Фондапаринукс не трябва да се използва при бременни жени освен в случай на категорична необходимост.
Fondaparinux ska användas under graviditet endast då det är absolut nödvändigt. d Fondaparinux utsöndras i bröstmjölk hos råtta men det är okänt om fondaparinux utsöndras i go bröstmjölk hos människa.