Podobně jako u jiných léků pro léčbu HIV existuje u pacientů užívajících přípravek Atripla zvýšené riziko lipodystrofie (změny rozložení tuku v těle), osteonekrózy (odumření kostní tkáně) nebo syndromu imunitní reaktivace (příznaky infekce způsobené zotavujícím se imunitním systémem).
Atriplaa, kuten muitakin HIV- lääkkeitä, ottavilla potilailla saattaa olla kasvanut lipodystrofian (rasvan jakautumisen muutoksia ruumiissa), osteonekroosin (luukudoksen kuolion) tai immuunireaktivaatio - oireyhtymän (toipuvan immuunijärjestelmän aiheuttamia infektio- oireita) riski.