Вирусната резистентност към абакавир при условия in vitro се развива бавно, като това изисква множество мутации за клинично значимо повишаване на ЕC 50 спрямо дивия тип вирус.
Η ιική αντοχή στην αβακαβίρη αναπτύσσεται σχετικά αργά in vitro και απαιτεί πολλαπλές μεταλλάξεις για μία κλινικά σχετική αύξηση του ΕC 50 ως προς τον αρχέγονο τύπο του ιού.