Přesto, stejně jako u jiných látek ovlivňujících renin- angiotensinový systém, existuje zvýšené riziko závažné hypotenze a renální insuficience včetně selhání ledvin, jestliže jsou pacienti se stenózou renální arterie léčeni aliskirenem.
Kuitenkin aliskireenilla, kuten muillakin reniini- angiotensiinijärjestelmään vaikuttavilla lääkkeillä, on olemassa suurentunut munuaisten vajaatoiminnan riski hoidettaessa potilaita, joilla on munuaisvaltimon ahtauma.