The French forces left behind became unpopular with the Maltese, due particularly to the French forces' hostility towards Catholicism and pillaging of local churches to fund Napoleon's war efforts.
Forțele franceze lăsate în urmă au devenit însă nepopulare în rândul maltezilor, în special din cauza ostilității forțelor franceze față de catolicism și a jefuirii bisericilor locale pentru finanțarea eforturilor de război ale lui Napoleon.