Além disso, o 244/2003 atribuiu ao agora Instituto de Financiamento da Agricultura e Pescas, P. IFAP, P.) a missão de assegurar a recolha, transporte e destruição dos cadáveres dos bovinos, ovinos, caprinos, suínos e equídeos mortos na exploração, tendo ainda estabelecido taxas de igual valor para todas as espécies de animais, como forma de financiamento do SIRCA.