Механизмът на действие не е напълно изяснен, но изглежда ara- CTP действа основно посредством подтискане на синтеза на ДНК.
Toimemehhanismi ei ole täielikult välja selgitatud, kuid on tõenäoline, et ara- CTP peamine toime seisneb DNA sünteesi inhibeerimises.