Pemetrexed se primárně vylučuje močí, přičemž 70– 90% podané dávky se odstraní močí v nezměněné formě během prvních 24 hodin po jeho podání.
Pemetreksed se primarno izloča z urinom, 70% do 90% danega odmerka najdemo nespremenjenega v urinu v prvih 24 urah po dajanju.