De hyppigste bivirkninger ved Naglazyme, der kunne observeres i undersøgelserne, (som optræder hos flere end 1 ud af 10 patienter) var ørepine, dyspnø (åndedrætsbesvær), mavesmerter, almindelige smerter og reaktioner på infusionen (så som feber, kulderystelser, udslæt og nældefeber).
Die häufigsten Nebenwirkungen von Naglazyme in Studien (beobachtet bei mehr als 1 von 10 Patienten) waren Ohrenschmerzen, Dyspnoe (Atembeschwerden), Bauchschmerzen sowie allgemein Schmerzen und Reaktion auf die Infusion (darunter Fieber, Schüttelfrost, Haut- und Nesselausschlag).