Podle hlášených údajů se 75% až 90% požité dávky objeví v moči v prvních 24 hodinách, a to ve formě volného deferipronu, glukuronidového metabolitu a komplexu železo- deferipron.
Eliminaatio Deferiproni eliminoituu ihmisillä pääasiassa munuaisten kautta, ja 75– 90% nautitusta annoksesta on todettu löytyvän virtsasta ensimmäisten 24 tunnin aikana vapaan deferipronin, glukuronidin metaboliitin ja rauta- deferiproniyhdisteen muodossa.