Някои пациенти в клиничните изпитвания са получавали естроген (интравагинално, трансдермално или орално) докато са приемали алендронат.
Δεν αναμένονται άλλες αλληλεπιδράσεις κλινικής σημασίας; με άλλα φαρμακευτικά προϊόντα Ενας αριθμός γυναικών που μετείχαν σε κλινικές μελέτες, έλαβε οιστρογόνα (ενδοκολπικά, διαδερμικά ή από του στόματος) ενώ ελάμβαναν ταυτόχρονα alendronate.