Bimatoprost podléhá oxidaci, N- deetylaci a glukuronidaci a vytváří různé druhy metabolitů.
Bimatoprost is de belangrijkste in het bloed circulerende vorm wanneer het de systemische circulatie bereikt na oculaire toediening Bimatoprost ondergaat oxidatie, N-deethylering en glucuronidering onder vormingvan een grote verscheidenheid aan metabolieten.