След перорално приложение ципрофлоксацин се екскретира непроменен, приблизително 70% и след интравенозна приложение приблизително 77%.
Μετά τη χορήγηση από το στόµα η σιπροφλοξασίνη απεκκρίνεται αµετάβλητη περίπου το 70% και µετά από ενδοφλέβια χορήγηση για περίπου το 77%.