Mange af de protease- aminosyresubstitutioner, som er fundet at være associeret med resistens over for ritonavir og saquinavir, er også forbundet med resistens over for indinavir.
Viele Aminosäuresubstitutionen in der Protease, die mit einer Resistenz gegen Ritonavir und Saquinavir in Verbindung gebracht werden, spielen auch bei der Resistenz gegen Indinavir eine Rolle.