For query sequences with a hit in BLASTX, the program predicts the coding regions based on the translation reading frames identified in BLASTX alignments, otherwise, it predicts the most probable coding region based on the intrinsic signals of the query sequences.
Az olyan szekvencialekérdezésekre, melyekre a BLASTX-ben van találat, a program megjósolja a kódoló régiókat a BLASTX igazításban azonosított transzlációs leolvasási keretek alapján; ha nincs találat, megjósolja a legnagyobb valószínűségi kódolási régiót a lekérdezési szekvencia egyéb paraméterei alapján.