Fluoxetine се метаболизира предимно чрез ензимната система P- 450, макар точната изоформа при кучета да е неизвестна.
Η φλουοξετίνη µεταβολίζεται ευρέως από το ενζυµικό σύστηµα P- 450, αν και η ακριβής ισοµορφή σε σκύλους δεν είναι γνωστή.