Биохимичните фактори, които могат да бъдат показателни за наследствено или придобито предразположение към венозна или артериална тромбоза, включват резистентност към активиран протеин С (АРС), хиперхомоцистеинемия, недостиг на антитромбин- ІІІ, недостиг на протеин С, недостиг на протеин S, антифосфолипидни антитела (антикардиолипинови антитела, lupus антикоагулант).
Στους βιοχηµικούς παράγοντες που ίσως να είναι ενδεικτικοί κληρονοµικής ή επίκτητης προδιάθεσης για φλεβική ή αρτηριακή θρόµβωση συµπεριλαµβάνονται η αντίσταση στην Ενεργοποιηµένη Πρωτεΐνη C (APC), η υπεροµοκυστεϊναιµία, η ανεπάρκεια αντιθροµβίνης- ΙΙΙ, η ανεπάρκεια πρωτεΐνης C, η ανεπάρκεια πρωτεΐνης S, και τα αντιφωσφολιπιδικά αντισώµατα (αντικαρδιολιπινικά αντισώµατα, αντιπηκτικό λύκου).