Ефектите върху вирусното натоварване са съществено по- изразени при пациентите, лекувани с индинавир в комбинация с нуклеозидни аналози, но пропорцията на пациентите със серумна вирусна РНК под границата на количествена преценка (500 копия/ ml) варира при проучванията от 40% до повече от 80% на 24- та седмица.
A vírusmennyiségre gyakorolt hatás minden esetben kifejezettebb volt az indinavir és nukleozid - analógok kombinációjával kezelt betegekben, de az egyes vizsgálatokban különbözőképpen alakult (40% és több mint 80% között változott) azon betegek aránya, akiknél a vérsavóban kimutatható vírus- RNS mennyisége 24 heti kezelés után a kimutathatósági határ (500 kópia/ ml) alá esett.