Vázba bivalirudinu na trombin, a tedy jeho aktivita, je reverzibilní proces, protože trombin pomalu štěpí vazbu Arg3- Pro4 bivalirudinu,, což má za následek obnovení účinku trombinu.
Vezava bivalirudina na trombin in njegova aktivnost je tudi reverzibilna, saj trombin počasi cepi bivalirudinijevo vez Arg3- Pro4, kar povzroči povrnitev funkcije aktivnega mesta trombina.