V klinických studiích s dobou léčby 48 týdnů a s následným 24týdenním obdobím sledování byl bezpečnostní profil Pegasysu u chronické hepatitidy B podobný tomu, jaký byl zaznamenán u chronické hepatitidy C.
Z izjemo pireksije je bila frekvenca večine poročanih neželenih učinkov znatno manjša pri kroničnem hepatitisu B, zdravljenem samo z zdravilom Pegasys v primerjavi z bolniki s kroničnim hepatitisom C, zdravljenimi le z zdravilom Pegasys (glejte preglednico 4).