Отделянето става чрез ренална екскреция на метаболитите, като 89% са сулфатни и глюкоронидни конюгати на 6- хидроксимелатонин и 2% се отделя като мелатонин (непроменено лекарство).
Η αποβολή γίνεται µέσω νεφρικής απέκκρισης των µεταβολιτών, 89% ως θειική και γλυκουρονική σύζευξη της 6- υδροξυµελατονίνης και 2% εκκρίνεται ως µελατονίνη (αναλλοίωτο φάρµακο).