Nežádoucí účinky léčiva, které se objevily častěji ve skupině dostávající bosentan než ve skupině dostávající placebo (≥ 3% pacientů léčených bosentanem, s ≥ 2% rozdílem) byly bolest hlavy (15, 8% vs 12, 8%), návaly (6, 6% vs 1, 7%), zhoršená funkce jater (5, 9% vs 2, 1%), otok nohou (4, 7% vs 1, 4%) a anémie (3, 4% vs 1, 0%), přičemž všechny z nich byly závislé na dávce.
Las reacciones adversas que aparecieron con mayor frecuencia en los pacientes a los que se administró bosentan (≥ 3% en los pacientes tratados con bosentan, con una diferencia de ≥ 2%) que en los que recibieron placebo fueron cefalea(15,8% vs 12,8%), rubor facial (6,6% vs 1,7%), trastornos de la función hepática (5,9% vs 2,1%), edema de extremidades inferiores (4,7% vs 1,4%) y anemia (3,4% vs 1,0%), y todas ellas fueron dosis-dependientes.