Както и при другите квинолони, поради възможни странични ефекти върху ставния хрущял на носещите стави difloxacin не трябва да се използва във фазата на усилен растеж на животното.
Mint más kinolonok esetében jelentkezhet káros mellékhatás a teherhordó, fejlődésben lévő izületi porcokban.