Those critical of his work include Benny Morris (who described some of Pappe's writing as "complete fabrication" and accused him of being either sloppy or dishonest in his work), Efraim Karsh, Herbert London and Steven Plaut, as well as professors Daniel Gutwein and Yossi Ben-Artzi from Haifa University.
Printre criticii operei sale se află Benny Morris (care descrie unele din scrierile lui Pappé drept „pură invenție” și îl acuză că este ori nepregătit, ori necinstit în munca sa), Efraim Karsh, Herbert London și Steven Plaut, precum și profesorii Daniel Gutwein și Yossi Ben-Artzi de la Universitatea din Haifa.