Индинавир, със или без ритонавир, не трябва да се прилага едновременно с лекарствени продукти с тесен терапевтичен прозорец, които са и субстрати на CYP3A4.
Indinavīru kopā ar ritonavīru vai bez tā nedrīkst nozīmēt vienlaikus ar zālēm, kurām ir šaurs terapeitiskās darbības spektrs, un, kuras ir CYP3A4 substrāti.