При клинични проучвания единствените нежелани реакции, системно считани за свързвани с прилагането на филграстим, са мускулно- скелетна болка, лека до умерена болка в костите и миалгия.
HIV betegek esetében A klinikai vizsgálatokban a filgrasztim adásával következetesen együtt járó nemkívánatos hatások a csont- izomrendszeri fájdalom, túlnyomórészt enyhétől közepesig terjedő intenzitású csontfájdalom és izomfájdalom voltak.