V klinických studiích prováděných s fondaparinuxem neinteragují perorální antikoagulancia (warfarin) s farmakokinetikou fondaparinuxu; při dávce 10 mg použité v interakčních studiích fondaparinux neovlivňoval protrombinový čas (INR) warfarinu.
Interaktiotutkimuksissa, joissa käytettiin annosta 10 mg, fondapartinuuksi ei vaikuttanut varfariinin INR- aktiivisuuteen.