Механизми на резистентност, които инактивират други антибиотици, като пропускливост на бариерите (често при Pseudomonas aeruginosa) и механизми на ефлукс, могат да променят чувствителността към ципрофлоксацин.
Οι µηχανισµοί αντίστασης που αδρανοποιούν άλλα αντιβιοτικά, όπως φραγµός διαπερατότητας (συχνά στο Pseudomonas aeruginosa) και οι µηχανισµοί εξαγωγής µπορεί να επηρεάσουν την ευαισθησία στη ciprofloxacin.