The game begins with Sanjuro being extracted from a reconnaissance mission two years after the mission against Ivan Isarevich that resulted in Kura, Toshiro, and Baku's supposed deaths.
Das Spiel beginnt mit der Evakuierung Sanjuros aus einer Aufklärungsmission, zwei Jahre nach der Mission gegen Ivan Isarevich, die den angeblichen Tod von Kura, Toshiro und Baku nach sich zog.