Klinefelter served in the Armed Forces from 1943–46 and then returned to Johns Hopkins where he remained during his professional life.
Ο Χάρι Κλαϊνεφέλτερ υπηρέτησε στις Ένοπλες Δυνάμεις από το 1943 έως το 1946 και στη συνέχεια επέστρεψε στο Τζονς Χόπκινς, όπου και παρέμεινε κατά τη διάρκεια της επαγγελματικής ζωής του.