Клинични изпитвания са показали нисък, но повишен риск от тромб на насочващия катетър при пациенти, лекувани само с фондапаринукс като антикоагулант по време на перкутанна коронарна интервенция в сравнение с контрола.
Κλινικές μελέτες έχουν δείξει μικρό αλλά αυξημένο κίνδυνο θρόμβωσης του οδηγού καθετήρα σε ασθενείς που έλαβαν μόνο fondaparinux ως αντιπηκτική αγωγή κατά τη διάρκεια της PCI σε σύγκριση με την ομάδα ελέγχου.