Както и при другите лекарствени продукти от тази група, ципрофлоксацин предизвиква артропатия в големите носещи стави на незавършили своето развитие животни.
Sarnaselt teiste samasse klassi kuuluvate ravimitega on näidatud, et tsiprofloksatsiin põhjustab veel väljaarenemata loomadel keharaskust kandvate liigeste artropaatiat.