По този начин се установява дали са налице усложнения, напр. улцера, възпаление на стомашната лигавица, породена от автоимунна реакция и злокачествени тумори.
Invasiivsete endoskoopiliste meetodite kasutamine diferentsiaaldiagnostilistel eesmärkidel võib olla näidustatud, et uurida patsienti teiste komplitseerivate seisundite, näiteks haavandi, autoimmuunse gastriidi ja maliigsuse suhtes.