Ертапенем е ефективно устойчив на хидролиза от повечето класове бета- лактамази, включително пеницилази, цефалоспоринази и широкоспектърни беталактамази, но не и към метало- бета- лактамазите.
Metitsilliintundlikud stafülokokk ja enterokokk on resistentsed ertapeneemi suhtes tänu penitsilliini siduvate valkude kui sihtmärgi tundetusele; P. aeruginosa ja teised mitte- käärivad bakterid on üldiselt resistentsed, tõenäoliselt tänu piiratud penetratsioonile ja aktiivsele väljavoolule.