Z těch byly v systémovém oběhu detekovány tyto metabolity mikafunginu:
La micafungine s’ est révélée être métabolisée en plusieurs composés, parmi lesquels M-1 (forme catéchol), M-2 (forme méthoxy de M-1) et M-5 (hydroxylation de la chaîne latérale), qui ont été détectés dans la circulation systémique.