Podobně jako ostatní cytostatika může topotekan způsobit poškození plodu, a proto by měly být ženy v reprodukčním věku poučeny o tom, že nemají v období terapie topotekanem otěhotnět.
Tako kot druga citotoksična zdravila lahko tudi topotekan škoduje plodu, zato morate ženskam v rodni dobi povedati, da med zdravljenjem s topotekanom ne smejo zanositi.