Както и при другите антибиотици с широк спектър на действие, продължителната употреба на cefuroxime axetil може да предизвика суперинфекция с резистентни щамове (напр. candida, enterococci и clostridium difficile), което може да наложи прекъсване на лечението.
Tāpat kā plaša spektra antibiotiku ilgstoša lietošana, arī cefuroksīma aksetila ilgstoša lietošana var izraisīt nejutīgu organismu (piem., Candida, Enterococci un clostridium difficile) savairošanos, kad var būt nepieciešams pārtraukt terapiju.