Най- честите нежелани реакции при Pegasys (наблюдавани при повече от 1 на 10 пациенти) са анорексия (загуба на апетит), главоболие, инсомния (нарушения на съня), раздразнителност, депресия, виене на свят, гадене (неразположеност), диария, стомашна болка, алопеция (косопад), пруритус (сърбеж), миалгия (мускулна болка), арталгия (болка в ставите), слабост (умора), пирексия (треска), тръпки (втрисане), реакции в мястото на инжекцията и болка.
Visbiežāk novērotās Pegasys blakusparādības (vairāk nekā vienam pacientam no desmit) ir anoreksija (apetītes zudums), galvassāpes, bezmiegs (grūtības aizmigt), uzbudināmība, depresija, reibonis, slikta dūša, caureja, sāpes vēdera augšdaļā, alopēcija (matu izkrišana), nieze, mialģija (muskuļu sāpes), artralģija (locītavu sāpes), nogurums (nespēks), drudzis, drebuļi (auksti drebuļi), reakcija injekcijas vietā un sāpes.