Основният метаболит на зидовудин в плазмата и урината е 5`- глюкуронидът, представляващ около 50 - 80% от приложената доза, като той се елиминира чрез бъбречна екскреция.
Zidovudin 5 '- glukuronid je glavni presnovek zidovudina v plazmi in v urinu, nanj odpade približno 50 – 80% apliciranega odmerka, ki se izloči preko ledvic.