Както при други антибиотични лекарства, най- често срещаната нежелана реакция от Refludan (наблюдавана при повече от 1 на 10 пациенти) е кървене.
Nagu muudelgi tromboosivastastel ravimitel, on Refludani kõige tavalisem kõrvaltoime veritsemine (täheldatud enam kui ühel patsiendil kümnest).