V průběhu zkoumání přípravku ATryn byly nejběžnějšími vedlejšími účinky (zaznamenanými u 1 až 10 pacientů ze 100) závrať, bolest hlavy, krvácení (včetně krvácení v místě vpichu a pooperačního krvácení), nauzea (pocit nevolnosti) a sekrece z rány (výtok z místa operační rány).
V študijah zdravila ATRyn so bili najpogostejši neželeni učinki (opaženi pri 1 do 10 bolnikih od 100) omotica, glavobol, hemoragija (krvavitev, vključno s krvavitvijo na mestu injiciranja ali krvavitev po operaciji), navzeja (slabost) in izcedek iz rane (izločki na mestu kirurškega reza).