In his honor, many books and scientific works have been published and the Institute for Macedonian language "Krste Misirkov" is named after him.
Προς τιμή του έχουν εκδοθεί πολλά βιβλία και επιστημονικά έργα στο όνομά του από το Ινστιτούτο για τη Μακεδονική γλώσσα «Κρίστε Μισίρκωφ».