Sildenafil má především vyšší (více než 4000x) selektivitu k PDE5 oproti PDE3, což je cAMP- specifická izoforma fosfodiesterázy účastnící se kontroly srdeční kontraktility.
Erityisesti sildenafiili estää PDE5: ttä yli 4000 kertaa selektiivisemmin kuin PDE3: a, joka on cAMP spesifinen sydämen supistuvuuden säätelyyn osallistuva fosfodiesteraasi- isoentsyymi.