The ceremonial reopening of the university on 1 November 1543, under the rule of Duke Cosimo I de Medici, was considered as a second inauguration.
În secolul al XVI-lea s-a reluat însă dezvoltarea sa, ceremonia de redeschidere a universității la 1 noiembrie 1543, sub conducerea Ducelui Cosimo I de' Medici, fiind considerată ca o a doua inaugurare.