Поради афинитета си към цитохром CYP2C9 in vitro, толкапон може да интерферира с лекарства, чийто клирънс зависи от този метаболитен път, като например толбутамид и варфарин.
Koska in vitro - tutkimuksissa tolkaponilla on todettu affiniteettiä sytokromi CYP2C9 - entsyymiin, tolkaponilla voi olla yhteisvaikutuksia tämän isoentsyymin kautta metaboloituvien lääkeaineiden (esim. tolbutamidi ja varfariini) kanssa.