Metabolismus Palonosetron je odbouráván dvojí cestou, přibližně 40% se odbourává ledvinami a dalších přibližně 50% se metabolizuje za vzniku dvou primárních metabolitů, které mají méně než 1% aktivity palonosetronu jakožto antagonisty receptoru 5HT3.
Metabolia Palonosetroni eliminoituu kahta reittiä: noin 40% eliminoituu munuaisten kautta ja noin 50% metaboloituu muodostaen kaksi päämetaboliittia, joiden 5HT3- receptoriantagonistivaikutus on alle 1% palonosetronin vaikutuksesta.