Както всички ваксини, ако RotaTeq се използва при много недоносени деца, съществува риск от апнея (кратки прекъсвания на дишането).
Nagu kõikide vaktsiinide korral, tekib RotaTeqi kasutamisel väga enneaegsetel lastel apnoe (lühikeste hingamiskatkestuste) oht.