Точният механизъм, по който алфа интерфероните действат при вирусни заболявания, не е напълно известен, но се смята, че действат като имуномодулатори (вещества, променящи функциите на имунната система, системата за защита на организма).
Ο επακριβής τρόπος δράσης των ιντερφερονών άλφα κατά την εκδήλωση ιογενών παθήσεων δεν είναι πλήρως γνωστός, ωστόσο εικάζεται ότι δρουν ως ανοσοτροποποιητικά (ουσίες που τροποποιούν τον τρόπο με τον οποίο λειτουργεί το ανοσοποιητικό σύστημα, το οποίο είναι το αμυντικό σύστημα του οργανισμού).