Антитромботичната активност на фондапаринукс е резултат от медиираното от антитромбин III (ATIII) селективно инхибиране на фактор Xa.
Fondaparinuuksin antitromboottinen vaikutus johtuu hyytymistekijä Xa: n antitrombiini III (ATIII) - välitteisestä selektiivisestä estosta.