Do 72 hodin po intravenózním podání je kolem 75% dávky vyloučeno v moči, nejčastěji jako metabolity, a méně než 10% v původní formě.
72 ur po intravenski uporabi fentanila se v urin izloči okoli 75% odmerka, večinoma v obliki metabolitov, z manj kot 10% nespremenjenega zdravila.