Although the Yuan maintained administrative rule of Tibet, scholarly opinion on the exact nature of this rule is disputed: according to different sources, it is considered a direct subject, an indirect part of the Yuan dynasty or an "autonomous" region outside direct Yuan rule, but subject to the greater Mongol Empire.
Selvom Yuan opretholdt det administrative styre i Tibet, er videnskabelig mening om dette styres nøjagtige karakter omtvistet: Ifølge forskellige kilder betragtes det som et direkte styre, en indirekte del af Yuan-dynastiet eller en "autonom" region uden direkte Yuan-styre, men underlagt det større mongolske imperium.