Since 2005, the airline has been in partnership with Lufthansa, offering participation in the Miles & More programme, and its flights, in addition to its A3 code also have the Lufthansa LH code.
2005-ben a légitársaság partneri megállapodást kötött a Lufthansával, melynek Miles & More törzsutasprogramjában részvételt kínált, járatai pedig az Aegean kódja, az A3 mellett a Lufthansa LH kódját is használták.