Най- честите нежелани реакции при Prepandrix (наблюдавани при 1 на 10 дози от ваксината или повече) са главоболие, артралгия (болки в ставите), миалгия (болки в мускулите), реакции на мястото на инжектиране (уплътнение, подуване, болка и зачервяване), повишена температура и умора.
Prepandrixi kõige sagedamad kõrvalnähud (esinenud vaktsiini kümnest või enamast annusest ühe puhul) on peavalu, artralgia (liigesevalu), müalgia (lihasevalu), reaktsioonid süstekohal (kõvenemine, paistetus, valu ja punetus), palavik ja väsimus.