НІV изолати, получени от 5 пациенти по време на терапия с нелфинавир, са имали 5 до 93 пъти намаление на чувствителността към нелфинавир in vitro в сравнение с подбрани изходни изолати, но не са показали съответстващо намаление на чувствителността към индинавир, ритонавир, саквинавир или aмпренавир in vitro.
Navzkrižna odpornost: pri izolatih HIV, ki so jih pridobili od 5 bolnikov med zdravljenjem z nelfinavirjem, so odkrili 5 - do 93- krat manjšo občutljivost za nelfinavir v in vitro v primerjavi z izolati ob začetku zdravljenja, niso pa odkrili skladnega zmanjšanja občutljivosti za indinavir, ritonavir, sakvinavir ali amprenavir in vitro.