As with many biological terms, the use of protein family is somewhat context dependent; it may indicate large groups of proteins with the lowest possible level of detectable sequence similarity, or very narrow groups of proteins with almost identical sequence, function, and three-dimensional structure, or any kind of group in-between.
Како и со многу други биолошки термини, употребата на терминот белковинска фамилија донекаде зависи од контекстот; може да се однесува на голема група на протеини со најниско можно ниво на сличност во секвенците, или може да се однесува на мала група на протеини со речиси идентични секвенци, функции и тродимензионални структури.