Mezi nejběžnější vedlejší účinky přípravku Pegasys (zaznamenané u více než 1 pacienta z 10) patří anorexie (ztráta chuti k jídlu), bolesti hlavy, insomnie (potíže se spánkem), podrážděnost, deprese, závratě, nauzea (pocit nevolnosti), průjem, bolesti břicha, alopecie (vypadávání vlasů), pruritus (svědění), myalgie (bolest svalů), artralgie (bolest kloubů), únava, pyrexie (horečka), zimnice (mrazení s třesem), reakce v místě aplikace injekce a bolesti.
De meest voorkomende bijwerkingen van Pegasys (waargenomen bij meer dan een op de tien patiënten) zijn gebrek aan eetlust, hoofdpijn, slapeloosheid, prikkelbaarheid, depressie, duizeligheid, misselijkheid, diarree, buikpijn, haaruitval, jeuk, spierpijn, gewrichtspijn, vermoeidheid, koorts, koude rillingen, reacties op de injectieplaats en pijn.