След перорално приложение 19% и след интравенозна приложение 12% от ципрофлоксацин се екскретират в урината и фекалиите под формата на метаболити.
Μετά την χορήγηση από το στόµα 19% και µετά από ενδοφλέβια χορήγηση 12% σιπροφλοξασίνης απεκκρίνεται στα ούρα και στα κόπρανα µε τη µορφή µεταβολιτών.