Protože do mateřského mléka se vylučuje mnoho látek, kojící matky mají být poučeny, aby vysadily cidofovir nebo ukončily kojení, pokud pokračují v užívání cidofoviru.
Ker se v materino mleko izločajo številne snovi, je treba doječim materam naročiti, naj nehajo uporabljati cidofovir oz. naj nehajo dojiti, če nadaljujejo z uporabo cidofovira.