V průběhu studií se většina běžných vedlejších účinků (více než 1 pacient z 10) objevila během nebo těsně po infuzi a jednalo se o návaly horka, kopřivku, pyrexii (horečku) a vyrážku.
Durante el desarrollo de los estudios los efectos adversos más frecuentes con Myozyme (observados en más de 1 paciente de cada 10) fueron taquicardia (aumento del ritmo cardiaco), rubor (enrojecimiento), tos, taquipnea (aumento del ritmo respiratorio), vómitos, urticaria, erupción cutánea, fiebre y una menor saturación del oxígneo (niveles bajos de oxígeno en sangre).