Потенциалът за кръстосана резистентност между ефавиренц и НИОТ е малък, поради различните места за свързване върху мишената и механизма на действие.
Η πιθανότητα για διασταυρούµενη αντοχή ανάµεσα στο efavirenz και στα NRTIs είναι χαµηλή λόγω των διαφορετικών θέσεων δέσµευσης στο στόχο και του διαφορετικού µηχανισµού δράσης.