Както и с другите лекарства против ХИВ, при пациентите, които приемат APTIVUS, може да има риск от липодистрофия (промени в разпределението на телесна мазнина), остеонекроза (смърт на костна тъкан) или синдром на имунната реактивация (симптоми на инфекция, причинени от възстановяващата се имунна система).
Όπως και με άλλα φάρμακα κατά του HIV, οι ασθενείς στους οποίους χορηγείται APTIVUS διατρέχουν κίνδυνο λιποδυστροφίας (αλλαγών στην κατανομή του σωματικού λίπους), οστεονέκρωσης (νέκρωση του οστικού ιστού) ή εμφάνισης του συνδρόμου επανενεργοποίησης του ανοσοποιητικού συστήματος (συμπτώματα λοίμωξης που προκαλούνται από την αποκατάσταση του ανοσοποιητικού συστήματος).