Вътреклетъчният метаболизъм на гемцитабин води до образуване на гемцитабин моно -, ди - и трифосфати (dFdCMP, dFdCDP и dFdCTP), от които dFdCDP и dFdCTP се считат за активни.
Intracellulärt bildas mono -, di - och trifosfat av gemcitabin (dFdCMP, dFdCDP och dFdCTP).