Както и при другите антибиотици с широк спектър на действие, продължителната употреба на cefuroxime axetil може да предизвика суперинфекция с резистентни щамове (напр. candida, enterococci и clostridium difficile), което може да наложи прекъсване на лечението.
Liksom med andra bredspektra- antibiotika kan långvarig användning av cefuroximaxetil ge överväxt av icke- känsliga organismer (t. ex. candida, enterococci och clostridium difficile, vilket kan kräva att behandlingen avbryts.