Както всички ваксини, ако RotaTeq се използва при много недоносени деца, съществува риск от апнея (кратки прекъсвания на дишането).
Tako kot pri vseh cepivih, obstaja tudi pri cepivu RotaTeq tveganje za razvoj apneje (kratki premori med dihanjem), če se daje prezgodaj rojenim otrokom.