Бактерицидното действие на ципрофлоксацин, като на флуорохинолоново антибактериално средство, се осъществява чрез инхибиране на двата типа топоизомераза ІІ (ДНК- гираза) и топоизомераза IV, които са необходими за репликацията, транскрипцията, репарирането и рекомбинацията на бактериалната ДНК.
Som ett fluorokinolon- antibiotikum ger ciprofloxacin baktericid effekt genom hämning av både typ II - isomeras (DNA- gyras) och topoisomeras IV, vilka krävs för bakteriell DNA- replikering, transkription, reparation och rekombination.