Веднъж образуван, ХФИП бързо се свързва с глюкуроновата киселина и се елиминира като метаболит в урината.
Αφού σχηµατιστεί η εξαφθοριοισοπροπανόλη (HFIP), συνδέεται ταχέως µε το γλυκουρονικό οξύ και αποβάλεται ως µεταβολίτης από τα ούρα. ∆εν έχουν εντοπιστεί άλλες µεταβολικές οδοί του σεβοφλουρανίου.