Eliminationen foregår renalt ved udskillelse af metabolitter, heraf 89% som sulfat - og glukoronidkonjugater af 6- hydroxymelatonin og 2% som melatonin (uomdannet stof).
L' 89% viene eliminata sotto forma di coniugati glucoronidi e solfati di 6-idrossimelatonina ed il 2% come melatonina (sostanza immodificata).