On a more microscale, depression is associated  with a few things: the abnormal transmission or depletion of certain neurotransmitters, especially serotonin, norepinephrine, and dopamine, blunted circadian rhythms, or specific changes in the REM and slow-wave parts of your sleep cycle, and hormone abnormalities, such as high cortisol and deregulation of thyroid hormones.
Még elemibb szinten a depressziót összefüggésbe hozzák pár dologgal: bizonyos neurotranszmitterek abnormális továbbítása vagy legyengülése, különösen a szerotonin, noradrenalin és dopamin, a cirkadián ritmus zavara, a REM-fázis és a lassú hullámú alvás bizonyos változásai, hormonális rendellenességek, mint a magas kortizolszint és a pajzsmirigyhormonok deregulációja.