Метаболизирането на азацитидин става чрез спонтанна хидролиза и чрез дезаминиране, осъществено от цитидин дезаминазата.
Ο μεταβολισμός της azacitidine γίνεται μέσω αυθόρμητης υδρόλυσης και απαμίνωσης, η οποία μεσολαβείται από την απαμινάση της κυτιδίνης.