Metabolity se poté vylučují do žluče buď jako volné nebo jako metabolity glukuronidované.
Metabolia: ihmisillä tehdyt tutkimukset ja ihmisen maksan mikrosomeissa tehdyt in vitro - tutkimukset ovat osoittaneet, että atatsanaviiri metaboloituu pääasiassa CYP3A4- isoentsyymin vaikutuksesta oksidatiivisiksi metaboliiteiksi, jotka erittyvät sappeen joko vapaina tai glukuronisoituneina.