Основният път на очистване на топотекан е чрез хидролиза на лактонния пръстен до образуване на карбоксилат с отворен пръстен.
Μια μείζων οδός κάθαρσης της τοποτεκάνης συνίσταται στην υδρόλυση του λακτονικού δακτυλίου σε ανοικτό καρβοξυλικό δακτύλιο.