Антитромботичната активност на фондапаринукс е резултат от медиираното от антитромбин III 32 (антитромбин) селективно инхибиране на фактор Xa.
Ved selektiv binding til antitrombin TIII øger fondaparinux antitrombin TIII naturlige hæmning af Faktor Xa (ca.