Přesný mechanismus jeho účinku není znám, ale odborníci se domnívají, že váže určitý receptor na povrchu některých mozkových buněk.
Natriumoksibaatin tarkkaa vaikutusmekanismia ei tunneta, mutta sen uskotaan sitoutuvan joidenkin aivosolujen pinnalla oleviin erityisiin reseptorimolekyyleihin.