Protože ciprofloxacin vykazuje určitou aktivitu proti Mycobacterium tuberculosis falešně negativní kultury se mohou objevit, pokud vzorky byly odebrány během léčby ciprofloxacinem.
Ciprofloksacin nekoliko učinkuje proti bakteriji Mycobacterium tuberculosis, zato se, kadar vzorce odvzemamo med zdravljenjem s ciprofloksacinom, lahko pojavijo lažno negativne kulture.