Má se za to, že renální vylučování agalsidázy alfa je minoritní cestou clearance, jelikož její farmakokinetické parametry nejsou ovlivněny narušenou funkcí ledvin.
Ledvično izločanje agalzidaze alfa velja za manj pomembno pot očistka, saj ledvična okvara ne vpliva na spremembo farmakokinetičnih parametrov.