По време на клиничните изпитвания с 48 седмици на лечение и 24 седмици период на проследяване профилът на безопасност на Pegasys при пациенти с хроничен хепатит В е бил подобен на този, наблюдаван при пациенти с хроничен хепатит С.
V kliničnih preskušanjih zdravljenja, ki je trajalo 48 tednov in v obdobju sledenja bolnikov, ki je trajalo 24 tednov, je bil varnostni profil zdravila Pegasys pri bolnikih s kroničnim hepatitisom B podoben kot pri kroničnem hepatitisu C.