Podobně jako při použití jiných léčivých přípravků obsahujících NRTI může i při použití přípravku Atripla dojít ke vzniku laktátové acidózy (hromadění kyseliny mléčné v těle).
Kuten muutkin NRTI- lääkkeitä sisältävät lääkevalmisteet, Atripla voi myös aiheuttaa maitohappoasidoosia (maitohapon kasaantumista kehoon).