Бупренорфин се елиминира с изпражненията чрез екскреция с жлъчния сок на глюкуронираните метаболити (70%), а останалата част се елиминира с урината.
Η βουπρενορφίνη απομακρύνεται με τα κόπρανα μέσω αποβολής από τη χολή των συζευγμένων με γλυκουρονίδια μεταβολιτών (70%), η υπόλοιπη απομακρύνεται με τα ούρα.