V těle zvířete klomipramin a jeho hlavní metabolit, desmethylklomipramin, zabraňují zpětnému vychytávání některých neurotransmiterů do nervových buněk v mozku a míše.
Kehossa klomipramiini ja sen tärkeä aineenvaihduntatuote desmetyyliklomipramiini estävät joidenkin välittäjäaineiden joutumisen uudestaan aivojen ja selkäytimen hermosoluihin.