Na základě údajů od 13 pacientů dosud neléčených antiretrovirotiky u kterých selhává léčba fosamprenavirem, a na základě omezených in vitro dat (místně cílená mutageneze), vedly cesty rezistence spojené s amprenavirem k omezené zkřížené rezistenci k lopinaviru (dostupné klinické údaje z 13 izolátů), zatímco citlivost na atazanavir (ze 4 izolátů) a tipranavir (ze 2 izolátů) se obecně zachovala.
25 potilaasta (joista yksi oli lähtötilanteessa resistentti lopinaviirille ja sakvinaviirille ja toinen oli resistentti tipranaviirille), jotka eivät olleet saaneet aiempaa antiretroviruslääkitystä ja joilla fosamprenaviiria sisältävä hoito epäonnistui, saadun tiedon perusteella amprenaviiriin liittyvät resistenssimekanismit saavat aikaan osittaisen ristiresistenssin atatsanaviirille/ ritonaviirille (kolme 25: stä), darunaviirille/ ritonaviirille (neljä 25: stä), indinaviirille/ ritonaviirille (yksi 25: stä), lopinaviirille/ ritonaviirille (kolme 24: stä), sakvinaviirille (kolme 24: stä) ja tipranaviirille/ ritonaviirille (neljä 24: stä).