Ve vážných, ale vzácných případech (pravděpodobnost výskytu u méně než 1 z 1000 pacientek) může být syndrom ovariální hyperstimulace s jasně zvětšenými ovarii doprovázen hromaděním tekutiny v břiše či hrudníku i vážnějšími tromboembolickými komplikacemi.
V hudih, vendar redkih primerih (verjetnost pojava pri manj kot 1 od 1000 bolnikov), se lahko sindromu hiperstimulacije jajčnikov z izrazito povečanimi jajčniki, pridruži še nabiranje tekočine v trebuhu ali prsnem košu, kakor tudi zasuk jajčnika ali hujši tromboembolični zapleti.