Емтрицитабин се фосфорилира от клетъчните ензими до емтрицитабин 5 '- трифосфат, който конкурентно инхибира обратната транскриптаза на HIV- 1, водейки до прекъсване на ДНК веригата.
L’ emtricitabine 5’ -triphosphate inhibe de façon compétitive la transcriptase inverse du VIH-1, aboutissant à l’ arrêt de l’ élongation de la chaîne d’ ADN.