Следните нежелани събития с поне възможна връзка с приложението на саквинавир, подсилен с ритонавир (т. e. нежелани реакции), се съобщават най- често: гадене, диария, умора, повръщане, метеоризъм и коремна болка.
Sakvinaviir ei muuda nukleosiidi analoogide põhiliste teadaolevate kõrvaltoimete iseloomu, sagedust või raskust.