Kontakten med de andre decentraliserede EU- agenturer øgedes i 1998 - bl. a. deltog EMEA sammen med Det Europæiske Overvågningscenter for Narkotika og Narkotikaovervågning i udarbejdelsen af en vejledning vedrørende risikovurdering af nye former for syntetisk narkotika.
In dem Bemühen, ihre Kontakte zu anderen dezentralen EU-Einrichtungen auszubauen, erarbeitete die EMEA gemeinsam mit der Europäischen Beobachtungsstelle für Drogen und Drogensucht einen Leitfaden für die Risikobewertung neuer synthetischer Drogen.