Най- честите нежелани реакции при Pandemrix (наблюдавани при 1 на 10 дози от ваксината или повече) са главоболие, артралгия (болки в ставите), миалгия (болки в мускулите), реакции на мястото на инжектиране (уплътнение, подуване, болка и зачервяване), повишена температура и умора.
A Pandemrix alkalmazása során leggyakrabban (a vakcina 10 vagy több dózisából egy esetében) előforduló mellékhatások a fejfájás, arthralgia (ízületi fájdalom), myalgia (izomfájdalom), reakciók az injekció beadásának helyén (kemény csomó, duzzanat, fájdalom és bőrpír), a láz és a fáradság.