Установено е, че лечението с фондапаринукс е с не по- малка ефикасност от лечението с еноксапарин (честотите на венозна тромбоемболия са били съответно 3, 9% и 4, 1%).
Pierādīts, ka ārstēšana ar fondaparinuksu nav sliktāka par enoksaparīna terapiju (VTE biežums attiecīgi 3, 9% un 4, 1%).