V řadě testů in vitro i in vivo, zahrnujících test reverzibility bakteriální mutace (Amesův test), test myšího lymfomu, mikronukleární test na potkanech a test chromosomových aberací v lidských lymfocytech, amprenavir nevykázal mutagenní ani genotoxické působení.
Z in vitro in in vivo testi genotoksičnosti, vključno z bakterijsko reverzno mutacijo (Ames test), mišjimi limfomi, s podganjimi mikronukleusi in kromosomsko aberacijo na humanih perifernih limfocitih, je bilo ugotovljeno, da amprenavir ni mutagen ali genotoksičen.