Por outro lado, haverá que ter em consideração, que o recurso a métodos indiciários não tem por objectivo fornecer o valor exacto do rendimento mas um valor que seja o mais próximo possível daquele e que a determinação da matéria colectável por presunções ou valores estimados pode pecar por excesso ou defeito sendo que a tributação por métodos indiciários constitui sempre uma forma gravosa de determinação do lucro tributável, quer para a empresa quer para o Estado pois o resultado obtido pode sempre ser para menos, assim prejudicando ou a empresa que irá pagar mais do que ou o Estado que irá receber um imposto menor do que seria;