Освен това, проучванията in vitro показват, че саквинавир е субстрат и инхибитор на Р- glycoprotein (P- gp).
Dodatno so in vitro študije pokazale, da je sakvinavir substrat in zaviralec P - glikoproteina (P- gp), zato lahko zdravila, ki ali delijo to presnovno pot ali spreminjajo aktivnost CYP3A4 in/ ali P- gp (glejte “ Druge možne interakcije ”), spremenijo farmakokinetiko sakvinavirja.