Както всички други NRTI Combivir може да причини лактатна ацидоза (натрупване на млечна киселина в организма), а при бебета на жени, приемали Combivir по време на бременността – митохондриална дисфункция (увреждане на произвеждащите енергия компоненти в клетките, което може да причини проблеми с кръвта).
Nagu kõik teisedki nukleosiid- pöördtranskriptaasi inhibiitorid, võib ka Combivir põhjustada laktoatsidoosi (piimhappe kogunemist organismi) ning raseduse ajal Combiviri kasutanud emade imikutel mitokondrite talitlushäireid (energiat tootvate rakuosade kahjustus, mis võib põhjustada verehäireid).