Metabolismus aprepitantu probíhá ve velké míře cestou oxidace v morfolinovém kruhu a jeho postranních řetězcích a výsledné metabolity jsou pouze slabě aktivní.
Le métabolisme de l’ aprépitant intervient largement via l’ oxydation au niveau du cycle de la morpholine et de ses chaînes latérales, les métabolites qui en résultent n’ étant que faiblement actifs.