It was established in 1988 as an amalgamation of three existing research organizations - the Tokyo Astronomical Observatory of the University of Tokyo, International Latitude Observatory of Mizusawa, and a part of Research Institute of Atmospherics of Nagoya University.
A rezultat din contopirea, în 1988, a trei instituții: Observatorul Astronomic din Tokio al Universității Tokio, Observatorul Internațional de Latitudine Mizusawa și o parte din Institutul de Cercetări Atmosferice al Universității Nagoya.