Resistens mod nelfinavir, defineret som tilstedeværelse af D30N eller L90M mutation i protease, blev observeret hos 41/ 96 (43%) forsøgspersoner.
Über Embryofetotoxizität (Fehlgeburt, verringerte fötale Lebensfähigkeit, verringertes fötales Körpergewicht, höhere Häufigkeit von Skelettveränderungen) und postnatale Entwicklungstoxizität (verringerte Überlebensfähigkeit der Jungen) wurde bei Ratten nach Gabe von toxischen Dosen an die Muttertiere berichtet.