Някои данни за генотипна резистентност показват, че при повечето пациенти, които не се повлияват от ННИОТ, вирусните щамове проявяват кръстосана резистентност спрямо други ННИОТ.
Ορισµένα στοιχεία γονοτυπικής αντίστασης δείχνουν ότι σχεδόν στους περισσότερους τους ασθενείς στους οποίους η θεραπεία µε NNRTI αποτυγχάνει, τα ιϊκά στελέχη εκδηλώνουν διασταυρούµενη αντίσταση στα άλλα NNRTIs.