Moxifloxacin gennemgår fase II- biotransformation og udskilles dels via renale og galde/ fækale udskillelsesveje som uforandret lægemiddel, dels i form af en sulfoforbindelse (M1) og et glukuronid (M2).
biliare/ fecale sia come farmaco immodificato che in forma di un solfo-composto (M1) e di un glucuronide (M2).