंदू अनुष्ठानों पर प्रतिबंध लगा दिया गया था और हिंदू धर्म में धर्मांतरण के लिए कड़ी सजा दी गई थी। गोवा इन्क्विजिशन ने सार्वजनिक हिंदू पूजा के किसी भी मामले में कठोरता से मुकदमा चलाया; इसके तीन-चौथाई से अधिक मामले इससे संबंधित थे, और केवल दो प्रतिशत धर्मत्याग या विधर्म से संबंधित थे। 1566 और 1576 के बीच जारी किए गए नए कानूनों ने हिंदुओं को किसी भी क्षतिग्रस्त मंदिर की मरम्मत या नए मंदिर बनाने से रोक दिया। सार्वजनिक हिंदू शादियों सहित समारोहों पर प्रतिबंध लगा दिया गया था। जिस किसी के पास हिंदू देवता या देवी की छवि थी, उसे अपराधी माना जाता था। गोवा में गैर-हिंदुओं को भगवान या देवी की छवियों वाले किसी भी व्यक्ति की पहचान करने और जाँच अधिकारियों को रिपोर्ट करने के लिए प्रोत्साहित किया गया था। उन अभियुक्तों की तलाशी ली गई और यदि कोई सबूत मिला, तो ऐसे "मूर्ति रखने वाले" हिंदुओं को गिरफ्तार कर लिया गया और उन्होंने अपनी संपत्ति खो दी। जब्त की गई संपत्ति का आधा हिस्सा आरोप लगाने वालों को इनाम के रूप में दिया गया, जबकि बाकी आधा चर्च को दिया गया। "चर्च के पिताओं ने हिंदुओं को उनके अपने पवित्र ग्रंथों के उपयोग के लिए भयंकर दंड के तहत मना किया, और उन्हें अपने धर्म के सभी अभ्यास से रोक दिया। उन्होंने उनके मंदिरों को नष्ट कर दिया, और लोगों को इतना परेशान किया और हस्तक्षेप किया कि उन्होंने बड़ी संख्या में शहर को छोड़ दिया, और ऐसे स्थान पर रहने से इनकार कर दिया जहाँ उन्हें कोई स्वतंत्रता नहीं थी, और यदि वे अपने ही तरीके से अपने पूर्वजों के देवताओं की पूजा करते थे तो उन्हें कारावास, यातना और मृत्यु का सामना करना पड़ता था। फिलिप्पो सस्सेट्टी ने लिखा, जो 1578 से 1588 तक भारत में थे। 1620 में, हिंदुओं को उनके विवाह अनुष्ठान करने से रोकने के लिए एक आदेश पारित किया गया था। कोंकणी भाषा को दबाने और पुर्तगाली बोलना अनिवार्य बनाने के लिए जून 1684 में एक आदेश जारी किया गया था। कानून में स्थानीय भाषाओं का उपयोग करने वाले किसी भी व्यक्ति के साथ कठोर व्यवहार करने का प्रावधान था। उस कानून का पालन करते हुए, सभी गैर-कैथोलिक सांस्कृतिक प्रतीकों और स्थानीय भाषाओं में लिखी गई पुस्तकों को नष्ट कर दिया जाना था। फ्रांसीसी चिकित्सक चार्ल्स डेलोन ने धर्माधिकरण के एजेंटों की क्रूरता का प्रत्यक्ष अनुभव किया और भारतीय मूल के लोगों, विशेष रूप से हिंदुओं के खिलाफ लक्ष्यों, मनमानेपन, यातना और नस्लीय भेदभाव के बारे में शिकायत की। उन्हें गिरफ्तार किया गया, जेल की सजा सुनाई गई जहां उन्होंने हिंदुओं को यातना और भुखमरी से गुजरते देखा, और फ्रांसीसी सरकार के दबाव में उन्हें रिहा कर दिया गया। वे फ्रांस लौट आए और 1687 में गोवा