Den aktive metabolit er en selektiv hæmmer af influenzavirus- neuraminidaseenzymer som er glycoproteiner der findes på virusoverfladen.
Oseltamivir-resistente Viren, die von mit Oseltamivir behandelten Patienten isoliert wurden und Oseltamivir-resistente Laborstämme von Influenzaviren wiesen Mutationen in den N1- und N2-Neuraminidasen auf.