Биотрансформацията на емтрицитабин включва оксидиране на тиоловата група до образуване на 3 '- сулфоксид диастереомери (приблизително 9% от дозата) и конюгация с глюкоронова киселина дообразуване на 2' - O- глюкоронид (приблизително 4% от дозата).
Biotransformacija emtricitabina vključuje oksidacijo tiolne skupine, pri čemer nastanejo diastereomeri 3 '- sulfoksida (približno 9% odmerka), in konjugacijo z glukuronsko kislino, pri čemer nastane 2' - O- glukuronid (približno 4% odmerka).