Předběžné údaje ukazují, že je možné, aby se mezi raltegravirem a jinými inhibitory proteázy objevily přinejmenším některé stupně zkřížené rezistence.
Alustavat tiedot viittaavat siihen, että raltegraviirin ja muiden integraasinestäjien välillä saattaa esiintyä ainakin jonkinasteista ristiresistenssiä.