Биотрансформацията на емтрицитабин включва оксидация на тиоловата група до 3 '- сулфоксидни диастеромери (приблизително 9% от дозата) и конюгиране с глюкуронова киселина до 2' - O- глюкуронид (приблизително 4% от дозата).
Az emtricitabin biotranszformációja során a tiol csoport oxidálódik és 3 '- szulfoxid diasztereomerekké alakul (a dózis körülbelül 9% - a), illetve glükuronsavval konjugálva 2' - O- glükuronid keletkezik (a dózis körülbelül 4% - a).