During Sydney's two year disappearance between Seasons 2 and 3, Jack was again taken into custody, held in solitary confinement for a year because of his working with unsanctioned sources (including Irina) to learn the truth behind Sydney's apparent death.
În timpul celor doi ani de dispariție a lui Sydney, Jack a fost din nou arestat și ținut în închisoare pentru un an pentru că a lucrat cu surse neoficiale (printre care și Irina) ca să afle adevărul din spatele aparentei morți a fiicei sale.