Vareniklin je vysoce selektivní a váže se silněji na α4β2 subtyp receptorů (Ki=0, 15 nM) než na jiné běžné nikotinové receptory (α3β4 Ki=84 nM, α7 Ki= 620 nM, α1βγδ Ki= 3400 nM) nebo na nenikotinové receptory a transportéry (Ki > 1µM, kromě 5- HT3 receptorů:
Vareniklin je močno selektiven in se na podvrsto receptorjev α4β2 veže močneje (Ki = 0. 15nM) kot na druge pogoste nikotinske receptorje (α3β4 Ki = 84 nM, α7 Ki = 620 nM, α1βγδ Ki = 3, 400 nM) ali na nenikotinske receptorje in transporterje (Ki > 1 µM, razen na receptorje 5- HT3: