Протеиновата част на молекулата заема около 58% от общата молекулна маса и се състои от 165 амино киселини.
Epoetin zeta je, kar se zaporedja amino kislin in sestave ogljikovodikov tiče, identičen endogenemu humanemu eritropoetinu, ki so ga izolirali iz seča slabokrvnih bolnikov.