На клетъчно ниво последствието от инхибирането на топоизомераза- I от топотекан е индукцията на протеин- свързани ДНК едноверижни разкъсвания.
A topoizomeráz- I topotekán általi gátlásának celluláris következménye a fehérjéhez kötött DNS szálak kettéhasadása.