Biotransformace emtricitabinu zahrnuje oxidaci poloviny thiolu, přičemž vzniká 3 '- sulfoxid diastereoisomer (přibližně 9% dávky), a konjugaci s kyselinou glukuronovou, přičemž vzniká 2' - O- glukuronid (přibližně 4% dávky).
Biotransformacija emtricitabina vključuje oksidacijo tiolnega dela molekule, pri čemer nastanejo 3 '- sulfoksid diastereomere (približno 9% odmerka) in konjugacijo z glukuronsko kislino, pri čemer nastane 2' - O- glukuronid (približno 4% odmerka).