Kombinovaná antiretrovirová léčba byla spojena s metabolickými abnormalitami, jako je hypertriacylglycerolemie, hypercholesterolémie, insulinová rezistence, hyperglykémie a hyperlaktacidémie.
Kombinirano protiretrovirusno zdravljenje povezujejo tudi s presnovnimi motnjami, kot so hipertrigliceridemija in hiperholesterolemija, odpornost na insulin, hiperglikemija in hiperlaktemija.