The guide RNA and the Cas9 protein complex together go bouncing along the genome, and when they find a spot where the guide RNA matches, then it inserts between the two strands of the double helix, it rips them apart, that triggers the Cas9 protein to cut, and all of a sudden, you've got a cell that's in total panic because now it's got a piece of DNA that's broken.
אז הרנ"א המכוון וחלבון ה Cas9 שמורכבים יחד מקפצים לאורכו של הגנום, וכאשר הם מוצאים נקודה  שבה הרנ"א המכוון מתאים, אז הוא מחדיר בין שני הגדילים של הסליל הכפול, הוא קורע אותם זה מזה, זה מתניע את חלבון ה Cas9 לחתוך, ולפתע, יש לכם תא שנמצא בבהלה מוחלטת כי עכשיו יש לו חתיכת דנ"א שנשברה.