In vitro bindes fondaparinux med høj affinitet og specifikt til ATIII- protein, [hvilket giver en plasmakoncentrationsbinding] (98, 6- 97, 0% i koncentrationsintervallet fra 0, 5 til 2 mg/ l).
In vitro bindet Fondaparinux, abhängig von der Plasmakonzentration der entsprechenden Dosis, mit einer starken spezifischen Affinität an Antithrombin (98,6%-97,0% in dem Konzentrationsbereich von 0,5-2 mg/l).