Реакция на свръхчувствителност (сериозна алергична реакция) се съобщава при около 5 на всеки 100 пациента, лекувани с абакавир.
Έχει αναφερθεί μία αντίδραση υπερευαισθησίας (σοβαρή αλλεργική αντίδραση) σε περίπου 5 ανά 100 ασθενείς που έλαβαν θεραπεία με αβακαβίρη.