Метаболизъм Моксифлоксацин е подложен на биотрансформация фаза II и се екскретира чрез бъбреци и жлъчка/ изпражнения като непроменено лекарство, както и под формата на компонент, съдържащ сяра (M1) и като глюкуронид (M2).
La moxifloxacine subit une biotransformation de Phase II et est excrétée par les voies rénale et biliaire/ fécale à l’ état inchangé mais également sous la forme de deux métabolites, l’ un sulfoconjugué (M1) et l’ autre glucuroconjugué (M2).