При клинични проучвания най- честите нежелани реакции, водещи до прекратяване на лечението с ентакапон, са стомашно- чревните симптоми (напр. диария, 2, 5%) и повишените допаминергични нежелани реакции, предизвикани от леводопа (напр. дискинезия, 1, 7%).
Klīniskajos pētījumos visbiežākās blaknes, kas izraisīja entakapona lietošanas pārtraukšanu, bija gastrointestinālie simptomi (piem., caureja 2. 5%) un pastiprinātas levodopas dopamīnerģiskās blaknes (piem., diskinēzijas 1. 7%).