Mezi nejběžnější vedlejší účinky spojené s užíváním přípravku Cubicin (zaznamenané u více než 1 pacienta z 10) patří fungální infekce (plísňové a kvasinkové), bolest hlavy, nauzea (pocit nevolnosti), zvracení, průjem, vyrážka, reakce v místě zavedení infuze, abnormální jaterní testy a zvýšení hladiny enzymu CPK v krvi (ukazatel poškození svalů).
De meest voorkomende bijwerkingen (waargenomen bij meer dan 1 op de 10 patiënten) zijn schimmelinfecties (schimmels en gisten), hoofdpijn, misselijkheid, braken, diarree, huiduitslag, reacties op de plaats van het infuus, abnormale levertests en verhoogde niveaus in het bloed van het enzym CPK, dat toeneemt wanneer spieren beschadigd zijn.