Díky své primární vazbě na receptory RXR má bexaroten menší tendenci vyvolávat toxické účinky na tkáně sliznic, pokožky, nehtů a vlasů a způsobovat bolesti kloubů a svalů, což jsou účinky často hlášené u přípravků s vazbou na receptory kyseliny retinové (RAR).
Na osnovi svoje primarne RXR - vezavne aktivnosti je manj verjetno, da beksaroten povzroča mukokutano toksičnost ali toksičnost za nohte in lase, artralgijo in mialgijo, katerih pojav je pogost pri učinkovinah, ki se vežejo na receptorje retinojske kisline (RAR, retinoic acid receptor).