Jsou známy případy, kdy intratekálně podávaný cytarabin vyvolával nevolnost, zvracení a závažnou toxicitu centrálního nervového systému vedoucí až k oslepnutí, myelopatii a dalším neurologickým důsledkům a někdy i k permanentnímu neurologickému deficitu.
Za intratekalno uporabo citarabina so značilni slabost, bruhanje in huda toksičnost osrednjega živčevja vključno s slepoto, mielopatijo in drugimi nevrotoksičnimi učinki, ki včasih povzročijo tudi stalni nevrološki primanjkljaj.