Zonisamid metaboliseres delvist af CYP3A4 (reduktiv nedbrydning) samt også af N- acetyl - transferaser og konjugering med glukoronsyre.
Zonisamid wird teilweise über CYP3A4 (reduktive Spaltung) sowie über N-acetyl-Transferase und Konjugation mit Glukuronsäure metabolisiert.