Stejně jako v případě všech ostatních nenukleosidových inhibitorů reverzní transkriptázy (NNRTI) dochází rychle ke vzniku rezistence viru, pokud se efavirenz podává jako monoterapie.
80 Nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors, NNRTIs) käytettäessä resistenttejä viruskantoja ilmaantuu nopeasti, kun efavirentsia käytetään monoterapiana.