1949年中共建政後，燕京大學資產由中華人民共和國政府接管，跟住俾人分拆。民族學系、社會學系、語文系（民族語文系）、歷史系併入中央民族學院（今中央民族大學），法學院併入北京政法學院（今中國政法大學）、中國人民大學，經濟學系併入中央財經學院（今中央財經大學），其他文科、理科多併入北京大學，工學院併入清華大學，醫學系併入中國協和醫學院。校舍由北京大學接收，成為北京大學嘅主要校園，現已列為古蹟保護。部分校友南遷香港，參與創建崇基學院，亦即係後來嘅香港中文大學創校書院之一。
1949年中共建政後，燕京大學資產由中華人民共和國政府接管，隨後遭到整併：民族學系、社會學系、語文系（民族語文系）、歷史系併入中央民族學院（今中央民族大學），法學院併入北京政法學院（今中國政法大學）、中國人民大學，經濟學系併入中央財經學院（今中央財經大學），其他文科、理科多併入北京大學，工學院併入清華大學，醫學系併入中國協和醫學院。其校舍由北京大學接收，成為北京大學的主要校園，現已列為古蹟保護。此外，其部分人員南遷香港，參與崇基學院的創建，為香港中文大學創始的成員書院之一。