При пациенти с епилепсия или други лезии на централната нервна система (напр. пациенти с анамнеза за гърчове, епилепсия, мозъчна артериосклероза, изменения в мозъчната структура или мозъчен инсулт), ципрофлоксацин трябва да се прилага само след внимателна преценка на съотношението полза/ риск, поради повишения риск от нежелани реакции от страна на централната нервна система.
Σε ασθενείς µε επιληψία ή άλλες διαταραχές του κεντρικού νευρικού συστήµατος (π. χ. µείωση του ορίου σπασµών, ιστορικό επιληπτικών κρίσεων, µειωµένη τροφοδοσία αίµατος στον εγκέφαλο, αλλαγές στη δοµή του εγκεφάλου ή εγκεφαλικό), η σιπροφλοξασίνη χρησιµοποιείται µετά από προσεκτική εξέταση του ωφέλους έναντι του κινδύνου γιατί η πιθανότητα ανεπιθυµήτων ενεργειών στο κεντρικό νευρικό σύστηµα θέτει τους ασθενείς αυτούς σε αυξηµένο κίνδυνο.