Като допълнение, инданавир с ритонавир не трябва да се прилагат заедно с алфузозин, меперидин, пироксикам, пропоксифен, бепридил, енкаинид, флеканид, пропафенон, хинидин, фузидова киселина, клозапин, клоразепат, диазепам, естазолам и флуразепам.
Poleg tega se indinavir v kombinaciji z ritonavirjem ne sme dajati skupaj z alfuzosinom, meperidinom, piroksikamom, propoksifenom, bepridilom, enkainidom, flekanidom, propafenonom, kinidinom, fusidno kislino, klozapinom, klorazepatom, diazepamom, estazolamom in flurazepamom.