Studie prováděné in vitro s použitím lidských jaterních mikrozomů vykazují nulovou nebo malou (< 25%) inhibici isozymů 1A2, 2A6, 2B6, 2C8, 2C9, 2C19, 2D6, 2E1 nebo 3A4 cytochromu P450 při hladinách zonisamidu přibližně dvojnásobných nebo vyšších, než jsou klinicky významné sérové hladiny nenavázaného zonisamidu.
In vitro študije v katerih so uporabili humane jetrne mikrosome, niso pokazale ali pa so pokazale nizko (< 25%) inhibicijo izoencimov 1A2, 2A6, 2B6, 2C8, 2C9, 2C19, 2D6, 2E1 ali 3A4 citokroma P450, pri koncentracijah zonisamida, ki so bile dva ali večkrat višje od klinično pomembnih nevezanih 15 serumskih koncentracij.