Metabolizmus Moxifloxacin prochází fází II biotransformace a je vylučován renálními a žlučovými/ fekálními cestami v nezměněné podobě a stejně jako thiosloučenina (M1) a glukuronid (M2).
La moxifloxacine subit une biotransformation de Phase II et est excrétée par les voies rénale et biliaire/ fécale à l’ état inchangé mais également sous la forme de deux métabolites, l’ un sulfoconjugué (M1) et l’ autre glucuroconjugué (M2).