Най- често наблюдаваните нежелани реакции на саквинавир (при повече от десет на сто болни), приеман заедно с ритонавир, засягат стомашно- чревния тракт, като най- чести са гадене, диария, умора, повръщане, образуване на газове и болка в корема.
A ritonavirral együtt szedett szakinavir leggyakoribb (száz betegből több mint tíz betegen) mellékhatásai a gyomor -, bélrendszerrel kapcsolatosak, émelygés, hasmenés, fáradtság, hányás, szelek és hasi fájdalom fordul elő leggyakrabban.