Тя поддържа тесни връзки с Европейската комисия, 27- те държави- членки на ЕС, страните- членки на ЕИЗ - ЕССТ и много други групи от държавния и частния сектор.
Evropska agencija za zdravila (EMEA), ki je bila ustanovljena januarja 1995, tesno sodeluje z Evropsko komisijo, 27 državami članicami EU, državami EGP/ EFTA in številnimi drugimi skupinami v vladnem in zasebnem sektorju.