При физиологична температура и рН анидулафунгин претърпява бавено химично разграждане до пептид с отворен пръстен, който няма антигъбична активност.
Anidulafungīns fizioloģiskos temperatūras un pH apstākļos lēnām ķīmiski sadalās līdz peptīdam ar vaļēju gredzenu, kuram nepiemīt antifungāla aktivitāte.