Konkrétní mechanismus, kterým anagrelid snižuje počet trombocytů, není plně znám, ačkoliv studiemi in vitro a in vivo bylo potvrzeno, že anagrelid působí selektivně na trombocyty.
Specifični mehanizem delovanja, s katerim anagrelid zmanjša število krvnih ploščic, še ni povsem znan, čeprav je bilo iz informacij in vitro in in vivo študij potrjeno, da je anagrelid selektiven do krvnih ploščic.