Da sapropterindihydrochlorid er en syntetisk version af det naturligt forekommende 6R- BH4, må det rimeligvis kunne antages at metaboliseres på samme vis, inklusive 6R- BH4- regeneration.
Da Sapropterindihydrochlorid eine synthetisch hergestellte Variante des natürlich vorkommenden 6R-BH4 ist, kann man begründet davon ausgehen, dass es demselben Metabolismus unterliegt, inklusive der Rückbildung zu 6R-BH4.