Both the DRM2 and MET1 proteins share significant homology to the mammalian methyltransferases DNMT3 and DNMT1, respectively, whereas the CMT3 protein is unique to the plant kingdom.
Sowohl die DRM2- als auch die MET1-Proteine teilen eine signifikante Homologie zu den Säugetier-Methyltransferasen DNMT3 bzw. DNMT1, wohingegen das CMT3-Protein einzigartig für das Pflanzenreich ist.