Abakavir proniká do mozkomíšního moku (viz bod 5. 2) a bylo prokázáno, že snižuje hladiny HIV- 1 RNA v mozkomíšním moku.
Abakavir prehaja v cerebrospinalno tekočino (CSF – » cerebrospinal fluid «) (glejte poglavje 5. 2) in izkazalo se je, da zmanjšuje raven HIV- 1 RNK v CSF.