Както при другите антимикробни средства, включително карбапенеми, за дорипенем е показано, че селектира резистентни бактериални щамове.
Tāpat kā citi pretmikrobu līdzekļi, tostarp karbapenēma grupas līdzekļi, doripenēms izraisa rezistentu baktēriju celmu veidošanos.