Podává se denně formou 30 minut trvající nitrožilní infuze, a to 5 po sobě následujících dní, s intervalem 3 týdny do začátku dalšího cyklu.
Začetni odmerek Priporočeni odmerek topotekana je 1, 5 mg/ m2 telesne površine na dan, z intravensko infuzijo, ki traja po 30 minut dnevno, v ciklih po 5 zaporednih dni in s tritedenskimi presledki med začetki vsakega cikla zdravljenja.