Tak jako u jiných léčivých přípravků v této skupině i u ciprofloxacinu byly zaznamenány poruchy kloubů (hmotnost nesoucích kloubů) u nedospělých zvířat.
Kot pri drugih zdravilih iz te skupine so tudi za ciprofloksacin poročali, da povzroča okvare nosilnih sklepov živali, pri katerih razvoj še ni končan.