Нелфинавир се свързва обратимо с активната зона на НIV протеазата и предотвратява разцепването на полипротеините, което води до формиране на незрели, незаразни вирусни частици.
Nelfinavirs atgriezeniski saistās pie HIV proteāzes aktīvās daļas un aizkavē poliproteīnu šķelšanu, tā veidojot neattīstītas, neinfekciozas vīrusa daļiņas.