Většina měla mutaci signatury na aminokyselině 155 (N155 změněna na H), na aminokyselině 148 (Q148 změněna na H, K nebo R) nebo na aminokyselině 143 (Y143 změněna na H, C nebo R) spolu s jednou nebo více dalšími mutacemi integrázy.
Useimmissa oli tunnusomainen mutaatio aminohapossa 155 (N155: n vaihtuminen H: ksi) aminohapossa 148 (Q148: n vaihtuminen H: ksi, K: ksi tai R: ksi) tai aminohapossa 143 (Y143: n vaihtuminen H: ksi, C: ksi tai R: ksi) sekä lisäksi yksi tai useampia integraasimutaatioita.