Ципрофлоксацин трябва да бъде употребяван в комбинация с други антимикробни средства, например рифампицин при инфекции, причинени от Staphylococci, и бета- лактамни или аминогликозидни антибиотици при инфекции, причинени от Pseudomonas aeruginosa.
Tsiprofloksatsiini peab kasutama kombinatsioonis teiste antimikroobsete ainetega, näiteks koos rifampitsiiniga Staphylococci põhjustatud nakkuste korral ja koos beetalaktaamide või aminoglükosiididega Pseudomonas aeruginosa põhjustatud nakkuste korral.