Както при други антикоагуланти, дезирудин трябва да се използва с повишено внимание заедно с лекарствени средства, които повлияват тромбоцитната функция тези лекарствени продукти включват: ацетилсалицилова киселина и НСПВС, тиклопидин и клопидогрел, антагонисти на гликопротеин IIb/ IIIa (абциксимаб, ептифибатид, тирофибан) и илопрост.
Kuten muitakin antikoagulantteja käytettäessä, varovaisuutta on noudatettava myös, kun desirudiinia käytetään yhdessä verihiutaleiden toimintaan vaikuttavien lääkkeiden kanssa, näitä lääketuotteita ovat esim. asetylisalisyylihappo - ja NSAID- lääkkeet, tiklopidiini ja klopidogreli, glykoproteiini IIb/ IIIa - antagonistit (absiksimabi, eptifibatidi, tirofibaani) ja iloprosti.