Вирусната резистентност към абакавир при условия in vitro и in vivo се развива бавно, като това изисква множество мутации за клинично значимо повишаване на ЕC 50 спрямо дивия тип вирус.
Résistance in vivo (patients n'ayant jamais reçu d'antirétroviraux):