I lighed med andre EU- institutioner forventes finanskontrolfunktionen i EMEA i 2002 at blive erstattet med et internt revisionssystem, som mest sandsynligt vil blive varetaget af Europa- Kommissionens tjenestegrene.
Ebenso wie bei anderen EU-Einrichtungen wird die Finanzkontrollfunktion bei der EMEA 2002 voraussichtlich durch ein System interner Audits ersetzt, die aller Wahrscheinlichkeit nach von den Diensten der Europäischen Kommission durchgeführt werden.