The program has been criticised as pseudoscience for the lack of references in some of the theories used in the 1994 Brain Gym: Teacher's Edition (revised in 2010) and for the absence of peer-reviewed research that performing the activities has a direct effect on academic performance.
Programul a fost criticat ca pseudoștiință pentru lipsa de referințe în expunerea teoriilor utilizate în lucrarea Brain Gym: Teacher's Edition 1994 (revizuită în 2010) și pentru lipsa unei cercetări care să demonstreze că desfășurarea acestor activități are un efect direct asupra performanței academice.