Тъй като употребата на концентрати на фактор IX комплекс досега винаги е била асоциирана с развитие на тромбоемболични усложнения, като рискът е по- голям при препаратите с ниска чистота, прилагането на продукти, съдържащи фактор IX, може да е потенциално вредно при пациенти с признаци на фибринолиза и такива с дисеминирана интраваскуларна коагулация (ДИК).
Et IX faktori kompleksi kontsentraatide kasutamist on ajalooliselt seostatud trombembooliliste komplikatsioonide tekkimisega, mille risk on olnud suurem madalama puhtusastmega preparaatide puhul, võib IX faktorit sisaldavate preparaatide kasutamine olla potentsiaalselt ohtlik nendele patsientidele, kellel esinevad fibrinolüüsi nähud ja dissemineeritud intravaskulaarne koagulatsioon (DIK).