Topotecan hæmmer topoisomerase- 1 ved at stabilisere det kovalente kompleks af enzym og strengkløvet DNA, som er et intermediært produkt af den katalytiske mekanisme.
Topotecan inibisce la topoisomerasi-I mediante la stabilizzazione del complesso covalente tra l’ enzima e il filamento interrotto di DNA, che costituisce un intermedio del processo catalitico.