K nežádoucím účinkům, které vedly nejčastěji k ukončení léčby entakaponem během klinických studií, patřily gastrointestinální symptomy (např. průjem, 2, 5%) a zvýšení dopaminergních nežádoucích účinků levodopy (např. dyskineze, 1, 7%).
En ensayos clínicos las reacciones adversas más comunes que provocaron la interrupción del tratamiento con entacapona fueron los síntomas gastrointestinales (p. ej. diarrea 2,5%) y un aumento de las reacciones adversas dopaminérgicas de levodopa (p. ej. discinesias 1,7%).