में अपने अनुभवों का वर्णन करते हुए एक पुस्तक प्रकाशित की, जिसका नाम था रिलेशन डी ल 'इन्क्विजिशन डी गोवा (द इन्क्विजिशन ऑफ गोवा)। बौद्धों का उत्पीड़न गोवा धर्माधिकरण ने दक्षिण एशिया में पुर्तगाली हमलों में जब्त की गई बौद्ध पवित्र वस्तुओं को नष्ट कर दिया। उदाहरण के लिए, 1560 में, वायसराय कॉन्स्टेंटिनो डी ब्रगान्का के नेतृत्व में एक नौसेना ने पूर्वोत्तर श्रीलंका में तमिलों पर हमला किया। उन्होंने चौथी शताब्दी से स्थानीय तमिलों द्वारा पवित्र के रूप में संरक्षित और दलादा कहे जाने वाले बुद्ध के दांत के साथ एक अवशेष को जब्त कर लिया। डियोगो डो कौटो-गोवा में 16वीं शताब्दी के उत्तरार्ध के पुर्तगाली इतिहासकार, अवशेष को "बंदर का दांत" (डेंटे डो बुगियो) के साथ-साथ "बुद्ध का दांत" के रूप में संदर्भित करते हैं, "बंदर" शब्द दक्षिण एशियाई लोगों की सामूहिक पहचान के लिए एक आम नस्लीय अपमान है। उस युग के अधिकांश यूरोपीय विवरणों में, ईसाई लेखक इसे "बंदर या बंदर का दांत" कहते हैं, जबकि कुछ इसे "दानव का दांत" या "पवित्र व्यक्ति का दांत" कहते हैं। पुर्तगाली इतिहासकार फारिया ए सौसा जैसे कुछ विवरणों में, दाँत को "बुराई का एक वास्तविक शैतानी स्रोत जिसे नष्ट करना पड़ा" कहा गया है। पुर्तगालियों द्वारा दाँत पर कब्जा दक्षिण एशिया में तेजी से फैल गया, और पेगु के राजा ने इसके बदले पुर्तगालियों को एक भाग्य की पेशकश की। हालाँकि, गोवा धर्माधिकरण के धार्मिक अधिकारियों ने फिरौती की स्वीकृति को रोक दिया और अपमान और धार्मिक सफाई के साधन के रूप में सार्वजनिक रूप से दांत को नष्ट करने के लिए एक भव्य समारोह आयोजित किया। हन्ना वोजसीहोव्स्की के अनुसार, "बंदर" शब्द कार्यवाही में एक नस्लीय अपमान बन गया, लेकिन यह शुरू में हिंदू धर्म और बौद्ध धर्म के बीच समन्वय का एक उत्पाद हो सकता है, इस तथ्य को देखते हुए कि बुद्ध के दांतों के अवशेष को जाफना में तमिल हिंदुओं द्वारा संरक्षित और पवित्र माना जाता था, और ये हिंदू भी हनुमान की पूजा करते थे। पुर्तगाली जांच अधिकारियों और उनके यूरोपीय समर्थकों के लिए, इस शब्द ने उन भूमि और लोगों के लिए उनकी रूढ़ियों को पेश किया जिन्हें उन्होंने हिंसक रूप से जीत लिया था और साथ ही भारतीय धर्मों के खिलाफ उनके पूर्वाग्रहों को भी पेश किया था। यहूदियों का उत्पीड़न गोवा उन यहूदियों के लिए एक अभयारण्य था जिन्हें इबेरियन प्रायद्वीप पर जबरन ईसाई धर्म में परिवर्तित कर दिया गया था। इन जबरन बपतिस्मा प्राप्त धर्मान्तरित लोगों को नए ईसाइयों के रूप में जाना जाता था। वे उस जगह रहते थे जिसे तब यहूदी सड़क के नाम से जाना जाने लगा था। नई ईसाई आबादी इतनी अधिक थी कि, जैसा कि सवेरा ने खुलासा किया है, "18 फरवरी 1519 