Sitagliptin se chemickou strukturou a farmakologickým účinkem liší od analogů GLP- 1, inzulinu, sulfonylmočovin nebo meglitinidů, biguanidů, agonistů gama receptorů aktivovaných proliferátory peroxizómů (PPARγ), inhibitorů alfa- glukosidázy a analogů amylinu.
Sitagliptiinilla on erilainen kemiallinen rakenne ja farmakologinen vaikutus kuin GLP- 1- analogeilla, insuliinilla, sulfonyyliureoilla tai meglitinideillä, biguanideilla, PPARγ - (peroxisome proliferator - activated gamma) agonisteilla, alfa- glukosidaasin estäjillä ja amyliinianalogeilla.