Nelfinavir se reverzibilně váže na aktivní místo HIV proteázy a zabraňuje štěpení polyproteinových řetězců, což vede k formování nezralých a tedy neinfekčních virových částic.
Nelfinavir se reverzibilno veže na aktivno mesto HIV - proteaze in prepreči cepitev polibeljakovin, kar povzroči nastanek nezrelih neinfektivnih virusnih delcev.