Не е вероятно съществуването на кръстосана резистентност между нелфинавир и инхибиторите на обратната транскриптаза поради участие на различни прицелни ензими.
A keresztrezisztencia a nelfinavir és a reverz transzkriptáz gátlók között nem valószínű, mert különbözőek a célenzimek.