Podobně jako je tomu u všech vakcín, nemůže ani Fendrix úplně chránit proti infekci virem hepatitidy B, a to ani tehdy, když jste dostali všechny čtyři dávky základního očkování.
Podobno kot velja pri drugih cepivih, se tudi s cepivom Fendrix okužba z virusom hepatitisa B ne more popolnoma preprečiti in to kljub popolnemu osnovnemu cepljenju s štirimi odmerki cepiva.