При изпитвания спрямо еноксапарин 40 mg веднъж дневно, приложен 12 часа преди операцията, сериозно кървене е наблюдавано при 2, 8% от пациентите на лечение с препоръчваната доза фондапаринукс, в сравнение с 2, 6% при пациентите на лечение с еноксапарин.
V preskušanjih fondaparinuksa v primerjavi s 40 mg enoksaparina enkrat na dan s pričetkom 12 ur pred operacijo so opazili v skupini bolnikov, ki je prejemala fondaparinuks v priporočenem odmerku, 2, 8% velikih krvavitev v primerjavi z 2, 6% v skupini bolnikov z enoksaparinom.