Entendendo a Administração Tributária que a liquidação de IVA devia ser efectuada sobre a totalidade da facturação, aqui sustentado pela Recorrente, e defendendo a Recorrida, por sua vez, que o IVA apenas é devido nas facturas emitidas pela sucursal, por as operações constantes das facturas emitidas pela sociedade mãe deverem ser tidas como intracomunitárias, estando, por isso, tais operações isentas, cabendo ao adquirente dos bens o pagamento do IVA.