Nebyly pozorovány klinicky významné interakce mezi nelfinavirem a nukleosidovými analogy (zvl. zidovudinem plus lamivudinem, stavudinem a stavudinem plus didanosinem).
Kliinisesti merkittäviä yhteisvaikutuksia ei ole havaittu nelfinaviirin ja nukleosidijohdosten välillä (erityisesti tsidovudiini yhdistettynä lamivudiiniin, stavudiini yksinään ja stavudiini yhdistettynä didanosiiniin).