Повече от 90% oт приложената доза фентанил се отделя чрез биотрансформация дo N- деалкилирани и хидроксилирани неактивни метаболити.
Vairāk kā 90% no ievadītās fentanila devas tiek eliminēti biotransformējot par N- dealkilētiem un hidroksilētiem neaktīviem metabolītiem.