During this time Iran invited him to head one of the departments of Iranian Ministry of Justice and reform its judiciary system, but Topchubashov rejected this offer and remained in Russian Empire to continue his struggle for emancipation of Muslim population.
Κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου, το Ιράν τον κάλεσε να διευθύνει ένα από τα τμήματα του ιρανικού Υπουργείου Δικαιοσύνης και να μεταρρυθμίσει το δικαστικό του σύστημα, αλλά ο Τοπτσουμπάσοφ απέρριψε αυτήν την πρόταση και παρέμεινε στη Ρωσική Αυτοκρατορία για να συνεχίσει τον αγώνα του για τη χειραφέτηση του μουσουλμανικού πληθυσμού.