101 значимо еукариотните протеази човешки ренин, човешки катепсин D, човешка еластаза и човешки фактор Xa.
Az indinavir nem gátolja jelentős mértékben az eukarióta proteázokat, így a humán renint, a humán katepszin D- t, a humán elasztázt és a humán Xa faktort.