При протеазните инхибитори са докладвани повишени нива на креатинин фосфокиназата (СРК), миалгия, миозит и, в редки случаи, рабдомиолиза, особено при комбинации с нуклеозидни инхибитори на обратната транскриптаза.
Höga doser av ketokonazol och itrakonazol (> 200 mg/ dag) rekommenderas inte.