Резистентните към емтрицитабин вируси са имали кръстосана резистентност към ламивудин, но са запазили чувствителност към други нуклеозидни инхибитори на обратната транскриптаза (НИОТ) (зидовудин, ставудин, тенофовир, абакавир, диданозин и залцитабин), всички не- нуклеозидни инхибитори на обратната транскриптаза (ННИОТ) и всички протеазни инхибитори (ПИ).
Οι ανθεκτικοί στην emtricitabine ιοί ήταν διασταυρούµενης αντοχής στη λαµιβουδίνη, αλλά διατήρησαν την ευαισθησία έναντι άλλων νουκλεοσιδικών αναστολέων της ανάστροφης µεταγραφάσης (NRTIs) (zidovudine, stavudine, tenofovir, abacavir, didanosine και zalcitabine), όλων των µη νουκλεοσιδικών αναστολέων της ανάστροφης µεταγραφάσης (NNRTIs) και όλων των αναστολέων της πρωτεάσης (PIs).