Η σημαντικότερη τροπολογία σε σχέση με την πρόταση της Επιτροπής αφορά βέβαια τη συμπερίληψη στην οδηγία για τις πρόσθετες ύλες διατάξεων για γενετικά τροποποιημένους οργανισμούς. Την εν λόγω τροπολογία προτείνει ο εισηγητής λαμβάνοντας ως αφετηρία τη συμβιβαστική λύση που είχαν διαπραγματευθεί το Κοινοβούλιο και η Επιτροπή σχετικά με την έγκριση των γενετικά τροποποιημένων οργανισμών εκτός της οδηγίας για τη σκόπιμη ελευθέρωση γενετικά τροποποιημένων οργανισμών στο περιβάλλον.