V průběhu týdne následujícího po podání je vyloučeno 92 až 98% podané dávky gemcitabinu, 99% močí převážně ve formě dFdU a 1% dávky je vyloučeno ve stolici.
V tednu po dajanju gemcitabina se izloči 92 do 98% odmerka gemcitabina, 99% z urinom, zlasti v obliki dFdU in 1% z blatom.