Проучванията in vitro с човешки чернодробни микрозоми показват, че метаболизмът на саквинавир се медиира от цитохром Р450 със специфичен изоензим, CYP3A4, отговорен за над 90% от чернодробния метаболизъм.
Métabolisme et élimination chez l'adulte: des études in vitro utilisant des microsomes hépatiques humains ont montré que le saquinavir est métabolisé par le cytochrome P450, l'isoenzyme CYP3A4 étant responsable de plus de 90% de ce métabolisme hépatique.