Udpegede lægemidler til sjældne sygdomme er berettiget til nedsættelse af de gebyrer, EMEA opkræver, når ansøgningerne vedrører protokolbistand, markedsføringstilladelse eller andre forskriftsmæssige foranstaltninger.
Ausgewiesene Arzneimittel für seltene Leiden kommen in den Genuss von ermäßigten Gebühren der EMEA bei Anträgen auf Unterstützung bei der Erstellung von Prüfplänen, Genehmigung für das Inverkehrbringen und anderen zulassungsrelevanten Maßnahmen.