Hlavním metabolitem zidovudinu jak v plasmě tak v moči je jeho 5´- glukuronid, který představuje přibližně 50 až 80% podané dávky eliminované renální exkrecí.
Zidovudin 5 '- glukuronid je glavni presnovek zidovudina v plazmi in v urinu, nanj odpade približno 50 – 80% apliciranega odmerka, ki se izloči preko ledvic.