Zhoršení funkce ledvin bylo pozorováno po aplikaci kyseliny zoledronové především u pacientů s již existující sníženou funkcí ledvin nebo dalšími rizikovými faktory (např. pacienti s onkologickým onemocněním podstupujícící chemoterapii, pacienti se současnou nefrotoxickou léčbou, závažnou dehydratací), z nichž většina dostávala dávku 4 mg každé 3- 4 týdny, bylo to však pozorováno také u pacientů po jednorázovém podání.
Munuaisten toimintahäiriöitä on todettu tsoledronihapon annon jälkeen, erityisesti potilailla, joilla ennestään oli munuaisten vajaatoiminta tai ylimääräisiä riskitekijöitä (esim. kemoterapiaa saavat syöpäpotilaat, nefrotoksinen lääkitys, vaikea- asteinen dehydraatio) ja joista valtaosa sai 4 mg annoksen 3– 4 viikon välein, mutta sitä on todettu myös yhden antokerran jälkeen.