В проучванията най- честите нежелани реакции при Gardasil (наблюдавани при повече от 1 на 10 пациенти) са пирексия (повишена температура) и реакции на мястото на инжектиране (зачервяване, болка и подуване).
A Gardasil alkalmazása során előforduló leggyakoribb (10 betegből több mint 1- nél fordult elő) mellékhatások a láz és az injekció beadásának helyén kialakuló reakciók (bőrpír, fájdalom és duzzanat).