Údaje, týkající se zkřížené rezistence mezi NNRTI nevirapinem a inhibitory reverzní transkriptázy ze skupiny NRTI jsou velmi omezené.
Na voljo je zelo malo podatkov o navzkrižni odpornosti med nenukleozidnim zaviralcem reverzne transkriptaze nevirapinom in nukleozidnimi zaviralci reverzne transkriptaze.