Пегаптаниб се метаболизира от нуклеази и по тази причина цитохром Р450- медиирани лекарствени взаимодействия са малко вероятни.
Το pegaptanib μεταβολίζεται από νουκλεάσες και συνεπώς φαρμακευτικές αλληλεπιδράσεις μέσω του κυτοχρώματος P450 δεν είναι πιθανές.