Emtricitabin je fosforylován buněčnými enzymy a vzniká emtricitabin 5 '- trifosfát, který kompetitivně inhibuje reverzní transkriptázu HIV- 1, což vede k ukončení DNA řetězce.
Celični encimi fosforilirajo emtricitabin v emtricitabin 5 '- trifosfat, ki kompetitivno inhibira HIV- 1 reverzno transkriptazo, kar rezultira v prekinitvi verige DNA.