Metaboliseringen af sertindol forøges signifikant af stoffer, der er kendt for at virke inducerende på CYP isozymerne, især carbamazepin og phenytoin, som kan nedsætte plasmakoncentrationen af sertindol med en faktor 2- 3.
In vitro-Studien haben gezeigt, dass hohe Konzentrationen von Sertindol und seinen Hauptmetaboliten die Aktivität von CYP2D6 hemmen.