Although absolute levels of gene expression may be determined in the two-color array in rare instances, the relative differences in expression among different spots within a sample and between samples is the preferred method of data analysis for the two-color system.
Иако апсолутните нивоа на генска експресија може да се одредат, во ретки случаи, во двобојниот ДНК микрочип, релативните разлики на генската експресија помеѓу различните точки во примерокот и помеѓу различни примероци е преферираниот метод на анализа на податоци за системот со две бои.