Цитарабин, при интратекално прилагане, е бил свързван с гадене, повръщане и сериозни токсични ефекти върху централната нервна система, включително слепота, миелопатия и други прояви на невротоксичност, водещи понякога и до траен неврологичен дефицит.
Η cytarabine, όταν χορηγείται ενδορραχιαίως, έχει σχετιστεί με ναυτία, έμετο και σοβαρή τοξικότητα του κεντρικού νευρικού συστήματος που περιλαμβάνει τύφλωση, μυελοπάθεια και άλλα νευρολογικά τοξικά φαινόμενα που μερικές φορές προκαλούν μόνιμη νευρολογική ανεπάρκεια.