Зидовудин може да взаимодейства и със следните лекарства и може да засили нежеланите ефекти: фенитоин, пробенецид, рифампицин, атоваквон, валпроева киселина, метадон, дапсон, пентамидин, пириметамин, ко- тримоксазол, флуконазол, амфотерицин, флуцитозин, ганцикловир, интерферон, кларитромицин, винкристин, винбластин и доксорубицин.
Fenytoiini, probenesidi, rifampisiini, atovakvoni, valproiinihappo, metadoni, dapsoni, pentamidiini, pyrimetamiini, sulfa- trimetopriimi, flukonatsoli, amfoterisiini, flusytosiini, gansikloviiri, interferoni, klaritromysiini, vinkristiini, vinblastiini ja doksorubisiini.