In 1999, Kabbani came into conflict with various Muslim groups including the Islamic Society of North America (ISNA), the Council on American-Islamic Relations (CAIR), and the Islamic Circle of North America (ICNA) after he stated that 80 percent of mosques are being run by "extremist ideologies".
1999 kam Kabbani mit verschiedenen Organisationen wie der Islamic Society of North America (ISNA), dem Council on American-Islamic Relations (CAIR) und dem Islamic Circle of North America (ICNA) in Konflikt, nachdem er eine Aussage veröffentlichte, wonach 80 Prozent der über 3000 Moscheen in den USA von extremistischen Ideologen übernommen worden seien.