Каспофунгин ацетат потиска синтезата на бета (1, 3) – D– гликан, който е основен компонент от клетъчната стена на много нишковидни гъби и дрожди.
Το caspofungin acetate αναστέλει τη σύνθεση της βήτα (1, 3) – D- γλυκάνης που είναι βασικό συστατικό του κυτταρικού τοιχώματος πολλών νηματοειδών μυκήτων και ζυμομυκήτων.