Проведени са няколко клинични изпитвания с пациенти, инфектирани с НIV- 1, при които е оценяван ефекта на нелфинавир (самостоятелно или в комбинация с други антиретровирусни средства) върху биологичните маркери за активност на болестта - брой CD4 клетки и вирусна РНК.
Nelfinavira (monoterapijā vai kombinācijā ar citiem pretretrovīrusu līdzekļiem) ietekme uz slimības aktivitātes bioloģiskiem marķeriem, CD4 šūnu skaitu un vīrusu RNS tika vērtēta vairākos pētījumos ar HIV- 1 inficētiem pacientiem.