Както при други лекарства против ХИВ, пациентите, приемащи Ziagen, са застрашени от развитие на липодистрофия (промени в разпределението на мазнините в тялото), остеонекроза (умиране на костна тъкан) или синдром на имунна реактивация (симптоми на инфекция, причинени от възстановяващата се имунна система).
Tako kot drugi zaviralci nukleozidne reverzne transkriptaze lahko tudi zdravilo Ziagen povzroči laktacidozo (kopičenje mlečne kisline v telesu), pri dojenčkih mater, ki so med nosečnostjo jemale zdravilo