Ve studiích TORO 1 a TORO 2 byly nejčastěji udávanými nežádoucími účinky průjem (výskyt u 38 pacientů, kterým byl podáván Fuzeon v kombinaci s ostatními antiretrovirotiky oproti 73 pacientům léčeným ostatními antiretrovirotiky bez Fuzeonu na 100 paciento- roků) a nevolnost (u 27 pacientů, kterým byl podáván Fuzeon v kombinaci s ostatními antiretrovirotiky oproti 50 pacientům léčeným ostatními antiretrovirotiky bez Fuzeonu na 100 paciento- roků).
Najbolj pogosto poročani dogodki, ki so se pojavili v študijah TORO 1 in TORO 2 so bili diareja (38 bolnikov z dogodkom na 100 bolnikovih let v skupini, ki je prejemala zdravilo Fuzeon in optimizirano temeljno zdravljenje, 73 bolnikov z dogodkom na 100 bolnikovih let v skupini, ki je prejemala optimizirano temeljno zdravljenje) in navzea (27 bolnikov z neželenim dogodkom na 100 bolnikovih let v skupini, ki je prejemala zdravilo Fuzeon in optimizirano temeljno zdravljenje, 50 bolnikov z neželenim dogodkom na 100 bolnikovih let v skupini, ki je prejemala optimizirano temeljno zdravljenje).