Nebyly pozorovány klinicky významné interakce mezi nelfinavirem a nukleosidovými analogy (zvl. zidovudinem plus lamivudinem, stavudinem a stavudinem plus didanosinem).
Klinično pomembnih medsebojnih delovanj med nelfinavirjem in nukleozidnimi analogi (posebno kombinacije zidovudin in lavimudin, stavudin ter stavudin in didanozin) niso opazili.