U HIV izolátů získaných od 5 pacientů během léčby nelfinavirem bylo prokázáno 5 až 93- násobné snížení citlivosti vůči nelfinaviru in vitro ve srovnání s odpovídajícími izoláty na začátku léčby, ale nebylo prokázáno shodné snížení citlivosti vůči indinaviru, ritonaviru, saquinaviru nebo amprenaviru in vitro.
Navzkrižna odpornost: pri izolatih HIV, ki so jih pridobili od 5 bolnikov med zdravljenjem z nelfinavirjem, so odkrili 5 - do 93- krat manjšo občutljivost za nelfinavir v in vitro v primerjavi z izolati ob začetku zdravljenja, niso pa odkrili skladnega zmanjšanja občutljivosti za indinavir, ritonavir, sakvinavir ali amprenavir in vitro.