В едно сравнително проучване, комбинираната терапия с нуклеозидни аналози (тройна терапия със зидовудин плюс диданозин) създава защита срещу селекцията на вирусна експресия на най- малко едно свързано с резистентността амино- киселинно заместване при индинавир (от 13/ 24 до 2/ 20 през 24 седмица на терапията) и при нуклеозидни аналози (от 10/ 16 до 0/ 20 през 24 седмица на терапията).
V primerjalni raziskavi je kombinirano zdravljenje z nukleozidnimi analogi (trojno zdravljenje z zidovudinom in didanozinom) potrdilo zaščito pred selekcijo virusa, ki ima izraženo vsaj eno aminokislinsko substitucijo, povezano z rezistenco na indinavir (od 13/ 24 do 2/ 20 v 24. tednu zdravljenja) in na nukleozidne analoge (od 10/ 16 do 0/ 20 v 24. tednu zdravljenja).