При комбинирането на trimethoprim със sulfamethoxazole се наблюдава синергичен и бактерициден ефект, понеже trimethoprim и sulfamethoxazole инхибират последователни стъпки от процеса на синтез на тетрахидрофолиевата киселина - един есенциален метаболитен кофактор при бактериалната синтеза на пурин и от тук - на ДНК.
Όταν η τριµεθοπρίµη συνδυαστεί µε τη σουλφοµεθοξαζόλη εµφανίζεται συνεργική και βακτηριδιοκτόνος δράση, καθώς η τριµεθοπρίµη και η σουλφαµεθοξαζόλη αναστέλλουν τα βήµατα που ακολουθούνται στη σύνθεση του τετραϋδροφολικού οξέος, απαραίτητου µεταβολικού παράγοντα στη βακτηριδιακή σύνθεση της πουρίνης και, συνεπώς, του DNA.