के एक पत्र में, राजा मैनुअल प्रथम ने गोवा में न्यायाधीश, नगर पार्षद या नगरपालिका पंजीयक के पद पर नए ईसाइयों के नाम पर प्रतिबंध लगाने वाले कानून को बढ़ावा दिया, हालांकि, यह निर्धारित करते हुए कि पहले से नियुक्त लोगों को बर्खास्त नहीं किया जाना था। इससे पता चलता है कि पुर्तगाली शासन के पहले नौ वर्षों के दौरान भी, गोवा में हाल ही में बपतिस्मा लेने वाले स्पेनिश और पुर्तगाली यहूदियों की काफी आमद हुई थी। हालाँकि, गोवा इन्क्विजिशन की शुरुआत के बाद, वायसराय डोम अंताओ डी नोरोन्हा ने दिसंबर 1565 में एक आदेश जारी किया, जिसमें यहूदियों को भारत में पुर्तगाली क्षेत्रों में प्रवेश करने पर प्रतिबंध लगा दिया गया था, जिसका उल्लंघन करने वालों को गिरफ्तारी, उनकी संपत्ति को जब्त करने और जेल में कैद करने का दंड दिया गया था। पुर्तगालियों ने 1564 और 1568 के बीच शहर की किलेबंदी की दीवारों का निर्माण किया। यह यहूदी सड़क के बगल में चलता था, लेकिन इसे किले के बाहर रखा गया था। धर्माधिकरण ने मूल रूप से नए ईसाइयों को लक्षित किया, जो यहूदी हैं जिन्हें ईसाई धर्म में जबरन परिवर्तित किया गया था और जो 1505 और 1560 के बीच पुर्तगाल से भारत आ गए थे। बाद में इसे मूर्स में जोड़ा गया, एक शब्द जिसका अर्थ था मुसलमान जिन्होंने पहले मोरक्को से इबेरियन प्रायद्वीप पर आक्रमण किया था। गोवा में, धर्माधिकरण में यहूदी, मुसलमान और बाद में मुख्य रूप से हिंदू शामिल थे। गोवा धर्माधिकरण के उद्घाटन से कुछ साल पहले शुरू हुए यहूदियों (नए ईसाइयों) के उत्पीड़न का एक प्रलेखित मामला कैल्डेरा नाम की गोवा की एक महिला का था। उनके मुकदमे ने गोवा धर्माधिकरण कार्यालय के औपचारिक शुभारंभ में योगदान दिया। काल्डेरा और 19 अन्य नए ईसाइयों को पुर्तगालियों द्वारा गिरफ्तार किया गया और 1557 में न्यायाधिकरण के समक्ष लाया गया। उन पर यहूदीकरण, आराधनालयों में जाने और अखमीरी रोटी खाने का आरोप लगाया गया था। उन पर होली के हिंदू त्योहार के साथ पूरिम त्योहार मनाने का भी आरोप लगाया गया था, जिसमें उन पर "फिल्हो दे हमाम" (हामान के बेटे) के प्रतीक गुड़िया जलाने का आरोप लगाया गया था। अंततः, उन सभी को पुर्तगाली धर्माधिकरण द्वारा मुकदमा चलाने के लिए गोवा से लिस्बन भेजा गया। वहाँ उन्हें मौत की सजा सुनाई गई। यहूदियों का उत्पीड़न कोच्चि में पुर्तगाली क्षेत्रीय दावों तक फैल गया। पुर्तगालियों ने उनके आराधनालय (परदेसी आराधनालय) को नष्ट कर दिया था। केरल के यहूदियों ने 1568 में परदेशी आराधनालय का पुनर्निर्माण किया। गोवा के कैथोलिकों का उत्पीड़न धर्माधिकरण ने उन हिंदुओं को विधर्मियों के रूप में माना जो कैथोलिक धर्म में परिवर्तित हो गए थे, लेकिन अपने पूर्व हिंदू रीति-रिवाजों