Приблизително 20% се екскретира като общ топотекан, а 2% се екскретира под формата на N- дезметил топотекан в урината.
Το 20% περίπου απεκκρίθηκε ως ολική τοποτεκάνη και το 2% ως N- desmethyl τοποτεκάνη στα ούρα.