Биотрансформацията на емтрицитабин включва оксидация на тиоловата група до 3 '- сулфоксидни диастеромери (приблизително 9% от дозата) и конюгиране с глюкуронова киселина до 2' - O- глюкуронид (приблизително 4% от дозата).
Emtritsitabiini biotransformatsioon hõlmab tioolrühma oksüdatsiooni, mille käigus moodustuvad 3 ’ - sulfoksiid- diastereomeerid (ligikaudu 9% annusest) ja konjugatsiooni glükuroonhappega, mille käigus moodustub 2 ’ - O- glükuroniid (ligikaudu 4% annusest).