Основният път на метаболизъм на неларабин е О- деметилиране от аденозин дезаминаза, при което се образува ara- G, който претърпява хидролиза и се образува гуанин.
Η κύρια οδός μεταβολισμού του nelarabine είναι η O- απομεθυλίωση μέσω της απαμινάσης της αδενοσίνης, προς σχηματισμό του ara- G, το οποίο υφίσταται υδρόλυση προς σχηματισμό γουανίνης.