Механизмът на действие, установен при проведени in vitro изследвания, е инхибиране на вирусния ензим обратна транскриптаза, което води до прекъсване веригата на ДНК и по този начин се възпрепятства репликацията на вируса.
In vitro uuringud on näidanud, et abakaviiri toimemehhanism seisneb HIV pöördtranskriptaasi inhibeerimises, mille tulemuseks on ahela katkemine ja viiruse replikatsioonitsükli katkestamine.