Както и при другите квинолони, поради възможни странични ефекти върху ставния хрущял на носещите стави difloxacin не трябва да се използва във фазата на усилен растеж на животното.
Kuten muillakin kinoloneilla, mahdollisten painoa kantavien nivelten nivelrustolle aiheutuvien haittavaikutusten vuoksi difloksasiinia ei tulisi käyttää koirille nopean kasvuvaiheen aikana.