Stejně jako všechny ostatní NRTI může také přípravek Epivir způsobit laktátovou acidózu (hromadění kyseliny mléčné v těle) a u dětí matek užívajících přípravek Epivir během těhotenství mitochondriální dysfunkci (poškození složek buňky, jež tvoří energii, což může způsobit problémy s krví).
Kuten kaikki muutkin NRTI- lääkkeet, Epivir saattaa myös aiheuttaa maitohappoasidoosia (maitohapon kertyminen elimistöön), sekä raskauden aikana Epiviriä käyttävien äitien vauvoille mitokondrioiden toimintahäiriöitä (vauriot solujen energiaa tuottavissa komponenteissa, mistä voi aiheutua hematologisia ongelmia).