Протеазните инхибитори са свързани също с метаболитни нарушения, като хипертриглицеридемия, хиперхолестеролемия, инсулинова резистентност и хипергликемия.
Οι αναστολείς της πρωτεάσης επίσης σχετίζονται µε µεταβολικές διαταραχές όπως υπερτριλυκεριδαιµία, υπερχοληστεριναιµία, αντοχή στην ινσουλίνη και υπεργλυκαιµία.