और सांस्कृतिक प्रथाओं का पालन करना जारी रखा। कैथोलिक मिशनरियों का उद्देश्य कोंकणी जैसी स्वदेशी भाषाओं और सांस्कृतिक प्रथाओं जैसे समारोहों, उपवासों, घर के सामने तुलसी के पौधे को उगाने, समारोह या आभूषण के लिए फूलों और पत्तों का उपयोग को समाप्त करना था। पुर्तगाली कब्जे के दौरान अन्य दूरगामी परिवर्तन हुए, इन परिवर्तनों में पारंपरिक संगीत वाद्ययंत्रों का निषेध और उत्सव के छंदों के गायन का निषेध शामिल था, जिन्हें पश्चिमी संगीत से बदल दिया गया था। जब लोगों ने धर्म परिवर्तन किया तो उनका नाम बदल दिया गया और उन्हें अपने मूल हिंदू नामों का उपयोग करने की अनुमति नहीं थी। शराब की शुरुआत की गई और खान-पान की आदतों में नाटकीय रूप से बदलाव आया ताकि जो खाद्य पदार्थ कभी वर्जित थे, जैसे सुअर का मांस जो मुसलमानों द्वारा त्याग किया जाता है और गोमांस जो हिंदुओं द्वारा त्याग किया जाता है, वे गोवा के आहार का हिस्सा बन गए। फिर भी, गोवा के कई कैथोलिकों ने अपनी कुछ पुरानी सांस्कृतिक प्रथाओं और हिंदू रीति-रिवाजों का पालन करना जारी रखा। क्रिप्टोक्यूरेंसी-हिंदू धर्म के कुछ अभियुक्तों को मौत की सजा सुनाई गई थी। ऐसी परिस्थितियों ने कई लोगों को गोवा छोड़ने और पड़ोसी राज्यों में बसने के लिए मजबूर किया, जिनमें से एक अल्पसंख्यक दक्कन चला गया और अधिकांश केनरा चला गया। इतिहासकार सेवेरीन सिल्वा का कहना है कि जो लोग धर्माधिकरण से भाग गए थे, वे हिंदू रीति-रिवाजों और कैथोलिक प्रथाओं के मिश्रण का पालन करना पसंद करते थे। जैसे-जैसे उत्पीड़न बढ़ता गया, मिशनरियों ने शिकायत की कि ब्राह्मणों ने हिंदू धार्मिक संस्कार करना जारी रखा और हिंदुओं ने अपने सार्वजनिक धार्मिक समारोहों को बढ़ा दिया। मिशनरियों ने आरोप लगाया कि हिंदुओं की इस अवज्ञा ने हाल ही में धर्मांतरित गोवा के कैथोलिकों को हिंदू समारोहों में भाग लेने और हिंदू धर्म में फिर से शामिल होने के लिए प्रेरित किया। इसके अलावा, डेलियो डी मेंडोंका कहते हैं, गोवा में रहने वाले पुर्तगालियों के उपदेश और प्रथाओं के बीच एक पाखंडी अंतर था। पुर्तगाली ईसाई और कई पादरी जुआ खेल रहे थे, फिजूलखर्ची से खर्च कर रहे थे, सार्वजनिक रखैल का अभ्यास कर रहे थे, भारतीयों से पैसे वसूल कर रहे थे, और व्यभिचार और व्यभिचार में लिप्त थे। पुर्तगाली कैथोलिकों के "बुरे उदाहरण" सार्वभौमिक नहीं थे और ऐसे "अच्छे उदाहरण" भी थे जिनमें कुछ पुर्तगाली कैथोलिकों ने गोवा के बीमार कैथोलिकों को चिकित्सा देखभाल की पेशकश की थी। हालांकि, "अच्छे उदाहरण" पर्याप्त मजबूत नहीं थे जब वे "बुरे उदाहरणों" के विपरीत थे, और पुर्तगालियों ने अपनी सांस्कृतिक श्रेष्ठता में अपने विश्वास और उनकी धारणाओं को धोखा दिया कि "हिंदुओं, मुसलमानों, बर्बरों और मूर्तिपूजकों के पास गुण और अच्छाई नहीं थी", मेंडोंका कहते हैं। पुर्तगालियों द्वारा मूल निवासियों के खिलाफ आमतौर पर नीग्रो और कैचोरोस (कुत्ते) जैसे नस्लीय विशेषणों का उपयोग किया जाता था। गोवा इन्क्विजिशन के 250 साल की अवधि के बाद के दशकों में, पुर्तगाली कैथोलिक पादरी वर्ग ने भारतीय कैथोलिक पादरी वर्ग के साथ भेदभाव किया क्योंकि इसके सदस्य पहले से परिवर्तित कैथोलिक माता-पिता के बच्चे थे। गोवा के कैथोलिकों को "काले पुजारी" के रूप में संदर्भित किया जाता था और उन्हें "अपने स्वभाव, कामुक, शराबी, आदि के कारण खराब स्वभाव और दुर्व्यवहार" के रूप में भी रूढ़िबद्ध किया जाता था। और, इन रूढ़ियों के आधार पर, उन्हें गोवा में चर्चों का प्रभार प्राप्त करने के लिए सबसे अयोग्य माना जाता था। जो भिक्षु अपने करियर और पदोन्नति को खोना नहीं चाहते थे, उन्होंने आरोप लगाया कि उचित यूरोपीय लोगों के विपरीत, जो मूल कैथोलिक के रूप में बड़े हुए थे, वे "सफेद त्वचा वाले" लोगों से नफरत करते थे क्योंकि वे "गर्व की शैतानी बुराई" से पीड़ित थे। इन नस्लवादी आरोपों का उपयोग गोवा में पादरियों और पादरियों की संस्था को पुर्तगाली कैथोलिकों के एकाधिकार के तहत रखने के लिए आधार के रूप में किया गया था, बजाय इसके कि गोवा के मूल कैथोलिक अपनी योग्यता के आधार पर अपने चर्च संबंधी करियर में आगे बढ़ सकें। कोंकणी का दमन पुर्तगाली पुजारियों के कोंकणी भाषा के पहले के गहन अध्ययन और पिछली शताब्दी के दौरान धर्मान्तरित लोगों की खोज में एक संचार माध्यम के रूप में इसकी खेती के बिल्कुल विपरीत, धर्माधिकरण के तहत, गैर-कैथोलिक आबादी से नए धर्मान्तरित लोगों को अलग करने के लिए विदेशी विरोधी उपायों को अपनाया गया था। कोंकणी के उपयोग को दबा दिया गया था, जबकि कॉलोनी को 17 वीं शताब्दी के अंत और 18 वीं शताब्दी की शुरुआत में गोवा पर आक्रमण करने के बार-बार मराठा प्रयासों का सामना करना पड़ा। इन घटनाओं ने गोवा पर पुर्तगाल के नियंत्रण के लिए एक गंभीर खतरा पैदा कर दिया, और उन्होंने भारत में अपने व्यापार के रखरखाव के लिए भी एक गंभीर खतरा पैदा कर दिया। मराठा खतरे के कारण, पुर्तगाली अधिकारियों ने गोवा में कोंकणी को दबाने के लिए एक सकारात्मक कार्यक्रम शुरू करने का फैसला किया। पुर्तगाली का उपयोग लागू किया गया और कोंकणी सीमांत लोगों की भाषा बन गई। फ्रांसिसकों के आग्रह पर, पुर्तगाली वायसराय ने 27 जून 1684 को कोंकणी के उपयोग पर प्रतिबंध लगा दिया और उन्होंने यह भी फैसला सुनाया कि तीन साल के भीतर, स्थानीय लोग आम तौर पर पुर्तगाली भाषा बोलेंगे। उन्हें अपने सभी संपर्कों में इसका उपयोग करना होगा और उन्हें पुर्तगाली क्षेत्रों में किए गए सभी अनुबंधों में भी इसका उपयोग करना होगा। इस कानून के उल्लंघन के लिए कारावास की सजा होगी। 