За лицата, които получават Cubicin, нежеланите лекарствени реакции, които са най- често съобщавани по време на лечението и периода на проследяване са: главоболие, гадене, повръщане, диария, гъбични инфекции, обрив, реакции на мястото на инфузията, повишаване на стойностите на креатин фосфокиназа (CPK) и нарушени стойности на чернодробните ензими; Аланин аминотрансфераза (ALT), Аспартат аминотрансфераза (AST), Алкална фосфатаза.
Στα άτομα τα οποία έλαβαν Cubicin, οι πιο συχνά αναφερθείσες ανεπιθύμητες ενέργειες κατά τη διάρκεια της θεραπείας συν την περίοδο παρακολούθησης ήταν: κεφαλαλγία, ναυτία, έμετος, διάρροια, μυκητιασικές λοιμώξεις, εξάνθημα, αντίδραση στο σημείο της έγχυσης, αυξημένα επίπεδα φωσφοκινάσης της κρεατίνης (CPK) και μη φυσιολογικά ηπατικά ένζυμα: αμινοτρανσφεράση της αλανίνης (ALT), αμινοτρανσφεράση του ασπαραγινικού οξέος (AST), αλκαλική φωσφατάση.