В основни проучвания с прилагане 3 пъти седмично, най- често съобщаваните нежелани лекарствени реакции, за които се счита, че е вероятно или възможно да бъдат свързани с лечението с имиквимод крем, са реакциите на мястото на приложение в третирания участък с брадавици (33, 7% от пациентите, лекувани с имиквимод).
I de pivotale forsøg med dosering 3 gange om ugen var de hyppigst indberettede lægemiddelbivirkninger, der blev vurderet til sandsynligvis eller muligvis at være forbundet med behandlingen med Imiquimod- creme, reaktioner på påføringsstedet (33, 7% af de patienter, der blev behandlet med imiquimod).