Mezi nejběžnější vedlejší účinky přípravku Pegasys (zaznamenané u více než 1 pacienta z 10) patří anorexie (ztráta chuti k jídlu), bolesti hlavy, insomnie (potíže se spánkem), podrážděnost, deprese, závratě, nauzea (pocit nevolnosti), průjem, bolesti břicha, alopecie (vypadávání vlasů), pruritus (svědění), myalgie (bolest svalů), artralgie (bolest kloubů), únava, pyrexie (horečka), zimnice (mrazení s třesem), reakce v místě aplikace injekce a bolesti.
Los efectos secundarios más frecuentes de Pegasys (observados en más de 1 paciente de cada 10) son: anorexia (pérdida de apetito), dolor de cabeza, insomnio, irritabilidad, depresión, mareo, náuseas, diarrea, dolor abdominal (de tripa), alopecia (caída del cabello), prurito (picor), mialgia (dolor muscular), artralgia (dolor articular), fatiga, pirexia (fiebre), escalofríos, reacciones en el punto de inyección y dolor.