U pacientů bylo po podávání DepoCytu pozorováno také přechodné zvýšení bílkovin a bílých krvinek v cerebrospinální tekutině; to bylo zjištěno i po intratekální léčbě methotrexatem nebo cytarabinem.
Po uporabi DepoCyta in intratekalnem zdravljenju z metotreksatom ali citarabinom so pri bolnikih opazili tudi prehodna povišanja beljakovin v cerebrospinalni tekočini in belih krvnih celic.