Кръстосана резистентност между ампренавир и инхибиторите на обратната транскриптаза е малко вероятно да се появи, тъй като мишените на ензимите са различни.
Ristiresistenssi amprenaviirin ja käänteiskopioijaentsyyminestäjien välillä on epätodennäköinen, koska niillä on eri kohde- entsyymit.