Предварителни данни сочат, че има потенциал за възникване, поне в някаква степен, на кръстосана резистентност между ралтегравир и други интегразни инхибитори.
Προκαταρκτικά στοιχεία υποδεικνύουν οτι υπάρχει πιθανότητα για τουλάχιστον μερικού βαθμού διασταυρούμενη αντοχή να εμφανισθεί μεταξύ της ραλτεγκραβίρης και άλλων αναστολέων της ιντεγκράσης.