Celkovýá výskytincidence nežádoucích účinků přisuzovaných léčivu u pacientů léčených kombinací sitagliptinu a metforminu byla porovnatelnýá s metforminem samotným (vždy 14, 0%) a vyšší než u sitagliptinu samotného (6, 7%), s rozdíly souvisejícími se samotným sitagliptinem primárně v důsledku gastrointestinálních nežádoucích účinků.
Ti neželeni učinki so: anoreksija (Presnovne in prehranske motnje; pogostnost občasna) in zmanjšanje telesne mase (Preiskave; pogostnost občasna).