Метаболизмът на апрепитант се осъществява основно чрез окисляване на морфолиновия пръстен и неговите странични вериги, като получените метаболити са слабо активни.
Ο μεταβολισμός της απρεπιτάντης συμβαίνει αργά μέσω οξείδωσης στον μορφολινο- δακτύλιο και των πλευρικών του αλυσίδων και οι τελκοί μεταβολίτες ήταν ασθενώς μόνο ενεργοί.