Както при другите антимикробни средства, включително карбапенеми, за дорипенем е показано, че селектира резистентни бактериални щамове.
Όπως και µε άλλους αντιµικροβιακούς παράγοντες, περιλαµβανοµένων των καρβαπενεµών, η δοριπενέµη έχει αποδειχθεί ότι επιλέγει για ανθεκτικά βακτηριακά στελέχη.