За лицата, които получават Cubicin, нежеланите лекарствени реакции, които са най- често съобщавани по време на лечението и периода на проследяване са: главоболие, гадене, повръщане, диария, гъбични инфекции, обрив, реакции на мястото на инфузията, повишаване на стойностите на креатин фосфокиназа (CPK) и нарушени стойности на чернодробните ензими; Аланин аминотрансфераза (ALT), Аспартат аминотрансфераза (AST), Алкална фосфатаза.
Cubicin’ i saanud isikutel olid kõige sagedamini ravi ajal pluss kontrollperioodi jooksul esinenud kõrvaltoimeteks: peavalu, iiveldus, oksendamine, kõhulahtisus, seeninfektsioonid, lööve, infusioonikoha reaktsioon, kreatiinfosfokinaasi (KFK), normist erinevad maksaensüümide: alaniinaminotransferaasi (ALAT), aspartaataminotransferaasi (ASAT) ja aluselise fosfataasi tõusnud tasemed.