In vitro, множество изоформи на цитохром P- 450, включващи CYP3A, CYP2C19/ C9 и CYP2D6, участват в метаболизма на нелфинавир.
Nelfinavir se in vitro presnavlja z več izoencimi citokroma P- 450, vključno s CYP3A, CYP2C19/ C9 in CYP2D6. V plazmi so našli enega glavnega in več manj pomembnih oksidiranih presnovkov.