При физиологична температура и рН анидулафунгин претърпява бавено химично разграждане до пептид с отворен пръстен, който няма антигъбична активност.
Bei physiologischen Temperaturen und einem physiologischen pH-Wert unterliegt Anidulafungin einem langsamen chemischen Abbau zu einem Peptid mit offener Ringstruktur, das keine antimykotische Aktivität aufweist.