Agomelatin působí dvěma způsoby, stimuluje receptory MT1 a MT2, které jsou normálně aktivovány melatoninem, a také blokuje receptory 5- HT 2C, které jsou za běžných okolností aktivovány neurotransmiterem 5 - hydroxytryptaminem (nazývaným také serotonin).
Niitä aktivoi normaalisti hermovälittäjäaine 5- hydroksitryptamiini (tunnetaan myös serotoniinina).