При физиологична температура и рН анидулафунгин претърпява бавено химично разграждане до пептид с отворен пръстен, който няма антигъбична активност.
Az anidulafunginból fiziológiás hőmérsékleten és pH- értéken lassú kémiai lebomláson keresztül egy nyílt gyűrűs peptid keletkezik, melynek nincs gombaellenes hatása.