Dabigatran je vylučován zejména v nezměněné formě močí rychlostí přibližně 100 ml/ min, což odpovídá rychlosti glomerulární filtrace.
Dabigatran se pretežno izloča v nespremenjeni obliki s sečem, in sicer s hitrostjo približno 100 ml/ min, kar ustreza hitrosti glomerulne filtracije.