След перорално приложение 19% и след интравенозна приложение 12% от ципрофлоксацин се екскретират в урината и фекалиите под формата на метаболити.
Pēc perorālas ieņemšanas un i. v. ievades ar urīnu un izkārnījumiem metabolītu veidā tiek izvadīti attiecīgi 19% un 12% ciprofloksacīna.