Най- честата призната нежелана реакция при пациентите, получаващи Paxene, е потискане на костния мозък, което води до тежка неутропения (нисък брой на белите кръвни клетки), тромбоцитопения (нисък брой на тромбоцитите) и анемия (нисък брой на червените кръвни клетки).
A Paxenét monoterápiában kapó betegeknél leggyakrabban előforduló mellékhatás a csontvelő szuppresszió, ami neutropeniát (alacsony fehérvérsejt szám), thrombocytopeniát (alacsony vérlemezke szám) és anaemiát (alacsony vörösvértest szám) eredményez.