Поради продължителния инкубационен период на хепатит B, възможно е в момента на ваксиниране вече да има неразпозната форма на инфекцията.
Λόγω του µεγάλου χρόνου επώασης της ηπατίτιδας Β, είναι δυνατό να υπάρχει µη διαγνωσµένη ηπατίτιδα Β κατά το χρόνο του εµβολιασµού.