Cidofovirem selektované mutanty měly mutaci genu DNA polymerázy a byla u nich zkřížená rezistence na ganciklovir, byly však citlivé na foskarnet.
S cidofoviroim selekcionirani mutanti so imeli mutacijo v genu za DNA polimerazo in so bili navzkrižno odporni proti gancikloviru, a občutljivi za foskarnet.