Най- честите нежелани реакции при Cubicin (наблюдавани при повече от 1 на 10 пациенти) са гъбични инфекции (причинени от плесени и дрожди), главоболие, гадене (позиви за повръщане), повръщане, диария, обрив, реакции на мястото на инфузията, нарушени стойности на чернодробните ензими и повишени стойности на CPK (показател за мускулни увреждания) в кръвта.
Cubicini kõige sagedamad kõrvalnähud (mida on esinenud rohkem kui ühel patsiendil kümnest) on seeninfektsioonid (hallituste või pärmide põhjustatud), peavalu, iiveldus, oksendamine, infusioonikoha reaktsioonid, maksaanalüüside kõrvalekalded ja lihasekahjustuste markeri ensüümi kreatiinfosfokinaasi (CPK) sisalduse suurenemine veres.