In vitro, фондапаринукс се свързва специфично и в голяма степен с белтъка антитромбин, като свързването е зависимо от дозата и плазмената концентрация (98, 6% до 97, 0% в границите на концентрации от 0, 5 до 2 mg/ l).
In vitro, το fondaparinux δεσμεύεται σημαντικά και εξειδικευμένα με την πρωτεΐνη της αντιθρομβίνης με δέσμευση σε δοσο - εξαρτώμενη συγκέντρωση πλάσματος (98, 6% έως 97, 0% στο εύρος συγκεντρώσεων από 0, 5 έως 2 mg/ l).