Развитие на резистентност към ципрофлоксацин и други флуорохинолони е наблюдавана при стафилококи, по- специално метицилин- резистентен S. aureus, P. aeruginosa, E. coli и E. faecalis (виж таблицата на чувствителните видове).
Pojav odpornosti proti ciprofloksacinu in drugim fluorokinolonom so zabeležili pri stafilokokih, zlasti za meticilin odporne S. aureus, P. aeruginosa, E. coli in E. faecalis (glejte desni stolpec v tabeli občutljivosti).