102 индинавир и ритонавир; обаче кръстосаната резистентност към саквинавир се променя при отделните изолати.
Veliko proteaznih aminokislinskih substitucij, o katerih so poročali, da so povezane z rezistenco na ritonavir in sakvinavir, je bilo povezanih tudi z rezistenco na indinavir.