Tajikistan and Russia also work closely together in issues concerning Afghanistan and are partners in anti-terrorism, anti-narcotics, and intelligence operations.
טג'יקיסטן ורוסיה גם משתפות פעולה באופן הדוק בסוגיות הנוגעות לאפגניסטן, והינם שותפים במלחמה בטרור, לחימה בסמים, ובמבצעי מודיעין.