Mezi nejběžnější vedlejší účinky přípravku Truvada (zaznamenané u více než 1 pacienta z 10) patří hypofosfatémie (nízké hladiny fosfátů v krvi), bolest hlavy, závratě, průjem, zvracení, nauzea (pocit nevolnosti) a zvýšené hodnoty obsahu kreatinkinázy (enzym přítomný ve svalech) v krvi.
Najpogostejši neželeni učinki zdravila Truvada (opaženi pri več kot 1 od 10 bolnikov) so hipofosfatemija (nizke ravni fosfatov v krvi), glavobol, vrtoglavica, diareja, bruhanje, slabost in povišane ravni kreatin kinaze (encim, ki ga najdemo v mišičju) v krvi.