Зонизамид се метаболизира частично от CYP3A4 (редуктивно разцепване) и също от N- ацетил - трансферази и конюгиране с глюкуронова киселина.
Tsonisamidi metaboloituu osaksi CYP3A4: n kautta (pelkistävä pilkkoutuminen) sekä myös N- asetyyli- transferaasien ja glukuronihappokonjugaation kautta.