The technique of dynamic programming is theoretically applicable to any number of sequences; however, because it is computationally expensive in both time and memory, it is rarely used for more than three or four sequences in its most basic form.
Теоретски, техниката на динамичко програмирање може да се примени за кој било број на секвенци; сепак, бидејќи е компутационо доста скапа, и во однос на време и во однос на меморија, многу ретко се користи за повеќе од три или четири секвенци.