Метаболитите и непромененият абакавир в урината представляват около 83% от приетата доза, а останалото количество се елиминира с фецеса.
Noin 83% otetusta abakaviiriannoksesta on virtsassa joko metaboliitteina tai muuttumattomana abakaviirina, loppu eliminoituu ulosteeseen.