Може да има особен риск от развитие на ципрофлоксацин- резистентни бактерии при удължаване на времето на лечение и когато се лекуват нозокомиални инфекции и/ или инфекции, причинени от Staphylococcus и Pseudomonas.
Μπορεί να υπάρξει ιδιαίτερος κίνδυνος στην επιλογή βακτηρίων µε αντοχή στη ciprofloxacin κατά τη διάρκεια παρατεταµένων διαρκειών θεραπείας και όταν θεραπεύονται νοσοκοµειακές λοιµώξεις και / ή λοιµώξεις προκαλούµενες από είδη Staphylococcus και Pseudomonas.