Кръстосана резистентност между ампренавир и инхибиторите на обратната транскриптаза е малко вероятно да се появи, тъй като мишените на ензимите са различни.
Az amprenavir és a reverz- transzkriptáz gátlók között nem valószínű a keresztrezisztencia kialakulása, mivel a célenzimek nem azonosak.