Následující nežádoucí příhody, které mají přinejmenším pravděpodobnou souvislost s podáváním nelfinaviru (tj. nežádoucí účinky), se vyskytovaly nejčastěji: průjem, nausea a vyrážka.
De meest gemelde bijwerkingen met minimaal een mogelijke relatie met nelfinavir, waren: diarree, misselijkheid en uitslag.