Nejčastějšími nežádoucími účinky vztaženými k léku u všech pacientů léčených methylnaltrexonium - bromidem v průběhu všech fází placebem kontrolovaných studií byly bolest břicha, nauzea, průjem a flatulence.
Yleisimpiä lääkkeeseen liittyviä haittavaikutuksia kaikilla lumekontrolloitujen tutkimusten kaikissa faaseissa kaikilla metyylinaltreksonibromidille altistuneilla potilailla olivat vatsakipu, pahoinvointi, ripuli ja ilmavaivat.