Фондапаринукс е довел и до значително намаляване на случаите на клинично проявена венозна тромбоемболия (дълбока венозна тромбоемболия и/ или белодробен тромбоемболизъм) [съответно 1 (0, 3%) спрямо 9 (2, 7%) пациенти], включително и два фатални случая на белодробен тромбоемболизъм, докладвани в групата на плацебо.
En signifikant reduktion av frekvensen symptomatisk VTE (DVT/ LE) erhölls också med fondaparinux [1 (0, 3%) respektive 9 (2, 7%) patienter] inklusive 2 fall av fatal LE rapporterade i placebogruppen.