При почти всички антибактериални средства, включително и при ертапенем, са наблюдавани свързани с антибиотика колит и псевдомембранозен колит, като тяхната тежест може да варира от леки до животозастрашаващи.
Pri skoraj vseh antibiotikih, vključno z ertapenemom, so poročali o z antibiotikom povezanim kolitisu in psevdomembranskem kolitisu, ki je lahko blag do življenjsko ogrožajoč.