В тялото антитромбинът блокира тромбина – едно от веществата, участващи в коагулацията на кръвта (кръвосъсирването).
A veleszületett antitrombinhiányban szenvedő betegeknél az antitrombin szintje a vérben a normális értéknél alacsonyabb, ami a vér alvadásgátló képességének csökkenését okozhatja.