Приложението на цидофовир е противопоказано при пациенти, които не могат да получават пробенецид поради клинично сигнификантна свръхчувствителност към активното вещество или лекарствения продукт или към други сулфонамид- съдържащи лекарства, прилагането на цидофовир следва да се има предвид, само ако вероятните ползи от терапията надвишават възможните рискове.
A cidofovir alkalmazása ellenjavallt azoknál a betegeknél, akik nem kaphatnak probenecidet a gyógyszerrel, hatóanyagával vagy egyéb szulfonamidokkal szembeni jelentős túlérzékenységük miatt.