Биматопрост преминава през оксидиране, N - деетилиране и глюкурониране и образува разнообразни метаболити.
Η βιματοπρόστη μετά υφίσταται οξείδωση, N - αποαιθυλίωση και γλυκουρονιδίωση μέσω των οποίων σχηματίζεται ποικιλία μεταβολιτών.