Както при другите антимикробни средства, включително карбапенеми, за дорипенем е показано, че селектира резистентни бактериални щамове.
Más antimikróbás szerekhez hasonlóan, beleértve a karbapenemeket is, a doripenem esetében is kimutatták, hogy a rezisztens baktérium törzsek kiszelektálódnak.