Индинавир, самостоятелно или в комбинация с нуклеозидни аналози (зидовудин/ ставудин и ламивудин), е показал забавяне на скоростта на клинична прогресия в сравнение с нуклеозидните аналози и има продължителен ефект върху вирусното натоварване и броя на CD4- клетките.
Pokazalo se je, da indinavir sam ali v kombinaciji z nukleozidnimi analogi (zidovudin/ stavudin in lamivudin) v primerjavi z nukleozidnimi analogi povzroči zakasnitev stopnje kliničnega napredovanja bolezni ter zagotovi trajni učinek na virusno obremenitev in število CD4.