17 मार्च 1687 को राजा ने इस आदेश की पुष्टि की। 1731 में पुर्तगाली सम्राट जोआओ पंचम को लिखे अन्वेषक एंटोनियो अमराल कोटिन्हो के पत्र के अनुसार, इन कठोर उपायों को सफलता नहीं मिली। 1739 में मराठों के हाथों उत्तर प्रांत (जिसमें बेसिन, चौल और साल्सेट शामिल थे) के पतन के साथ, पुर्तगालियों ने कोंकणी पर अपने हमले को फिर से शुरू किया। 21 नवंबर 1745 को, आर्कबिशप लौरेंको डी सांता मारिया ने फैसला सुनाया कि पुजारी के लिए आवेदकों को पुर्तगाली में बोलने का ज्ञान और क्षमता होनी चाहिए; यह न केवल ढोंग करने वालों पर लागू होता है, बल्कि उनके करीबी संबंधों के लिए भी लागू होता है, जैसा कि आदरणीय व्यक्तियों द्वारा कठोर परीक्षाओं द्वारा पुष्टि की गई है। इसके अलावा, बैमन और चार्डोस को छह महीने के भीतर पुर्तगाली सीखने की आवश्यकता थी, जिसमें विफल रहने पर उन्हें शादी के अधिकार से वंचित कर दिया जाएगा। 1812 में, आर्कबिशप ने फैसला सुनाया कि बच्चों को स्कूलों में कोंकणी बोलने से प्रतिबंधित किया जाना था और 1847 में, इस प्रतिबंध को मदरसों तक बढ़ा दिया गया था। 1869 में कोंकणी को स्कूलों में पूरी तरह से प्रतिबंधित कर दिया गया था। नतीजतन, गोवावासियों ने कोंकणी में साहित्य विकसित नहीं किया, न ही भाषा आबादी को एकजुट कर सकी, क्योंकि इसे लिखने के लिए कई लिपियों (रोमन, देवनागरी और कन्नड़ सहित) का उपयोग किया गया था। कोंकणी (सेवकों की भाषा) बन गई, जबकि हिंदू और कैथोलिक अभिजात वर्ग ने क्रमशः मराठी और पुर्तगाली की ओर रुख किया। 1961 में जब से भारत ने गोवा पर कब्जा किया है, तब से कोंकणी एक ऐसी सीमेंट बन गई है जो जाति, धर्म और वर्ग से परे सभी गोवावासियों को बांधती है; इसे प्यार से कोंकणी माई (मां कोंकणी) कहा जाता है। इस भाषा को 1987 में पूर्ण मान्यता मिली, जब भारत सरकार ने कोंकणी को गोवा की आधिकारिक भाषा के रूप में मान्यता दी। सेंट थॉमस ईसाइयों का उत्पीड़न 1599 में अलेक्सो डी मेनेजेस के तहत, डायम्पर के धर्मसभा ने केरल के पूर्वी सीरियाई सेंट थॉमस ईसाइयों (जिन्हें सीरियाई ईसाई या नस्रानी के रूप में भी जाना जाता है) को रोमन कैथोलिक चर्च में जबरन परिवर्तित कर दिया। उन्होंने कहा कि उन्हें कैथोलिक धर्म में परिवर्तित होने की आवश्यकता है क्योंकि वे नेस्टोरियनिज़्म का अभ्यास कर रहे थे, एक ईसाई स्थिति जिसे इफिसुस की परिषद द्वारा विधर्मी घोषित किया गया था। धर्मसभा ने उनके विश्वास के अभ्यास पर गंभीर प्रतिबंध लगाए और सीरियाई/अरामी उपयोग के उनके अभ्यास पर भी गंभीर प्रतिबंध लगाए। उन्हें राजनीतिक रूप से मताधिकार से वंचित कर दिया गया था और पूर्व से