Най- честите нежелани реакции при Rapamune (наблюдавани при повече от 1 на 10 пациенти) са инфекция на пикочните пътища (инфекция на частите от тялото, които отвеждат урината), тромбоцитопения (понижен общ брой на тромбоцитите), анемия (понижен общ брой на червените кръвни клетки), хипокалемия (ниски нива на калий в кръвта), хипофосфатемия (ниски нива на фосфати в кръвта), хиперхолестеролемия (високи нива на холестерол в кръвта), хипергликемия (високи нива на кръвната захар), хипертриглицеридемия (високи нива на триглицеридите, вид мазнини, в кръвта), главоболие, лимфоцеле (събиране на течност около бъбрека), хипертония (високо кръвно налягане), абдоминална (коремна) болка, диария, запек, повдигане (позиви за повръщане), акне (пъпки), артралгия (болки в ставите), периферен оток (подуване, обичайно на краката), пирексия (повишена температура), болка, повишени кръвни нива на лактат дехидрогеназа (маркер за разграждане на тъкани) и повишени кръвни нива на креатинин (маркер за бъбречни проблеми).
De vanligaste biverkningarna (uppträder hos mer än 1 av 10 patienter) är urinvägsinfektion (infektion i de strukturer som leder urinen), trombocytopeni (lågt antal blodplättar), anemi (lågt antal röda blodkroppar), hypokalemi (lågt kaliumvärde i blodet), hypofosfatemi (låga fosfatnivåer i blodet), hyperkolesterolemi (förhöjt kolesterol i blodet), hyperglykemi (höga blodsockernivåer i blodet), hypertriglyceridemi (höga halter av triglycerider, ett slags fettämnen), huvudvärk, lymfocele (vätskeansamling runt njuren), hypertoni (högt blodtryck), buksmärta (magvärk), diarré, förstoppning, illamående, akne (utslag), artralgi (ledvärk), perifert ödem (svullnad som oftast uppträder i benen), pyrexi (feber), smärta, förhöjt laktatdehydrogenas i blodet (ett tecken på vävnadsnedbrytning) samt förhöjda kreatininnivåer i blodet (ett tecken på njurproblem).