Vedlejší účinky se u pacientů užívajících přípravek Circadin nevyskytují často, ale mezi nejčastější vedlejší účinky (pozorované u 1 z 10 až 1 z 1 000 pacientů) patří podrážděnost, nervozita, neklid, nespavost, abnormální sny, migréna, psychomotorická hyperaktivita (neklid se zvýšenou aktivitou), závratě, ospalost, bolest břicha, zácpa, sucho v ústech, hyperbilirubinémie (zvýšené hladiny bilirubinu v krvi, což je rozpadový produkt červených krvinek, který vyvolává zažloutnutí kůže a očí), hyperhidróza (nadměrné pocení), astenie (slabost) a zvýšení tělesné hmotnosti.
Neželeni učinki so pri bolnikih, ki se zdravijo z zdravilom Circadin, občasni, vendar pa so najpogostejši med njimi (opaženi pri 1 do 10 bolnikih izmed 1. 000) razdražljivost, nervoza, nemirnost, nespečnost, nenavadne sanje, migrena, psihomotorična hiperaktivnost (nemirnost s povečano aktivnostjo), omotica, zaspanost, bolečine v trebuhu, zaprtje, suha usta, hiperbilirubinemija (povečane ravni bilirubina v krvi, produkta razgradnje rdečih krvničk, ki lahko povzroči rumeno obarvanje kože in oči), hiperhidroza (prekomerno potenje), astenija (šibkost) in povečana telesna masa.