Mezi nejběžnější vedlejší účinky spojené s užíváním přípravku Cubicin (zaznamenané u více než 1 pacienta z 10) patří fungální infekce (plísňové a kvasinkové), bolest hlavy, nauzea (pocit nevolnosti), zvracení, průjem, vyrážka, reakce v místě zavedení infuze, abnormální jaterní testy a zvýšení hladiny enzymu CPK v krvi (ukazatel poškození svalů).
Cubiciniin yleisemmät sivuvaikutukset (useammalla kuin yhdellä potilaalla 10: stä) ovat sieni- infektiot (home - ja hiivainfektiot), päänsärky, pahoinvointi, oksentelu, ripuli, ihottuma, pistoskohdan reaktiot, epänormaalit maksa- arvot ja veren kohonneet CPK- entsyymitasot (lihasvaurion merkkiaine).