V průběhu studií se většina běžných vedlejších účinků (více než 1 pacient z 10) objevila během nebo těsně po infuzi a jednalo se o návaly horka, kopřivku, pyrexii (horečku) a vyrážku.
In de studies waren de meest voorkomende bijwerkingen van Myozyme (waargenomen bij meer dan 1 op de 10 patiënten) tachycardie (snelle hartslag), blozen, hoesten, tachypnoe (versnelde ademhaling), braken, urticaria (galbulten), jeuk, koorts en verminderde zuurstofverzadiging (laag zuurstofgehalte in het bloed).