За разлика от фенитоин и карбамазепин обаче зонизамид действа избирателно върху гърчовете, произхождащи от кората.
Ωστόσο, σε αντίθεση με τη φαινυτοΐνη και την καρβαμαζεπίνη, η ζονισαμίδη ενεργεί κατά προτίμηση σε σπασμούς που ξεκινούν από το φλοιό του εγκεφάλου.