Emtricitabin je fosforylován buněčnými enzymy a vzniká emtricitabin 5 '- trifosfát, který kompetitivně inhibuje reverzní transkriptázu HIV- 1, což vede k ukončení DNA řetězce.
Emtricitabina se fosforila por medio de enzimas celulares a la forma 5'-trifosfato de emtricitabina, que es un inhibidor competitivo de la transcriptasa inversa del VIH-1, produciendo una interrupción de la cadena de ADN.