Mezi nejčastější nežádoucí účinky různého stupně závažnosti s alespoň možnou souvislostí s entekavirem patřila bolest hlavy (9%), únava (6%), závratě (4%) a nauzea (3%).
Najpogostejši neželeni učinki katere koli resnosti, za katere je obstajala vsaj možna povezava z entekavirjem, so bili: glavobol (9%), utrujenost (6%), omotica (4%) in navzea (3%).