Ve vzácných případech se u pacientů mohou vyvinout protilátky na omalizumab stejně tak jako na všechny humanizované monoklonální protilátky odvozené od rekombinantní DNA.
Podobno kot pri vseh humaniziranih monoklonskih protitelesih, pridobljenih iz rekombinantne DNA, se lahko pri bolnikih v redkih primerih razvijejo protitelesa proti omalizumabu.