Опиоидите повишават тонуса и намаляват пропулсивните контракции на гладката мускулатура на гастроинтестиналния тракт, което води до удължаване на времето за преминаване през гастроинтестиналния тракт, на което може да се дължи констипационният ефект на фентанил.
Ennek következtében meghosszabbodik a gasztrointesztinális tranzit- idő; ez lehet a felelős a fentanil székrekedést előidéző hatásáért.