Етравиринът се свързва пряко с обратната транскриптаза (RT) и блокира действията на РНК- зависимата и ДНК- зависимата ДНК полимераза посредством прекъсване на ензимното каталитично място.
Η ετραβιρίνη συνδέεται απευθείας µε την ανάστροφη µεταγραφάση (reverse transcriptase, RT) και αποκλείει τις δράσεις της εξαρτώµενης από το RNA και εξαρτώµενης από το DNA, DNA πολυµεράσης προκαλώντας διαταραχή της θέσης κατάλυσης του ενζύµου.