И при двата вида difloxacin конюгира (глюкуронидира или сулфатира), дезметилира в сарафлоксацин или оксидира в N- оксид- дифлоксацин.
Molemmilla lajeilla difloksasiini voi konjugoitua (glukuronidoitua tai sulfatoitua), desmetyloitua sarafloksasiiniksi tai hapettua N- oksidi- difloksasiiniksi.