Nelfinavir vykazoval aditivní až synergický efekt proti HIV v kombinaci s inhibitory reverzní transkriptázy zidovudinem (ZDV), lamivudinem (3TC), didanosinem (ddI), zalcitabinem (ddC) a stavudinem (d4T) bez zvýšené cytotoxicity.
Nelfinavir je imel v kombinaciji z zaviralci reverzne transkriptaze, zidovudinom (ZDV), lamivudinom (3TC), didanozinom (ddI), zalcitabinom (ddC) in stavudinom (d4T), aditivne do sinergistične učinke proti virusu HIV brez povečane citotoksičnosti.