Емтрицитабин се екскретира основно през бъбреците, с пълно възстановяване на дозата в урината (приблизително 86%) и фекалиите (приблизително 14%).
Emtricitabin se primarno izloča skozi ledvica – celoten odmerek se izloči z urinom (približno 86%) in blatom (približno 14%).