He remained in Rome until 1545, in the employ of the Vatican; then, after a period of unsuccessfully seeking other employment in Italy (with the emperor, as well as with Cosimo I de Medici) he returned to Spain, where he held a succession of posts, many of which were marred by financial or political difficulties.
הוא נשאר ברומא עד 1545, בשירות הוותיקן; אז, לאחר שנכשל בחיפושי תעסוקה אחרת באיטליה (אצל הקיסר, כמו גם אצל קוזימו הראשון דה מדיצ'י), חזר מוראלס לספרד, שם עבד בשורה של משרות, שרבות מהן השתבשו בקשיים כספיים או פוליטיים.