Тъй като mTOR участва в размножаването на активираните Т- лимфоцити (бели кръвни клетки, които отговарят за атакуването на трансплантирания орган), Rapamune намалява броя на тези клетки, с което понижава риска от отхвърляне на органа.
Καθώς η mTOR συμμετέχει στον πολλαπλασιασμό των ενεργοποιημένων Τ- λεμφοκυττάρων (λευκά αιμοσφαίρια που ευθύνονται κατά βάση για την επίθεση σε μεταμοσχευμένα όργανα), το Rapamune μειώνει τον αριθμό των εν λόγω αιμοσφαιρίων, μειώνοντας παράλληλα τον κίνδυνο απόρριψης οργάνων.