Нежеланите реакции при пациенти, лекувани с Circadin, са редки, но най- често срещани (при 1 до 10 на 1 000 пациенти) са раздразнителност, нервност, неспокойствие, безсъние, странни сънища, мигрена, психомоторна хиперактивност (неспокойство с повишена активност), замаяност, сомноленция (сънливост), коремна (стомашна) болка, запек, сухота в устата, хипербилирубинемия (повишени нива на билирубин в кръвта − продукт, получен при разпада на червените кръвни телца, причиняващ пожълтяване на кожата и очите), хиперхидроза (повишено потене), астения (слабост) и повишаване на теглото.
A Circadinnal kezelt betegeknél a mellékhatások nem gyakoriak, de a leggyakrabban (1000 közül 1 és 10 közötti számú betegnél) előforduló mellékhatások az ingerlékenység, idegesség, nyugtalanság, álmatlanság, szokatlan álmok, migrén, pszichomotoros hiperaktivitás (nyugtalanság és felfokozott tevékenykedés), szédülés, aluszékonyság, hasi fájdalom, székrekedés, szájszárazság, hiperbilirubinemia (a vörösvérsejtek bomlásából származó bilirubin szintjének emelkedése, ami miatt a beteg bőre vagy a szeme fehérje sárgásan elszíneződhet) fokozott verejtékezés (hiperhidrózis), gyengeség, testsúlygyarapodás.