Přesto však byly mezi oběma přípravky zaznamenány rozdílnosti: v porovnání s výsledky dosaženými u pacientů léčených referenčním přípravkem se ve skupině léčené Alpheonem vyskytlo více pacientů, u kterých došlo k návratu onemocnění po ukončení léčby, a pacienti léčení Alpheonem vykazovali rovněž více vedlejších účinků.
Vendar pa so med obema zdraviloma zaznali določene razlike: bolezen se je po zaključku zdravljenja v večjem številu primerov ponovila pri bolnikih, zdravljenih z zdravilom Alpheon, kot pri bolnikih, zdravljenih z referenčnim zdravilom, poleg tega pa so pri zdravilu Alpheon opazili več neželenih učinkov.