Stejně jako v případě všech ostatních vakcín, pokud je přípravek RotaTeq používán u velmi předčasně narozených dětí, existuje riziko apnoe (krátké zástavy dechu).
Jos RotaTeqia – kuten kaikkia muitakin rokotteita – annetaan huomattavan ennenaikaisesti syntyneille vauvoille, heillä on apnean (hengityskatkon) riski.