Pegaptanib je metabolizován nukleázami, lékové interakce zprostředkované cytochromem P450 jsou tedy nepravděpodobné.
Pegaptanibi metaboloituu nukleaasien välityksellä, ja siksi sytokromi P450 - välitteiset lääkeyhteisvaikutukset ovat epätodennäköisiä.