Най- често съобщаваните нежелани реакции при лечение с азацитидин са хематологични реакции (71, 4%), включващи тромбоцитопения, неутропения и левкопения (обикновено 3- та−4- та степен), стомашно- чревни нарушения (60, 6%), включващи гадене, повръщане (обикновено 1- ва−2- ра степен) или реакции на мястото на инжектиране (77, 1%; обикновено 1- ва−2- ра степен).
Neželeni učinki, o katerih so najpogosteje poročali v zvezi z zdravljenjem z azacitidinom, so bile hematološke reakcije (71, 4%), vključno s trombocitopenijo, nevtropenijo in levkopenijo (običajno 3. - 4. stopnje), prebavni dogodki (60, 6%), vključno z navzejo, bruhanjem (običajno 1. - 2. stopnje), ali reakcije na mestu injiciranja (77, 1%; običajno 1. - 2. stopnje).