Hlavní metabolickou cestou nelarabinu je O- demetylace adenosindeaminázou na ara- G, který je hydrolyzován na guanin.
Adenosiinideaminaasin vaikutuksesta nelarabiini metaboloituu pääasiallisesti O- demetylaation kautta ara- G: ksi, joka hydrolysoituu guaniiniksi.