Съобщават се случаи на свързана с BK вирус нефропатия, както и на свързана с JC вирус прогресивна мултифокална левкоенцефалопатия (ПМЛ), при пациенти, лекувани с имуносупресори, включително Rapamune.
Έχουν αναφερθεί περιπτώσεις νεφροπάθειας σχετιζόµενης µε τον ιό ΒΚ, όπως και περιπτώσεις προοδευτικής πολυεστιακής λευκοεγκεφαλοπάθειας (PML) σχετιζόµενης µε τον ιό JC σε ασθενείς στους οποίους χορηγούνται ανοσοκατασταλτικά, συµπεριλαµβανοµένου και του Rapamune.