При клинични проучвания най- честите нежелани реакции, водещи до прекратяване на лечението с ентакапон, са стомашно- чревните симптоми (напр. диария, 2, 5%) и повишените допаминергични нежелани реакции, предизвикани от леводопа (напр. дискинезия, 1, 7%).
A klinikai vizsgálatokban a leggyakoribb mellékhatások - amelyek az entakapon kezelés felfüggesztéséhez vezettek - a gastrointestinalis tünetek (pl. hasmenés 2, 5%) és a levodopa felfokozott dopaminerg mellékhatásai (pl. dyskinesiák, 1, 7%) voltak.