The guide RNA and the Cas9 protein complex together go bouncing along the genome, and when they find a spot where the guide RNA matches, then it inserts between the two strands of the double helix, it rips them apart, that triggers the Cas9 protein to cut, and all of a sudden, you've got a cell that's in total panic because now it's got a piece of DNA that's broken.
O RNA guia e a proteína Cas9 formam um complexo que vai saltando pelo genoma, e quando eles encontram um ponto em que o RNA pode se combinar, ele se insere entre as duas vertentes da dupla hélice, rompe a ligação, e isso estimula a proteína Cas9  a se cortar, e, de uma hora pra outra, você tem uma célula em pânico por estar com um fragmento do seu DNA quebrado.