Механизми на резистентност Щамове с намалена чувствителност към даптомицин са били докладвани особено при лечението на пациенти с трудни за лечение инфекции и/ или след употреба за продължителни периоди.
Μηχανισμοί αντίστασης Στελέχη με μειωμένη ευαισθησία στη δαπτομυκίνη έχουν αναφερθεί κυρίως κατά τη διάρκεια αγωγής σε ασθενείς των οποίων η θεραπεία είναι δύσκολη ή/ και κατόπιν χορήγησης για μεγάλες χρονικές περιόδους.