Резистентните към емтрицитабин вируси са имали кръстосана резистентност към ламивудин, но са запазили чувствителност към други нуклеозидни инхибитори на обратната транскриптаза (НИОТ) (зидовудин, ставудин, тенофовир, абакавир, диданозин и залцитабин), всички не- нуклеозидни инхибитори на обратната транскриптаза (ННИОТ) и всички протеазни инхибитори (ПИ).
Pret emtricitabīnu rezistenti vīrusi bija krusteniski rezistenti pret lamivudīnu, bet saglabāja jutību pret citiem nukleozīdu reversās transkriptāzes inhibitoriem (NRTI) (zidovudīnu, stavudīnu, tenofoviru, abakaviru, didanozīnu un zalcitabīnu), visiem nenukleozīdu reversās transkriptāzes inhibitoriem (NNRTI) un visiem proteāzes inhibitoriem (PI).