Проведени са няколко клинични изпитвания с пациенти, инфектирани с НIV- 1, при които е оценяван ефекта на нелфинавир (самостоятелно или в комбинация с други антиретровирусни средства) върху биологичните маркери за активност на болестта - брой CD4 клетки и вирусна РНК.
Učinke nelfinavirja (samega ali kombiniranega z drugimi protiretrovirusnimi učinkovinami) na biološke označevalce aktivnosti bolezni, število celic CD4 in virusno RNA, so proučevali v številnih študijah, ki so vključevale bolnike, okužene s HIV- 1.