Ud over hydrolyse elimineres topotecan overvejende renalt som en mindre komponent, der metaboliseres til N- desmetylmetabolit (SB- 209780) og er fundet i plasma, urin og fæces.
Außer durch Hydrolyse wird Topotecan vorwiegend renal eliminiert, wobei ein geringer Teil zum N-Desmethyl-Metaboliten (SB-209780) verstoffwechselt wird, der im Plasma, Urin und den Faeces identifiziert werden konnte.