Точният начин, по който алфа интерфероните действат при вирусни заболявания, не е напълно изяснен, но се смята, че те действат като имуномодулатори (вещества, които променят начина, по който действа имунната система, защитната система на организма).
Ο επακριβής τρόπος δράσης των ιντερφερονών άλφα κατά την εκδήλωση ιογενών παθήσεων δεν είναι πλήρως γνωστός, ωστόσο εικάζεται ότι δρουν ως ανοσοτροποποιητικά (ουσίες που αλλάζουν τον τρόπο με τον οποίο λειτουργεί το ανοσοποιητικό σύστημα, δηλαδή το αμυντικό σύστημα του οργανισμού).