Механизъм на действие Индинавир потиска рекомбинантната HIV- 1 и HIV- 2 протеаза, с приблизително десетократно по- изразена селективност за HIV- 1, отколкото за HIV- 2.
Sen vaikutus HIV- 1: n proteinaasiin on noin kymmenkertainen HIV- 2: n proteinaasiin verrattuna.