Основният път на метаболизъм на неларабин е О- деметилиране от аденозин дезаминаза, при което се образува ara- G, който претърпява хидролиза и се образува гуанин.
La nélarabine est principalement métabolisée par O-déméthylation par l'adénosine désaminase pour former l'ara-G, lui-même transformé en guanine par hydrolyse.