Přesný mechanismus účinku přípravku Betaferon u roztroušené sklerózy zatím není znám, ale zdá se, že beta- interferon zklidňuje imunitní systém a zabraňuje relapsům onemocnění.
Natančen način delovanja zdravila Betaferon pri MS ni še popolnoma znan, toda zdi se, da interferon beta pomirja imunski sistem in preprečuje recidive MS.