Nejčastějšími nežádoucími účinky, uváděnými ve vyšším výskytu u pacientů léčených režimem s aprepitantem než standardní terapií u pacientů léčených vysoce emetogenní chemoterapií byly: škytavka (4, 6% oproti 2, 9%), asténie/ únava (2, 9%, oproti 1, 6%), zvýšení ALT (2, 8%, oproti 1, 5%), zácpa (2, 2%, oproti 2, 0%), bolesti hlavy (2, 2%, oproti 1, 8%) a anorexie (2, 0%, oproti 0, 5%).
Las reacciones adversas más frecuentes que se comunicaron con una mayor incidencia en pacientes tratados con el régimen de aprepitant que con el tratamiento estándar en pacientes que estaban recibiendo quimioterapia altamente emetógena fueron: hipo (4,6% versus 2,9%), astenia/ cansancio (2,9% versus 1,6%), aumento de alanina aminotransferasa (ALT) (2,8% versus 1,5%), estreñimiento (2,2% versus 2,0%), cefaleas (2,2% versus 1,8%) y anorexia (2,0% versus 0,5%).