Zatímco IgM odpověď je po vakcinaci ojedinělá, pozitivní výsledky IgM- ELISA testu jsou silným indikátorem přirozené nákazy West Nile virem. V případě podezření na infekci u zvířat po vakcinaci, je potřebné otestovat IgM protilátky a stanovit, zda byla zvířata skutečně infikovaná nebo vakcinovaná.
Če na infekcijo sumite zaradi pozitivnega IgM odgovora, so potrebni dodatni testi, da se ugotovi ali je bila žival okužena ali cepljena.