Както и при другите антибиотици с широк спектър на действие, продължителната употреба на cefuroxime axetil може да предизвика суперинфекция с резистентни щамове (напр. candida, enterococci и clostridium difficile), което може да наложи прекъсване на лечението.
Mint minden más széles spektrumú antibiotikum estében a cefuroxim- axetil hosszan tartó használata is rezisztens kórokozók (pl.