In practice there is no "standard molecule" against which to compare models of proteins, so the accuracy of a model is given by the degree of agreement between the model and a set of experimental data.
Gyakorlatban nincs olyan „standard molekula”, amihez a fehérjemodelleket hasonlítani lehetne, így a pontosságot a modell és a kísérleti adatok közötti egyezés mértékével jellemzik.