During its history, conflicts with the military regime twice led to the dissolution of the NLC's national organs, the first in 1988 under the military regime of General Ibrahim Babangida and the second in 1994, under the regime of General Sani Abacha.
Während seiner Geschichte führten Konflikte mit der Militärregierung zweimal zur Auflösung der nationalen Organe des NLC, die erste unter dem Regime von Ibrahim Babangida im Jahre 1988, die zweite 1994 unter Sani Abacha.