V současnosti existují aktuální informace o zkřížené rezistenci mezi amprenavirem a jinými inhibitory proteázy pro všechny 4 cesty fosamprenavirové rezistence buď samotné, nebo v kombinací s jinými mutacemi.
Podatki o navzkrižni odpornosti med amprenavirjem in drugimi zaviralci proteaz so za vse štiri mehanizme odpornosti fosamprenavirja, same ali v kombinaciji z drugimi mutacijami.