The Smith–Waterman algorithm is a general local alignment method based on the same dynamic programming scheme but with additional choices to start and end at any place.
Смит–Вотермановиот алгоритам е метод кој најчесто се користи за локално порамнување, а се заснова на истата шема на динамичко програмирање, но со дополнителни избори за почеток и крај на кое било место.