При клинични проучвания при пациенти, лекувани с пеметрексед, нечесто са докладвани случаи на интерстициален пневмонит с дихателна недостатъчност, понякога фатален.
V kliničnih preskušanjih so pri bolnikih, ki so jih zdravili s pemetreksedom, občasno poročali o primerih intersticijske pljučnice z respiratorno insuficienco, ki so bili včasih usodni.