В тялото антитромбинът блокира тромбина – едно от веществата, участващи в коагулацията на кръвта (кръвосъсирването).
Στον οργανισμό η αντιθρομβίνη αναστέλλει τη θρομβίνη, μια από τις ουσίες που συμμετέχουν στην πήξη του αίματος.