Honohan then spent seven years as a Research Professor with the Economic and Social Research Institute before returning to the World Bank in 1998 as a Lead Economist and subsequently Senior Advisor on financial sector policy.
Im Anschluss daran verbrachte Honohan sieben Jahre als Forschungsprofessor am Economic and Social Research Institute, bevor er 1998 als Führender Wirtschaftswissenschaftler (Lead Economist) zur Weltbank zurückkehrte und dort anschließend Chefberater für Finanzsektorpolitik wurde.