Както всички други NRTI Combivir може да причини лактатна ацидоза (натрупване на млечна киселина в организма), а при бебета на жени, приемали Combivir по време на бременността – митохондриална дисфункция (увреждане на произвеждащите енергия компоненти в клетките, което може да причини проблеми с кръвта).
Tāpat, kā citi NRTI, Combivir var arī izraisīt pienskābes acidozi (pienskābes uzkrāšanos organismā), un bērniem, kuru mātes grūtniecības laikā lietojušas Combivir, mitohondriju disfunkciju (enerģiju ražojošo komponentu bojājumu šūnās, kas var radīt problēmas asinīs).