Малко вероятно е да се развие кръстосана резистентност между ампренавир и инхибиторите на обратната транскриптаза, защото прицелните места за действие на ензимите са различни.
Malo je verjetno, da bi se med amprenavirjem in zaviralci reverzne transkriptaze pojavila navzkrižna rezistenca, saj so njihovi tarčni encimi različni.