Не е вероятно съществуването на кръстосана резистентност между нелфинавир и инхибиторите на обратната транскриптаза поради участие на различни прицелни ензими.
Ristresistentsus nelfinaviiri ja pöörd- transkriptaasi inhibiitorite vahel ei ole tõenäoline, kuna ensüümide toimekohad on erinevad.