U pacientů s chronickou hepatitidou C léčených interferony alfa se zřídka objeví abnormality funkce štítné žlázy, ať už jde o hypo - či hypertyreózu.
Redko se lahko pri bolnikih zdravljenih z interferonom alfa- 2b zaradi kroničnega hepatitisa C pojavijo motnje delovanja žleze ščitnice - hipertiroza ali hipotiroza.