Den primære metabolisering af nelarabin er O- demethylering vha. adenosindeaminase til dannelse af ara- G, som undergår hydrolyse og danner guanin.
Der Hauptweg der Metabolisierung von Nelarabin verläuft über die O-Demethylierung durch die Adenosindeaminase zum ara-G, aus dem durch Hydrolyse Guanin entsteht.