V moči, v játrech, v tuku a v ledvinách lze, mimo hlavní (základní) složku, nalézt v malém množství rovněž metabolity desmethyldifloxacin a difloxacin N- oxid.
Además del compuesto parental, en orina, hígado, grasa y riñones, se encuentran cantidades pequeñas de los metabolitos desmetildifloxacina y N-óxido de difloxacina.