In vitro topotekan neinhiboval enzymy CYP1A2, CYP2A6, CYP2C8/ 9, CYP2C19, CYP2D6, CYP2E, CYP3A nebo CYP4A lidského cytochromu P450 ani lidské cytosolové enzymy dihydropyrimidin a xanthinoxidázu.
Topotekan in vitro ni zaviral delovanja encimov človeškega P450 (CYP1A2, CYP2A6, CYP2C8/ 9, CYP2C19, CYP2D6, CYP2E, CYP3A in CYP4A) in tudi ne človeških citosolskih encimov dihidropirimidin - ali ksantin- oksidaze.