Stavudin var også genotoksisk i musefibroblaster og i en in vivo test for kromosomale afvigelser.
Stavudina si è dimostrata genotossica in test in vitro su linfociti umani con attività fosforilante (in cui non era stato identificato il livello di non effetto), in fibroblasti di topo ed in un test in vivo per le aberrazioni cromosomiali.