Přípravek Zonegran také působí na neurotransmiter kyselinu gamaaminomáselnou (GABA), což je chemická látka, která umožňuje vzájemnou komunikaci mezi nervovými buňkami.
Zonisamid z blokiranjem teh kanalčkov prepreči, da bi živčne celice uskladile svoje aktivnosti, in prepreči širjenje nenormalne električne aktivnosti po možganih.