Cisaprid stimulerer ikke muscarine eller nicotine receptorer, ligesom det heller ikke hæmmer aktiviteten af acetylcholinesterase.
Si raccomanda di valutare e correggere i fattori che possono predisporre ad un allungamento dell' intervallo QT come turbe dell' equilibrio elettrolitico (soprattutto ipopotassiemia o ipomagnesiemia) e bradicardia.