In vitro резистентност към ципрофлоксацин може да бъде придобита чрез поетапен процес на таргетни локални мутации на ДНК гираза и топоизомераза II.
In- vitro αντίσταση στη ciprofloxacin µπορεί να αποκτηθεί µέσω βηµατικής διεργασίας από µεταλλάξεις του τόπου- στόχου τόσο στηDNA- γυράση, όσο και στην τοποϊσοµεράση IV.