Вирусната резистентност към абакавир при условия in vitro се развива бавно и изисква множествени мутации за клинично значимо нарастване на ЕC50 в сравнение с дивия тип вирус.
Η ιική αντοχή στην αβακαβίρη αναπτύσσεται σχετικά αργά in vitro και απαιτεί πολλαπλές μεταλλάξεις για μία κλινικά σχετική αύξηση του EC50 ως προς τον αρχέγονο τύπο του ιού.