При протеазните инхибитори са докладвани повишени нива на креатинин фосфокиназата (СРК), миалгия, миозит и, в редки случаи, рабдомиолиза, особено при комбинации с нуклеозидни инхибитори на обратната транскриптаза.
Proteaasi inhibiitorite kasutamisel, eriti kombinatsioonis nukleosiidi pöördtranskriptaasi inhibiitoritega, on täheldatud kreatiniinfosfokinaasi tõusu, müalgiat, müosiiti ja harva rabdomüolüüsi.