Sertindol undergår vidtgående metabolisering via CYP2D6 og CYP3A isozymerne, som udgør dele af cytochrom P450- systemet.
In klinischen Studien wurde eine niedrige Inzidenz (vergleichbar mit der von Placebo) von extrapyramidalen Symptomen unter Sertindol-Behandlung beobachtet.