Following the model of Portuguese Jesuit churches like the Church of the Holy Spirit of Évora and the church of St Roque Lisbon, Bom Jesus is a single nave temple; this is covered by a curved wooden liner and has no side chapel except for two chapel in transepto area.
După modelul bisericilor iezuite portugheze, cum ar fi biserica Duhului Sfânt din Évora și biserica Sf. Roque din Lisabona, Bom Jesus este un templu cu un singur naos; este acoperită de un strat curbat de lemn și nu are nicio capelă, cu excepția celor două din transept.