Както при други инхибитори на ксантиноксидазата, съобщени са нежелани реакции като сомнолентност, замаяност и парестезия.
Muiden ksantiinioksidaasin estäjien tavoin febuksostaatin on ilmoitettu aiheuttavan uneliaisuuden, huimauksen ja parestesian kaltaisia haittavaikutuksia.