Най- честите нежелани реакции при Ambirix (наблюдавани при повече от 1 на 10 дози от ваксината) са главоболие, загуба на апетит, болка на мястото на инжектиране, зачервяване, отпадналост (уморяемост) и раздразнителност или нервност.
Ambirixi kõige sagedamad kõrvalnähud (täheldatud rohkem kui ühe vaktsiiniannuse puhul kümnest) on peavalu, isutus, valu süstekohal, punetus, väsimus ja ärrituvus või rahutus.