На клетъчно ниво последствието от инхибирането на топоизомераза- I от топотекан е индукцията на протеин- свързани ДНК едноверижни разкъсвания.
Celična posledica zaviranja topoizomeraze I je razpad posameznih verig DNA, na katere se veže encim, na dele.