Mechanismus účinku Indinavir inhibuje rekombinantní proteázy HIV- 1 a HIV- 2 přibližně s desetinásobně vyšší selektivitou pro proteázy HIV- 1 než proteázy HIV- 2.
Mehanizem delovanja Indinavir zavira rekombinantno HIV- 1 in HIV- 2 proteazo; za prvo je približno desetkrat bolj selektiven kot za drugo.