V důsledku snížení žaludeční kyselosti, způsobeného lansoprazolem, lze v žaludku očekávat zvýšení počtu bakterií normálně přítomných v gastrointestinálním traktu.
Zmanjšana kislost v želodcu zaradi lansoprazola lahko poveča število bakterij, ki so normalno prisotne v prebavilih.