Primární cestou eliminace amprenaviru je jeho hepatální metabolismus; v nezměněné formě se vylučuje méně než 1% močí a nezměněný amprenavir není prokazatelný ve stolici.
De belangrijkste eliminatieroute van amprenavir verloopt via metabolisme in de lever, waarbij minder dan 1% onveranderd wordt uitgescheiden in de urine en de feces geen detecteerbare amprenavir bevatten.