बिशपों को अवरुद्ध करके उनकी महानगरीय स्थिति को बंद कर दिया गया था। उत्पीड़न बड़े पैमाने पर तब तक जारी रहा जब तक कि 1653 में कूनन क्रॉस शपथ विद्रोह और नस्रानी विद्रोह, अंततः 1663 में डच द्वारा फोर्ट कोच्चि पर कब्जा और इसके परिणामस्वरूप मालाबार से पुर्तगालियों का निष्कासन समाप्त नहीं हो गया। जब तक उत्पीड़न समाप्त हुआ, सेंट थॉमस ईसाई विरोधी शिविरों में विभाजित हो गए और उनके ऐतिहासिक रिकॉर्ड मिटा दिए गए। यहाँ तक कि आम प्रार्थना पुस्तक को भी पुर्तगालियों ने नहीं बख्शा। इसके परिणामस्वरूप सेंट थॉमस ईसाइयों के खो जाने के मूल्यवान ऐतिहासिक रिकॉर्ड और एक समय के समृद्ध समुदाय के बीच विभाजन की शुरुआत हुई। गैर-पुर्तगाली कैथोलिक ईसाइयों का उत्पीड़न गोवा इन्क्विजिशन ने गैर-पुर्तगाली ईसाई मिशनरियों और चिकित्सकों को भी प्रताड़ित किया, जैसे कि वे मिशनरी और चिकित्सक जो फ्रांस से थे। 16वीं शताब्दी में, पुर्तगाली पादरी वर्ग को एक फ्रांसीसी पादरी से जलन हुई जो मद्रास (अब चेन्नई) में काम कर रहा था; उन्होंने उसे गोवा का लालच दिया, फिर उन्होंने उसे गिरफ्तार कर लिया और पूछताछ के लिए भेज दिया। फ्रांसीसी पुजारी को तब बचाया गया जब कर्नाटक राज्य के हिंदू राजा ने पुजारी को रिहा किए जाने तक सेंट थोम की घेराबंदी करके उनकी ओर से हस्तक्षेप किया। 18वीं शताब्दी के फ्रांसीसी चिकित्सक चार्ल्स डेलोन एक अन्य ईसाई थे जिन्हें गोवा धर्माधिकरण द्वारा गिरफ्तार किया गया था और प्रताड़ित किया गया था क्योंकि उन्होंने भारत में पुर्तगाली मिशनरी प्रथाओं पर सवाल उठाया था। पांच साल तक, डेलॉन को गोवा इन्क्विजिशन द्वारा कैद किया गया था और जब तक फ्रांस ने इसकी मांग नहीं की, तब तक उन्हें रिहा नहीं किया गया था। क्लाउस क्लोस्टरमेयर के अनुसार, डेलोन ने कैथोलिक पैलेस ऑफ द इन्क्विजिशन में जीवन और मृत्यु की भयावहता का वर्णन किया, जिसने जेल का प्रबंधन किया और चर्च न्यायाधिकरणों की सिफारिशों के अनुसार यातना उपकरणों के एक समृद्ध वर्गीकरण को तैनात किया। आर्कडेकॉन जॉर्ज के खिलाफ हत्या के प्रयास किए गए थे, ताकि रोम के तहत पूरे चर्च को वश में किया जा सके। आम प्रार्थना पुस्तक को नहीं बख्शा गया। किताबें जला दी जाती थीं और स्वतंत्रता का दावा करने वाले किसी भी पुजारी को जेल में डाल दिया जाता था। कैथोलिक मानदंडों के अनुरूप वेदियों के लिए रास्ता बनाने के लिए कुछ वेदियों को गिरा दिया गया था। साहित्य में लिडिया सिगॉर्नी ने 1815 के गद्य और पद्य में अपनी कविता "द डिस्ट्रक्शन ऑफ द इन्क्विजिशन इन गोवा" को शामिल किया। प्रसिद्ध बंगाली लेखक अविक सरकार ने 2017 में एक उपन्यास एबोंग इन्क्विजिशन लिखा, जो गोवा में हिंदुओं के नरसंहार की पृष्ठभूमि पर आधारित है। ।