Най- често съобщаваните нежелани реакции при лечение с азацитидин са хематологични реакции (71, 4%), включващи тромбоцитопения, неутропения и левкопения (обикновено 3- та−4- та степен), стомашно- чревни нарушения (60, 6%), включващи гадене, повръщане (обикновено 1- ва−2- ра степен) или реакции на мястото на инжектиране (77, 1%; обикновено 1- ва−2- ра степен).
Visbiežāk ziņotās nevēlamās blakusparādības pēc azacitidīna lietošanas bija hematoloģiskās reakcijas (71, 4%), ieskaitot trombocitopēniju, neitropēniju un leikopēniju (parasti 3. - 4. pakāpe), kuņģa- zarnu trakta traucējumi (60, 6%), ieskaitot sliktu dūšu, vemšanu (parasti 1. - 2. pakāpe), vai reakcijas injekcijas vietā (77, 1%; parasti 1. - 2. pakāpe).