Нелфинавир се метаболизира главно от изоензимите CYP3A и CYP2C19 на цитохром Р450 (вж. точка 5. 2).
A nelfinavir elsősorban a citokróm P450 izoenzimjein a CYP 3A- n és CYP 2C19en keresztül metabolizálódik (lásd 5. 2 pontot).