Na základě in vitro údajů se metabolizmus azacitidinu nezdá být zprostředkován izoenzymy cytochromu P450 (CYP), UDP- glukuronosyltransferázou (UGT), sulfotransferázou (SULT) a glutathiontransferázou (GST); interakce s těmito metabolickými enzymy in vivo se proto považují za nepravděpodobné.
Na podlagi podatkov in vitro kaže, da na presnovo azacitidina ne vplivajo izoencimi citokroma P450 (CYPs), glukuronoziltransferaze UDP (UGTs), sulfotransferaze (SULTs) in glutation transferaze (GSTs); zato ni verjetno, da bi prišlo do interakcij, povezanih s temi presnovnimi encimi in vivo.