Друга възможна причина за резистентността към β- лактамните антибиотици могат да бъдат хромозомни бактериални мутации, водещи до промени в пеницилин- свързаните протеини (penicillin binding proteins - PBPs) или до промяна на клетъчния пермеабилитет за β- лактами.
Teist võimalikku resistentsuse mehhanismi β- laktaamantibiootikumide suhtes võib seostada bakterite kromosoommutatsioonidega, mis põhjustavad kas penitsilliini siduvate valkude (PBP) modifitseerumist või tsellulaarse permeaabelsuse muutust β- laktaamide suhtes.