Мутагенна активност се наблюдава в условия in vitro при изследване на човешки лимфоцитни култури за поява на хромозомни аберации и при миши лимфомни клетки, както и при микронуклеарен тест in vivo.
Bakteriaalsetes testides ei olnud abakaviir mutageenne, kuid aktiivsust täheldati in vitro inimese lümfotsüütide kromosoomiaberratsioonide testis, hiire lümfoomirakkude testis ja in vivo mikronukleuste testis.