В сериозни, но редки случаи, ССЯ освен с отчетливо уголемяване на яйчниците, може да бъде съпътствано от събиране на течност в коремната кухина или гръдния кош, както и с по - сериозни тромбоемболични усложнения.
Harvaesinevatel rasketel munasarjade hüperstimulatsioonisündroomi juhtudel, kui munasarjad on märgatavalt suurenenud, võib sellega kaasneda vedeliku kogunemine kõhu - ja rinnaõõnde, aga ka raskemad trombemboolilised (veresoone ummistusega seotud) tüsistused.