Ципрофлоксацин трябва да бъде употребяван в комбинация с други антимикробни средства, например рифампицин при инфекции, причинени от Staphylococci, и бета- лактамни или аминогликозидни антибиотици при инфекции, причинени от Pseudomonas aeruginosa.
Ciprofloksacīnu vajadzētu lietot kopā ar citiem antibakteriālajiem līdzekļiem, tādiem kā rifampicīns, infekciju gadījumos, ko izraisa stafilokoki, bet beta- laktāmus vai aminoglikozīdus infekciju gadījumos, ko izraisa Pseudomonas aeruginosa.