Mezi nejběžnější vedlejší účinky přípravku Avonex (zaznamenané u více než 1 pacienta z 10) patří bolesti hlavy, chřipkové příznaky, pyrexie (horečka), zimnice a pocení.
Najpogostejši neželeni učinki, o katerih so poročali pri uporabi zdravila Avonex (opaženi pri več kot 1 bolniku od 10), so glavobol, gripi podobni simptomi, pireksija (povišana telesna temperatura), mrzlica in potenje.