Mezi nejčastější vedlejší účinky přípravku Aldurazyme u pacientů starších pěti let (zaznamenané u více než 1 pacienta z 10) patří bolest hlavy, nauzea (pocit nevolnosti), abdominální bolesti (bolesti břicha), vyrážka, artropatie (poškození kloubů), artralgie (bolesti kloubů) bolesti v zádech nebo v končetinách (rukách a nohách), návaly, pyrexie (horečka) a reakce v místě vpichu.
Najpogostejši neželeni učinki zdravila Aldurazyme pri bolnikih, starih več kot pet let (opaženi pri več kot 1 bolniku od 10), so glavobol, navzeja (občutek slabosti), bolečina v trebuhu, izpuščaji, artropatija (poškodba sklepov), artralgija (bolečine v sklepih), bolečine v hrbtu, bolečine v okončinah (v rokah in nogah), rdečica, pireksija (povišana telesna temperatura) in reakcije na mestu infundiranja.