In 2005, he was awarded the FEBS Anniversary Prize for Systems Biology and in 2006 he was awarded the John von Neumann Medal by the John von Neumann Computer Society from Hungary, for outstanding achievements in computer-related science and technology.
În 2005 i s-a acordat premiul aniversar FEBS pentru biologia sistematică și în 2006 a primit medalia John von Neumann din partea Societății John von Neumann din Ungaria, pentru realizări semnificative în științele informatice și tehnologice.