V rámci klinických studií byly nejběžnějšími vedlejšími účinky spojenými s užíváním přípravku Nexavar (zaznamenanými u více než 1 pacienta z 10) lymfopenie (nízká hladina lymphocytů, typu bílých krvinek), hypofosfatemie (nízká hladina fosfátů v krvi), hemoragie (krvácení), hypertenze (vysoký krevní tlak), průjem, nauzea (pocit nevolnosti), zvracení, vyrážka, alopecie (vypadávání vlasů), palmoplantární syndrom (vyrážka a bolest dlaní a chodidel), erytém (zarudnutí), pruritus (svědění), únava, bolest a zvýšená hladina amylázy a lipázy (enzymy produkované slinivkou břišní).
En los estudios clínicos, los efectos secundarios más frecuentes (observados en más de 1 de cada 10 pacientes) fueron linfopenia (bajo nivel de linfocitos, un tipo de leucocitos), hipofosfotemia (bajo nivel de fosfato en sangre), hemorragia (sangrado), hipertensión (elevada presión arterial), diarrea, náuseas (sensación de malestar), vómitos, exantema, alopecia (pérdida de cabello), el "síndrome de mano-pie" (exantema y dolor en palmas y plantas), eritema (enrojecimiento), prurito (picor), fatiga (cansancio), dolor y aumento de amilasas y lipasas (enzimas producidas por el páncreas).