Емтрицитабин се екскретира основно от бъбреците като цялата приложена доза се открива в урината (приблизително 86%) и фекалиите (приблизително 14%).
Emtricitabin se primarno izloča preko ledvic – celoten odmerek se izolira iz urina (približno 86%) in iz blata (približno 14%).