Celkovýá výskytincidence nežádoucích účinků přisuzovaných léčivu u pacientů léčených kombinací sitagliptinu a metforminu byla porovnatelnýá s metforminem samotným (vždy 14, 0%) a vyšší než u sitagliptinu samotného (6, 7%), s rozdíly souvisejícími se samotným sitagliptinem primárně v důsledku gastrointestinálních nežádoucích účinků.
Z zdravilom povezani neželeni učinki, o katerih so pri bolnikih, ki so se zdravili s sitagliptinom, poročali pogosteje (> 0, 2% in razlika > 1 bolnik) kot pri bolnikih, ki so prejemali placebo, so: glavobol, hipoglikemija, zaprtost in omotica.