Както при други антикоагуланти, дезирудин трябва да се използва с повишено внимание заедно с лекарствени средства, които повлияват тромбоцитната функция тези лекарствени продукти включват: ацетилсалицилова киселина и НСПВС, тиклопидин и клопидогрел, антагонисти на гликопротеин IIb/ IIIa (абциксимаб, ептифибатид, тирофибан) и илопрост.
Nagu teisi antikoagulante, nii ka desirudiini tuleb ettevaatusega kasutada koos ravimitega, mis mõjutavad trombotsüütide funktsiooni: sellisteks ravimiteks on atsetüülsalitsüülhape ja NSAID- id, tiklopidiin ja klopidogreel, glükoproteiin IIb/ IIIa antagonistid (abtsiksimab, eptifibatiid, tirofibaan) ja iloprost.