Тъй като употребата на концентрати на фактор IX комплекс досега винаги е била асоциирана с развитие на тромбоемболични усложнения, като рискът е по- голям при препаратите с ниска чистота, прилагането на продукти, съдържащи фактор IX, може да е потенциално вредно при пациенти с признаци на фибринолиза и такива с дисеминирана интраваскуларна коагулация (ДИК).
Tā kā IX faktora kompleksu koncentrātu lietošana vēsturiski ir saistīta ar trombemboliskām komplikācijām (lielāks risks, lietojot zemas tīrības preparātus), IX faktoru saturošu produktu lietošana var būt potenciāli bīstama pacientiem ar fibrinolīzes pazīmēm un pacientiem ar diseminētu intravazālo koagulāciju (DIK).