Някои данни за генотипна резистентност показват, че при повечето пациенти, които не се повлияват от ННИОТ, вирусните щамове проявяват кръстосана резистентност спрямо други ННИОТ.
Ir zināms, ka daļai pacientu, kam ārstēšana ar NNRTI bija neveiksmīga, novērota krustota rezistence pret citiem NNRTI.