Зонизамид се свързва 40 - 50% с човешките плазмени белтъци, като in vivo проучванията показват, че това не се повлиява от наличието на различни антиепилептични лекарствени продукти (т. е. фенитоин, фенобарбитал, карбамазепин и натриев валпроат).
In vitro študije so pokazale, da prisotnost drugih antiepileptičnih zdravil (kot npr. fenitoin, fenobarbiton, karbamazepin in natrijev valproat) ne vpliva na vezavo na proteine.