При пациенти с епилепсия или други лезии на централната нервна система (например понижен гърчов праг, анамнеза за епилептични гърчове, намалено мозъчно кръвообращение, изменения в мозъчната структура или удар), ципрофлоксацин трябва да се използва след внимателна преценка на ползите срещу риска, тъй като възможността за нежелани лекарствени реакции от централната нервна система води до повишен риск при тези пациенти.
Epilepsiaa sairastavilla potilailla ja potilailla, joilla on muita keskushermoston leesioita (esim. alentunut kouristuskynnys, aikaisemmin on esiintynyt epileptisiä kohtauksia, heikentynyt aivoverenkierto, muutoksia aivojen rakenteessa tai aivohalvaus), siprofloksasiinia saa käyttää vain sen jälkeen kun hoidon mahdollista hyötyä ja siitä aiheutuvia riskejä on punnittu huolellisesti, sillä keskushermostoon kohdistuvien haittavaikutusten mahdollisuus suurentaa potilaan riskiä.