Stejně jako u jiných léků užívaných k léčbě HIV existuje u pacientů užívajících Trizivir riziko vzniku lipodystrofie (změny rozložení tuku v těle), syndromu imunitní reaktivace (reakce obnovujícího se imunitního systému na organismy vyvolávající onemocnění) a osteonekrózy (odumírání buněk kostí, které způsobuje jejich křehkost).
Net als geldt voor andere anti-hiv-middelen bestaat bij patiënten die Trizivir gebruiken, ook een risico van lipodystrofie (veranderingen in de verdeling van lichaamsvet), het zogenoemde immuunreactiveringssyndroom (reacties op ziekteverwekkende organismen veroorzaakt door het zich herstellende immuunsysteem) en osteonecrose (afsterven van botweefsel, waardoor de botten breekbaar worden).