Анидулафунгин има фунгицидна активност спрямо различните видове Candida и активност спрямо областите на хифите на Aspergillus fumigatus с активен клетъчен растеж.
Anidulafungīnam pierādīta fungicīda aktivitāte pret Candida ģints sēnītēm un pret šūnu aktīvas augšanas reģioniem Aspergillus fumigatus hifās.