След перорално приложение 19% и след i. v. приложение 12% от ципрофлоксацин се екскретират в урината и изпражненията под формата на метаболити.
A ciprofloxacinnak orális alkalmazás után a 19% - a, intravénás alkalmazás után a 12% - a választódik ki metabolitok formájában a vizelettel és a széklettel.