Ограничение на показанието „ Инфекции на долните дихателни пътища “ CHMP отбелязва, че ciprofloxacin не е подходящ за лечение на пневмококи и неговата ефикасност срещу хламидия е по- лоша в сравнение с други флуорохинолони, например левофлоксацин или моксифлоксацин.
Odbor za zdravila za uporabo v humani medicini je navedel, da ciprofloksacin ni primeren za terapijo pnevmokokov ter da je njegova učinkovitost pri klamidiji slabša v primerjavi z drugimi fluorokinoloni, kot sta na primer levofloksacin ali moksifloksacin.