При локалните инхибитори на карбоанхидразата могат да се наблюдават същите нежелани реакции, които се свързват с пероралните инхибитори на карбоанхидразата.
Enaki neželeni učinki, kot jih pripisujemo peroralnim zaviralcem karboanhidraze, pa se lahko pojavijo tudi pri topikalni uporabi zdravila.