Първо, клофарабин трябва да дифузира или да бъде транспортиран до таргетните клетки, където е подложен на последователно фосфорилиране до моно - и бифосфат от вътреклетъчните кинази и накрая до активния конюгат - клофарабин 5 ’ - трифосфат.
Klofarabin mora najprej difundirati, da bi se lahko transportiral v ciljne celice, kjer ga znotrajcelične kinaze zaporedno fosforilirajo v mono - in difosfate, in na koncu v aktivni konjugat, klofarabin 5 ’ - trifosfat.