Тъй като абакавир повишава скоростта на елиминиране на метадон от организма, пациентите, приемащи метадон, ще бъдат проследявани за симптоми на отнемане и може да се наложи промяна в дозировката на метадон.
Επειδή η αβακαβίρη αυξάνει το ρυθμό απέκκρισης της μεθαδόνης από το σώμα οι ασθενείς που λαμβάνουν μεθαδόνη θα πρέπει να παρακολουθούνται για εμφάνιση συμπτωματολογίας στέρησης και ίσως να χρειαστεί αλλαγή της δόσης της μεθαδόνης.