Oproti systémově podávanému cytarabinu, který je rychle metabolizován na ara- U, je konverze na ara- U v cerebrospinální tekutině po intratekálním podání zanedbatelná, a to kvůli významně nižší aktivitě cytidindeaminázy ve tkáních centrálního nervového systému a v cerebrospinální tekutině.
V primerjavi s sistemsko danim citarabinom, ki se hitro presnovi v ara- U, je pretvorba v ara- U v cerebrospinalni tekočini po intratekalnem odmerjanju zanemarljiva zaradi značilno manjše aktivnosti citidin deaminaze v tkivih osrednjega živčevja in cerebrospinalni tekočini.