Като допълнение, инданавир с ритонавир не трябва да се прилагат заедно с алфузозин, меперидин, пироксикам, пропоксифен, бепридил, енкаинид, флеканид, пропафенон, хинидин, фузидова киселина, клозапин, клоразепат, диазепам, естазолам и флуразепам.
A ritonavirrel együttesen alkalmazott indinavir továbbá nem adható együtt alfuzozinnal, meperidinnel, piroxikámmal, propoxifennel, bepridillel, enkainiddel, flekainiddel, propafenonnal, kinidinnel, fuzidsavval, klozapinnel, klorazepáttal, diazepámmal, esztazolámmal és flurazepámmal.