Фондапаринукс е противопоказан при тежко бъбречно увреждане (креатининов клирънс < 30ml/ min) и трябва да се прилага с внимание при пациенти с умерено тежко бъбречно увреждане (креатининов клирънс 30- 50 ml/ min).
A fondaparinux ellenjavallt súlyos vesekárosodásban (kreatinin- clearance < 30 ml/ perc), és fokozott óvatosságot igényel mérsékelt (kreatinin- clearance 30- 50 ml/ perc) vesekárosodásban szenvedő betegek esetén.