Mezi nejčastější vedlejší účinky u přípravku Yondelis (pozorované u více než 1 pacienta z 10) patří zvýšené hladiny kreatinfosfokinázy v krvi (ukazatel svalového metabolismu) a kreatininu (ukazatel onemocnění ledvin), snížené hladiny albuminu v krvi (ukazatel onemocnění jater), neutropenie (nízké hladiny neutrofilů, což je typ bílých krvinek), trombocytopenie (nízké hladiny krevních destiček v krvi), anémie (nízké hladiny červených krvinek), leukopenie (nízké hladiny leukocytů, což je typ bílých krvinek), bolesti hlavy, zvracení, nauzea (nevolnost), zácpa, anorexie (nechutenství), únava, astenie (slabost), hyperbilirubinemie (vysoké hladiny bilirubinu v krvi) a zvýšené hladiny jaterních enzymů v krvi (alaninaminotransferáza, aspartátaminotransferáza, alkalická fosfatáza a gammaglutamyltransferáza).
Najpogostejši neželeni učinki zdravila Yondelis (opaženi pri več kot 1 izmed 10 bolnikov) so povečane ravni kreatin fosfokinaze (znak razgradnje mišic) in kreatinina (znak težav z ledvicami) v krvi, zmanjšane ravni albumina (znak težav z jetri) v krvi, nevtropenija (nizka raven nevtrofilov, vrste belih krvničk), trombocitopenija (nizka raven krvnih ploščic), anemija (nizka raven rdečih krvničk), levkopenija (nizka raven levkocitov, vrste belih krvničk), glavobol, bruhanje, navzeja (slabost), zaprtje, anoreksija (izguba teka), utrujenost, astenija (šibkost), hiperbilirubinemija (visoka raven bilirubina v krvi) in povečana raven jetrnih encimov v krvi (alanin aminotransferaze, aspartat aminotransferaze, alkalin fosfataze in gama glutamiltransferaze).