Тя ще бъде заменена с директива (2006/ 118/ EО), която ще влезе в сила преди 2013 г.
Εν συνεχεία της εισαγωγής της οδηγίας πλαίσιο για τα ύδατα (2000/ 60/ ΕΚ), η οδηγία 80/ 68/ EOK περί προστασίας των υπόγειων υδάτων θα καταργηθεί έως το 2013 και θα αντικατασταθεί από την οδηγία (2006/ 118/ EΚ) η οποία θα τεθεί σε ισχύ πριν από το 2013.