Mezi nejběžnější vedlejší účinky přípravku Ambirix (zaznamenané u více než 1 dávky vakcíny z 10) patří bolest hlavy, nechutenství, bolest v místě vpichu, zarudnutí, únava, podrážděnost nebo úzkostlivost.
De meest voorkomende bijwerkingen tijdens de behandeling met Ambirix (waargenomen bij meer dan 1 op 10 doses van het vaccin) zijn hoofdpijn, verminderde eetlust, pijn op de injectieplaats, roodheid, vermoeidheid en prikkelbaarheid of zenuwachtigheid.