При случаите на вирусологичен неуспех не са открити мутации, свързани с резистентност към протеазни инхибитори (PI).
Pri enem bolniku z rezistenco v skupini PREZISTA/ ritonavir so ugotovili razvoj enega NNRTI RAMa na mestu 184, ki so ga povezali z zmanjšano občutljivostjo za emtricitabin, ki je bil vključen v osnovno shemo zdravljenja.