Vzhledem k tomu, že bekaplermin je růstový faktor stimulující proliferaci buněk, musí být u pacientů s malignitami používán jen s velkou opatrností.
Koska bekaplermiini on solujen jakaantumista kiihdyttävä kasvutekijä, sitä on käytettävä varoen potilailla, joilla on pahanlaatuisia sairauksia.