В резултат на своя механизъм на действие ципрофлоксацин не показва кръстосана резистентност с други важни, химически различни групи вещества, например бета- лактамни антибиотици, аминоглюкозиди, тетрациклини, макролиди и полипептиди, сулфонамиди, триметоприм и нитрофурантоин.
Hatásmechanizmusának köszönhetően, a ciprofloxacin nem mutat keresztrezisztenciát egyéb fontos, kémiailag különböző vegyületcsoportokkal, például a béta- laktám antibiotikumokkal, aminoglikozidokkal, tetraciklinekkel, makrolidekkel és polipeptidekkel, szulfonamidokkal, trimetoprimmel és nitrofurantoinnal.