Nežádoucí účinky, které zkoušející považoval za související s podáváním léku, byly popsány přibližně u 4% pacientů léčených aprepitantem v dávce 40 mg na ve srovnání s přibližně 6% pacientů, kteří dostávali ondansetron i. v. v dávce 4 mg.
O neželenih učinkih, ki so jih raziskovalci ocenili kot povezane z zdravilom, so poročali pri približno 4% bolnikov, ki so se zdravili z aprepitantom v odmerku 40 mg in pri približno 6% bolnikov, ki so se zdravili z ondansetronom v odmerku 4 mg intravensko.