Mikafungin neměl při posuzování standardními in vitro a in vivo testy, včetně jedné in vitro studie neplánované DNA syntézy s využitím potkaních hepatocytů, mutagenní ani klastogenní účinky.
Mikafungiinin ei todettu olevan mutageeninen eikä klastogeeninen, kun sitä arvioitiin tavanmukaisella koesarjalla in vitro ja in vivo, sekä rotan maksasoluilla tehdyllä UDS- kokeella (Unscheduled DNA Synthesis) in vitro.