Клирънсът на силденафил се осъществява предимно от чернодробните микрозомни изоензими CYP3A4 (главен път) и CYP2C9 (второстепенен път).
A szildenafilt elsősorban a máj mikroszomális enzimrendszerének CYP3A4 - (fő út), kisebb mértékben a CYP2C9 (mellék út) izoenzimei metabolizálják.