Proto léky, které buď mají stejnou metabolickou cestu nebo modifikují aktivitu CYP3A4, mohou ovlivňovat farmakokinetiku indinaviru.
Tämän vuoksi muut aineet, jotka käyttävät samaa metaboliatietä tai muuttavat CYP3A4: n aktiivisuutta, voivat vaikuttaa indinaviirin farmakokinetiikkaan.