Метаболизмът на саквинавир се медиира от цитохром Р450, със специфичен изоензим CYP3A4, който осъществява 90% от чернодробния метаболизъм.
A szakinavirt a citokróm P450, ami egy specifikus izoenzim, a CYP 3A4 segítségével metabolizálja, mely a májmetabolizmus 90% - ért felelős.