При клинични проучвания единствените нежелани реакции, системно считани за свързвани с прилагането на филграстим, са мускулно- скелетна болка, лека до умерена болка в костите и миалгия.
Ainoat haittavaikutukset, joiden kliinisissä tutkimuksissa katsottiin säännönmukaisesti liittyneen filgrastiimin antoon, olivat muskuloskeletaalinen kipu, pääasiassa lievä tai keskivaikea luukipu ja lihaskipu.