Чрез селективно свързване с ATIII, фондапаринукс потенцира (около 300 пъти) естествената неутрализация на фактор Xa от ATIII.
Az ATIII- hoz történő szelektív kötődéssel a fondaparinux (mintegy 300- szorosára) fokozza az ATIII meglévő Xa- Faktort neutralizáló képességét.