Тъй като употребата на концентрати на фактор IX комплекс досега винаги е била асоциирана с развитие на тромбоемболични усложнения, като рискът е по- голям при препаратите с ниска чистота, прилагането на продукти, съдържащи фактор IX, може да е потенциално вредно при пациенти с признаци на фибринолиза и такива с дисеминирана интраваскуларна коагулация (ДИК).
Δεδομένου ότι η χρήση συμπυκνωμένων συμπλεγμάτων του παράγοντα IX έχει συνδεθεί ιστορικά με την ανάπτυξη θρομβοεμβολικών επιπλοκών, με υψηλότερο κίνδυνο στα παρασκευάσματα χαμηλής καθαρότητας, η χρήση προϊόντων που περιέχουν παράγοντα IX πιθανόν να είναι δυνητικά επικίνδυνη σε ασθενείς με σημεία ινωδόλυσης και σε ασθενείς με διάχυτη ενδοαγγειακή πήξη (DIC).