Močí se ve formě metabolitů a intaktního abakaviru vyloučí kolem 83% podané dávky, zbytek se vyloučí stolicí.
Noin 83% otetusta abakaviiriannoksesta on virtsassa joko metaboliitteina tai muuttumattomana abakaviirina, loppu eliminoituu ulosteeseen.