Mezi nejběžnější vedlejší účinky přípravku Alli (zaznamenané u více než 1 pacienta z 10) patří olejovitý výtok, únik stolice při flatulenci (plynatosti), nucení na stolici, mastná olejovitá stolice, olejovité vyprazdňování (stolice), flatulence (plynatost) a měkká stolice.
Najpogostejši neželeni učinki zdravila Alli (opaženi pri več kot 1 bolniku od 10) so oljni madeži iz rektuma, vetrovi z uhajanjem, nujnost odvajanja, mastno ali oljnato blato, oljnato odvajanje, vetrovi in mehko blato.