Заради това, лечението с индинавир трябва да бъде започнато с препоръчваната доза, за да се увеличи супресията на вирусната репликация и по този начин да се намали появата на резистентни вируси.
Συνεπώς η θεραπεία με ινδιναβίρη θα πρέπει να αρχίζει με τη συνιστώμενη δόση ώστε να αυξηθεί η καταστολή του ιϊκού αναδιπλασιασμού και έτσι να αποτρέψει την εμφάνιση ανθεκτικού ιού.