Nejprve musí dojít k difuzi či transportu klofarabinu do cílových buněk, kde následně dojde k fosforylaci na mono - a bifosfáty prostřednictvím nitrobuněčných kináz, a nakonec na aktivní konjugát klofarabin 5´- trifosfát.
Klofarabin mora najprej difundirati, da bi se lahko transportiral v ciljne celice, kjer ga znotrajcelične kinaze zaporedno fosforilirajo v mono - in difosfate, in na koncu v aktivni konjugat, klofarabin 5 ’ - trifosfat.