При условия in vitro в клинично релевантни концентрации абакавир не инхибира ензимите CYP3А4, CYP2С9 и CYP2D6.
Seetõttu on koostoimete tekkevõimalus retroviiruste vastaste proteaasi inhibiitorite ja teiste peamiselt P450 kaudu metaboliseeruvate ravimite vahel väike.