Stejně jako v případě všech ostatních vakcín, pokud je přípravek RotaTeq používán u velmi předčasně narozených dětí, existuje riziko apnoe (krátké zástavy dechu).
Tako kot pri vseh cepivih, obstaja tudi pri cepivu RotaTeq tveganje za razvoj apneje (kratki premori med dihanjem), če se daje prezgodaj rojenim otrokom.