Зонизамид се метаболизира основно чрез редуктивно разцепване на бензизоксазоловия пръстен на изходното лекарство от CYP3A4, за да се образува 2- сулфамоилацетилфенол (SMAP) и също чрез N- ацетилиране.
Tsonisamidi metaboloituu pääasiassa kantalääkkeen bentsisoksatsoli- renkaan pelkistävän pilkkoutumisen kautta CYP3A4: n avulla jolloin muodostuu 2- sulfamoyyliasetyylifenolia (SMAP), sekä myös N- asetylaation kautta.