Въпреки че сиролимус инхибира човешкия чернодробен микрозомален цитохром P450 CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6, и CYP3A4/ 5 in vitro, не се очаква активното вещество да инхибира действието на тези изоензими in vivo, тъй като концентрациите на сиролимус, необходими да се осъществи инхибиране, са много по- високи от наблюдаваните при пациенти, получаващи терапевтични дози Rapamune.
Παρότι το σιρόλιµους αναστέλλει in vitro το ανθρώπινο ηπατικό µικροσωµιακό κυτόχρωµα P450, CYP2C9, CYP2C19, CYP2D6, και CYP3A4/ 5, δεν αναµένεται ότι η δραστική ουσία θα αναστέλλει τη δραστηριότητα αυτών των ισοενζύµων in vivo, µια και οι συγκεντρώσεις του σιρόλιµους οι απαραίτητες να προκαλέσουν αναστολή είναι πολύ υψηλότερες από αυτές που παρατηρούνται στους ασθενείς που λαµβάνουν θεραπευτικές δόσεις του Rapamune.