V kontrolovaných studiích II. a III. fáze bylo studováno přes 4 874 pacientů.
Klinični program za fondaparinuks pri zdravljenju venske trombembolije je bil oblikovan, da bi dokazal učinkovitost fondaparinuksa za zdravljenje globoke venske tromboze (DVT) in pljučne lje embolije (PE).