82 Bylo identifikováno sedm hlavních metabolitů a metabolické cesty byly popsány jako glukuronidace na úrovni pyridin dusíku, pyridin- N- oxidace s 3´- hydroxylací na indanovém prstenci a bez ní, 3 ′ - hydroxylace indanu, p- hydroxylace fenylmetylové složky a N- depyridometylace s 3 ′ - hydroxylací a bez ní.
Metaboloituminen Tutkimuksissa indinaviirilla todettiin seitsemän päämetaboliittia, ja sen metaboliareitit olivat seuraavat: pyridiinitypen glukuronidaatio, pyridiinin N- oksidaatio joko indaanirenkaan 3 '- hydroksylaation kanssa tai ilman 3' - hydroksylaatiota, indaanin 3 '- hydroksylaatio, fenyylimetyyliryhmän p- hydroksylaatio sekä N- depyridometylaatio joko 3' - hydroksylaation kanssa tai ilman 3 '- hydroksylaatiota.