Фондапаринукс е довел и до значително намаляване на случаите на клинично проявена венозна тромбоемболия (дълбока венозна тромбоемболия и/ или р аз белодробен тромбоемболизъм) [съответно 1 (0, 3%) спрямо 9 (2, 7%) пациенти], включително и два фатални случая на белодробен тромбоемболизъм, докладвани в групата на плацебо.
Fondaparinukss nozīmīgi mazināja arī simptomātisku VT (DzVT un/ vai PE) sastopamību [attiecīgi 1 pacients (0, 3%) pret 9 (2, 7%) pacientiem], tostarp placebo grupā novēroti divi letāli PE gadījumi.