Fentanyl je hlavně metabolizován isoenzymovým systémem 3A4 cytochromu P450 (CYP3A4), proto může při souběžném podávání Effentory s léčivy, která ovlivňují aktivitu CYP3A4, dojít k potenciálním interakcím.
Glavna presnovna pot fentanila je preko izoencimskega sistema (CYP3A4) človeškega citokroma P450 3A4, zato se lahko pojavijo interakcije, če se daje zdravilo Effentora hkrati z zdravili, ki vplivajo na dejavnost CYP3A4.