Ертапенем е ефективно устойчив на хидролиза от повечето класове бета- лактамази, включително пеницилази, цефалоспоринази и широкоспектърни беталактамази, но не и към метало- бета- лактамазите.
Metisilliiniresistentit stafylokokit ja enterokokit ovat resistenttejä ertapeneemille, mikä johtuu penisilliiniä sitovien proteiinien heikentyneestä kyvystä sitoa ertapeneemia; P. aeruginosa ja muut non- fermentatiiviset bakteerit ovat yleensä resistenttejä, mikä johtuu todennäköisesti solujen vähäisestä läpäisevyydestä ja ertapeneemin aktiivisesta ulosvirtauksesta.