Biotransformace emtricitabinu zahrnuje oxidaci poloviny thiolu a tvorbu 3 '- sulfoxid diastereomerů (přibližně 9% dávky) a sloučení s kyselinou glukuronovou tvoří 2' - O- glukuronid (přibližně 4% dávky).
Biotransformacija emtricitabina vključuje oksidacijo tiolne skupine, pri čemer nastanejo diastereomeri 3 '- sulfoksida (približno 9% odmerka), in konjugacijo z glukuronsko kislino, pri čemer nastane 2' - O- glukuronid (približno 4% odmerka).