Obráceně, amprenavir si udržuje aktivitu k některým izolátům s rezistencí k jiným inhibitorům proteázy, a tato zachovaná aktivita by závisela na počtu a typu mutací způsovujících rezistenci k inhibitorům proteázy v izolátech.
Ta ohranjena učinkovitost je odvisna od števila in tipa rezistenčnih mutacij proteaze izolatov.