От изолатите с повишени МИК, изолирани от пациенти, лекувани с други ехинокандини, само за два изолата на Candida се съобщава за повишени МИК и към анидулафунгин, което предполага, че няма пълна кръстосана резистентност между ехинокандините.
Med številnimi izolati z zvišanimi MIK za ehinokandin, izoliranimi pri bolnikih, zdravljenih z drugimi ehinokandini, sta imela le dva izolata Candide zvišane tudi MIK za anidulafungin, kar kaže, da navzkrižna odpornost med ehinokandini ni popolna.