Princip mechanismu účinku klomipraminu je potenciace účinků 5 - HT a noradrenalinu v mozku inhibicí jejich neuronové re- adsorpce.
Clomicalmin pääasiallinen vaikutusmekanismi on noradrenaliinin ja 5- HT: n vaikutusten voimistaminen aivoissa, koska se estää niiden takaisinoton hermopäätteisiin.