V rámci studií byly nejběžnějšími vedlejšími účinky přípravku Gardasil (zaznamenanými u více než 1 pacientky z 10) pyrexie (horečka) a reakce v místě vpichu (zarudnutí, bolest a otok).
En los estudios, los efectos secundarios más frecuentes (observados en más de 1 paciente de cada 10) son pirexia (fiebre) y reacciones en el sitio de inyección (enrojecimiento, dolor, hinchazón).