Допълнителни нежелани реакции, които са съобщавани много рядко (при по- малко от 1 на 10 000 дози ваксина) в дните или седмиците след ваксинация с ваксини срещу хепатит B, включват припадъци, прималявания, заболяване на нервите на окото, множествена склероза, загуба на чувствителност в някои части на тялото или на способността за движението им, тежко главоболие със схванат врат, нарушаване на нормалните мозъчни функции.
Επιπρόσθετες ανεπιθύμητες ενέργειες έχουν αναφερθεί πολύ σπάνια (λιγότερο από 1 στις 10, 000 δόσεις εμβολίου) τις επόμενες ημέρες ή εβδομάδες μετά τον εμβολιασμό με εμβόλια για την ηπατίτιδα Β, περιλαμβανομένων σπασμών, λιποθυμιών, νόσου των οφθαλμικών νεύρων, σκλήρυνσης κατά πλάκας, απώλειας της αισθητικότητας ή αδυναμία κίνησης ορισμένων μελών του σώματος, σοβαρής κεφαλαλγίας με αυχεναλγία, διακοπής της φυσιολογικής εγκεφαλικής λειτουργίας.