Nelfinavir se reverzibilně váže na aktivní místo HIV proteázy a zabraňuje štěpení polyproteinových řetězců, což vede k formování nezralých a tedy neinfekčních virových částic.
Nelfinavir se une reversiblemente al centro activo de la proteasa del VIH e impide el corte de las poliproteínas, dando lugar a la formación de partículas virales inmaduras no infecciosas.