On a more microscale, depression is associated  with a few things: the abnormal transmission or depletion of certain neurotransmitters, especially serotonin, norepinephrine, and dopamine, blunted circadian rhythms, or specific changes in the REM and slow-wave parts of your sleep cycle, and hormone abnormalities, such as high cortisol and deregulation of thyroid hormones.
V molekulovém měřítku je deprese spojována s abnormálním uvolňováním nebo nedostatkem určitých neurotransmiterů - konkrétně serotoninu, noradrenalinu  a dopaminu - rozhozenými cirkadiánními rytmy nebo specifickými změnami  v REM fázi spánkového cyklu, a hormonálními abnormalitami, jako je vysoká hladina kortizolu a problémy se štítnou žlázou.