Akkumulation af andre mutationer i proteasegenet (bl. a. ved positionerne 20, 33, 36, 46, 54, 71 og 90) kan også bidrage til resistens over for ritonavir.
Die Reduktion der antiretroviralen Aktivität von Ritonavir ist hauptsächlich mit den Protease- Mutationen V82A/F/T/S und 184V assoziiert.