Přesný mechanismus účinku přípravku Avonex u roztroušené sklerózy zatím není znám, nicméně zdá se, že interferon beta zklidňuje imunitní systém a působí jako prevence proti relapsům roztroušené sklerózy.
Natančen način delovanja zdravila Avonex pri MS še ni popolnoma znan, toda vse kaže, da interferon beta pomirja imunski sistem in preprečuje ponovne napade MS.