Зидовудин може да взаимодейства и със следните лекарства и може да засили нежеланите ефекти: фенитоин, пробенецид, рифампицин, атоваквон, валпроева киселина, метадон, дапсон, пентамидин, пириметамин, ко- тримоксазол, флуконазол, амфотерицин, флуцитозин, ганцикловир, интерферон, кларитромицин, винкристин, винбластин и доксорубицин.
Zidovudin kan också påverka följande läkemedel och förvärra eventuella biverkningar: fenytoin, probenecid, rifampicin, atovakvon, valproat, metadon, dapson, pentamidin, pyrimetamin, trimsulfa, flukunazol, amfotericin, flucytosin, ganciklovir, interferon, klaritromycin, vinkristin, vinblastin och doxorubicin.