Както при други флуорохинолони, дифлоксацин не трябва да се използва при бързорастящи кучета, защото може да повлияе на хрущяла на някои стави.
Όπως συµβαίνει και µε τις άλλες φθοροκινολόνες, η διφλοξακίνη δεν πρέπει να χρησιµοποιείται σε σκύλους κατά την περίοδο της ταχείας ανάπτυξής τους καθώς µπορεί να επηρεάσει τους χόνδρους ορισµένων αρθρώσεων.