Jelikož mechanismus interakce je odlišný pro MAO- Is podávané s mirtazapinem v porovnání s MAO- Is a SSRIs, je nepravděpodobné, že by riziko serotoninového syndromu bylo stejně vysoké jako u jiných serotonergních antidepresiv, jako jsou SSRIs.
Ker je mehanizem medsebojnega delovanja pri zaviralcih monoaminskih oksidaz (MAOIs) z mirtazapinom drugačen kot pri medsebojnem delovanju zaviralcev monoaminskih oksidaz (MAOIs) in selektivnih zaviralcev ponovnega privzema serotonina (SSRIs), je verjetnost serotoninskega sindrom enako visoka kot pri drugih serotonergičnih antidepresivih, kot so na primer selektivni zaviralci ponovnega privzema serotonina.