Основният метаболит на зидовудин в плазмата и урината е 5`- глюкуронидът, представляващ около 50 - 80% от приложената доза, като той се елиминира чрез бъбречна екскреция.
Το 5 ’ - γλυκουρoνίδιο της ζιδοβουδίνης είναι ο βασικός µεταβολίτης και στον ορό και στα ούρα και αντιπροσωπεύει περίπου το 50 - 80% της χορηγούµενης δόσης που αποβάλλεται µε νεφρική κάθαρση.