In the resulting structure, the FSB was to have a director, a first deputy director and nine other deputy directors, including one possible state secretary and the chiefs of six departments: Economic Security Department, Counterintelligence Department, Organizational and Personnel Service, Department of activity provision, Department for Analysis, Forecasting and Strategic Planning, Department for Protection of the Constitutional System and the Fight against Terrorism.
În structura rezultată, FSB trebuia să aibă un director, un prim adjunct director și nouă directori adjuncți, inclusiv un posibil secretar de stat și șefii a șase departamente : Departamentul de Securitate Economică, Departamentul de Contrainformații, Serviciul de organizare și personal, Departamentul de activitate, Departamentul de Analiză, Prognoză și Planificare Strategică, Departamentul pentru Protecția Sistemului Constituțional și Lupta împotriva Terorismului.