V rámci studií byly nejběžnějšími vedlejšími účinky přípravku Gardasil (zaznamenanými u více než 1 pacientky z 10) pyrexie (horečka) a reakce v místě vpichu (zarudnutí, bolest a otok).
Tutkimuksissa Gardasilin yleisimpiä sivuvaikutuksia (useammalla kuin yhdellä potilaalla kymmenestä) olivat pyreksia (kuume) ja paikalliset reaktiot pistoskohdassa (punoitus, kipu, turvotus).