Биотрансформацията на емтрицитабин включва оксидиране на тиоловата група до образуване на 3 '- сулфоксид диастереомери (приблизително 9% от дозата) и конюгация с глюкоронова киселина дообразуване на 2' - O- глюкоронид (приблизително 4% от дозата).
Az emtricitabin biotranszformációja során a tiolcsoport oxidálódik és 3 '- szulfoxid diasztereomerekké alakul (a dózis körülbelül 9% - a), illetve glükuronsavval konjugálva 2' - O- glükuronid keletkezik (a dózis körülbelül 4% - a).