Както и при другите квинолони, поради възможни странични ефекти върху ставните хрущяли на носещите стави difloxacin не трябва да се използва във фазата на усилен растеж на животното.
Mint más kinolonok alkalmazása esetén is, káros mellékhatás jelentkezhet a fejlődésben lévő, teherhordó izületi porcokban.