Зидовудин може да взаимодейства и със следните лекарства и може да засили нежеланите ефекти: фенитоин, пробенецид, рифампицин, атоваквон, валпроева киселина, метадон, дапсон, пентамидин, пириметамин, ко- тримоксазол, флуконазол, амфотерицин, флуцитозин, ганцикловир, интерферон, кларитромицин, винкристин, винбластин и доксорубицин.
A zidovudin a következő gyógyszerekkel is kölcsönhatásba léphet, és súlyosbíthatja azok mellékhatásait: fenitoin, probenecid, rifampicin, atovakvon, valproát, metadon, dapszon, pentamidin, pirimetamin, ko- trimoxazol, flukonazol, amfotericin, flucitozin, ganciklovir, interferon, klaritromicin, vinkrisztin, vinblasztin és doxorubicin.