Některé údaje o genotypické rezistenci svědčí o tom, že u většiny pacientů po selhání léčby NNRTI vykazují virové kmeny zkříženou rezistenci k jiným NNRTI.
Nekateri podatki o genotipski odpornosti kažejo, da so pri večini bolnikov, pri katerih so nenukleozidni zaviralci reverzne transkriptaze neuspešni, virusni sevi navzkrižno odporni proti drugim nenukleozidnim zaviralcem reverzne transkriptaze.