Přesto však byly mezi oběma přípravky zaznamenány rozdílnosti: v porovnání s výsledky dosaženými u pacientů léčených referenčním přípravkem se ve skupině léčené Alpheonem vyskytlo více pacientů, u kterých došlo k návratu onemocnění po ukončení léčby, a pacienti léčení Alpheonem vykazovali rovněž více vedlejších účinků.
Tussen de twee geneesmiddelen waren echter enkele verschillen zichtbaar: het aantal patiënten dat de ziekte opnieuw kreeg na het staken van de behandeling met Alpheon was groter dan bij het referentiegeneesmiddel en Alpheon had meer bijwerkingen.