В урината, черният дроб, сланината и бъбреците метаболити на диметил- дифлоксацин и дифлоксацин N - окис се срещат в минимални количества.
Virtsassa, maksassa, rasvakudoksessa ja munuaisissa esiintyy muuttumattoman difloksasiinin lisäksi pieniä määriä aineenvaihduntatuotteita, desmetyyli- difloksasiinia ja difloksasiini- N- oksidia.