When Meade assumed command of the Army of the Potomac just before the Battle of Gettysburg, he asked Humphreys to be his chief of staff, replacing Maj. Gen. Daniel Butterfield, who was considered to be too close politically to the previous commander, Maj. Gen. Joseph Hooker.
Da Meade overtog kommandoen over Army of the Potomac lige før Slaget ved Gettysburg, bad han Humphreys om at være sin stabschef i stedet for generalmajor Daniel Butterfield, som blev opfattet som værende for nært politisk tilknyttet den tidligere chef generalmajor Joseph Hooker.