Нежеланите лекарствени реакции, които са възниквали по- често при бозентан, отколкото при плацебо (≥ 3% от приемащите бозентан пациенти, с ≥ 2% разлика), са били главоболие (15, 8% срещу 12, 8%), зачервяване (6, 6% срещу 1, 7%), абнормна чернодробна функция (5, 9% срещу 2, 1%), оток на краката (4, 7% срещу,. 4%) и анемия (3, 4% срещу 1, 0%), като всички са били дозозависими.
Zāļu izraisītas blaknes, kas biežāk tika novērotas pacientiem, kas saņēma bosentānu, salīdzinājumā ar pacientiem, kas saņēma placebo (≥ 3% ar bosentānu ārstētu pacientu ar ≥ 2% starpību), bija galvassāpes (15, 8% pret 12, 8%), piesārtums (6, 6% pret 1, 7%), aknu funkciju traucējumi (5, 9% pret 2, 1%), kāju tūska (4, 7% pret 1, 4%) un anēmija (3, 4% pret 1, 0%), kas visos gadījumos bija atkarīgas no devas.