Наблюдавана е също субституция на позиции 98, 100, 101, 108, 138, 188, 190 или 225 в молекулата на обратната транскриптаза, макар и по- рядко и често само в съчетание с K103N.
K103N substitūcija netika novērota pacientu analīzēs, kas bija ņemtas pirms terapijas ar efavirenzu.