Съотношението между концентрациите му в ликвора и AUC е между 30 и 44%.
Μελέτες σε ασθενείς μολυνθέντες με HIV απέδειξαν ότι η αβακαβίρη διεισδύει ικανοποιητικά στο εγκεφαλονωτιαίο υγρό (CSF), με αναλογία εγκεφαλονωτιαίου υγρού AUC προς το πλάσμα AUC, μεταξύ 30 έως 44%.