Както при други флуорохинолони, дифлоксацин не трябва да се използва при бързорастящи кучета, защото може да повлияе на хрущяла на някои стави.
Sarnaselt teiste fluorokinoloonidega ei tohi difloksatsiini kasutada kiiresti kasvavatel koertel, sest ravim võib teatud liigestes kahjustada liigesekõhre.