Následující nežádoucí účinky byly pozorovány při léčbě Exelon tobolkami a perorálním roztokem, avšak nevyskytly se v klinických studiích s náplastí Exelon 9, 5 mg/ 24 h transdermální náplasti: závratě (velmi často); agitace, somnolence, malátnost, tremor, zmatenost, zvýšené pocení (často); insomnie, náhodné pády, zvýšení jaterních testů (méně často); epileptické záchvaty, duodenální vředy, angina pectoris (vzácně); srdeční arytmie (např. atrioventrikulární blok, fibrilace síní a tachykardie), hypertenze, pankreatitida, gastrointestinální krvácení, halucinace (velmi vzácně); a několik případů silného zvracení spojeného s rupturou jícnu (neznámá četnost výskytu).
Naslednje neželene učinke so opažali samo pri uporabi kapsul in peroralne raztopine Exelon, ne pa v kliničnih študijah s transdermalnimi obliži Exelon 9, 5 mg/ 24 h: vrtoglavost (zelo pogosto); agitacijo, somnolenco, splošno slabo počutje, tremor, zmedenost, povečano potenje (pogosto); nespečnost, nezgodne padce, zvišane jetrne funkcijske teste (občasno); napade krčev, razjede dvanajstnika, angino pektoris (redko); srčne aritmije (na primer atrioventrikularni blok, atrijsko fibrilacijo in tahikardijo), hipertenzijo, pankreatitis, krvavitev v prebavila, halucinacije (zelo redko); in nekaj primerov hudega bruhanja, ki je bilo povezano z rupturo požiralnika (pogostnost ni znana).