Při podávání alfa interferonů bylo hlášeno široké spektrum autoimunitních a imunitně zprostředkovaných chorob, včetně poruch funkce štítné žlázy, systémového lupus erythematodes, revmatoidní artritidy (nové nebo zhoršené), idiopatické a trombotické trombocytopenické purpury, vaskulitidy a neuropatií, včetně mononeuropatie a Vogtova- Koyanagiho- Haradova syndromu (viz též bod 4. 4, Autoimunitní onemocnění).
Pri uporabi interferonov alfa so poročali o širokem razponu avtoimunskih bolezni in drugih motenj imunskega izvora, vključno z motnjami žleze ščitnice, sistemski lupus eritematosus, reumatoidni arthritis (novonastali ali že poslabšan), idiopatsko in trombotično trombocitopenično purpuro, vaskulitisom, nevropatijami, vključno z mononevropatijami in sindromom Vogt- Koyanagi- Harada (glejte tudi poglavje 4. 4, Avtoimunske bolezni).