Биотрансформацията на емтрицитабин включва оксидиране на тиоловата група до образуване на 3 '- сулфоксид диастереомери (приблизително 9% от дозата) и конюгация с глюкоронова киселина дообразуване на 2' - O- глюкоронид (приблизително 4% от дозата).
Emtrisitabiinin biotransformaation aikana sen tioliosio oksidoituu 3 ’ - sulfoksididiastereomeereiksi (noin 9% annoksesta) ja konjugoituu glukuronihapon kanssa, jonka seurauksena muodostuu 2 ’ - O- glukuronidia (noin 4% annoksesta).