Най- често докладваните нежелани събития в UA/ NSTEMI клиничното изпитване от фаза III у (докладвани при най- малко 1% от пациентите на фондапаринукс) са били главоболие, гръдна по за болка и предсърдно мъждене.
III faasi UA/ NSTEMI uuringus olid peale verejooksu kõige sagedamini kirjeldatud kõrvaltoimed (mida kirjeldati vähemalt 1% fondapariinuksit saanud patsientidest) peavalu, rindkerevalu ja kodade virvendus.