Топотекан инхибира топоизомераза- I чрез стабилизиране на ковалентния комплекс на ензима с разцепената на две вериги ДНК, който е междинен етап на каталитичния механизъм.
Topotekaani estää topoisomeraasi- I: ta stabiloimalla entsyymin kovalenttikompleksia ja säikeikseen auennutta DNA: ta, joka on katalyyttisen mekanismin välituote.