Mezi nejběžnější vedlejší účinky přípravku Rebif (zaznamenané u více než 1 pacienta z 10) patří chřipkové příznaky, neutropenie, lymfopenie a leukopenie (nízký počet bílých krvinek), trombocytopenie (nízký počet krevních destiček), anémie (nízký počet červených krvinek), bolest hlavy, zánět a další reakce v místě vpichu injekce a zvýšené hodnoty transamináz (jaterních enzymů).
Najpogostejši neželeni učinki zdravila Rebif (opaženi pri več kot 1 bolniku izmed 10) so gripi podobni simptomi, nevtropenija, limfopenija in levkopenija (nizke koncentracije belih krvničk), trombocitopenija (nizke koncentracije trombocitov), anemija (nizke koncentracije rdečih krvničk), glavobol, vnetje in druge reakcije na mestu injiciranja ter zvišanje transaminaze (jetrnih encimov).