Jako u jiných chinolonů se vzhledem k možnému nežádoucímu účinku na chrupavky kloubů, které jsou zatíženy hmotností, nedoporučuje používat difloxacin ve fázi intenzivního růstu, tj. nepoužívat u psů malých a středních plemen až do a včetně stáří 8 měsíců, u velkých plemen až do 1 roku stáří a u obřích plemen až do stáří 18 měsíců.
Kuten muillakin kinoloneilla, painoa kantavalle nivelrustolle aiheutuvien haittavaikutusten vuoksi difloksasiinia ei tulisi käyttää nopean kasvuvaiheen aikana, eli pienillä ja keskisuurilla koiraroduilla ennen kuin koirat ovat kahdeksan (8) kuukauden ikäisiä, suurilla koirilla ennen kuin ne ovat yhden (1) vuoden ikäisiä ja erittäin suurilla roduilla ennen kuin koirat ovat 18 kuukautta vanhoja.