RotaTeq е противопоказен за кърмачета с предходна анамнеза за инвагинация или с проблеми със стомашно- чревния тракт, които могат да бъдат предразположени към инвагинация, или при кърмачета с доказан или суспектен имунодефицит.
RotaTeqia ei saa myöskään antaa lapsille, joilla on aikaisemmin ollut suolentuppeuma, tai lapsille, joilla on sellaisia suoliongelmia, jotka voivat altistaa heidät tälle sairaudelle, eikä lapsille, joiden immuunijärjestelmä on heikentynyt.