Zonisamid metaboliseres primært af CYP3A4 via en reduktiv spaltning af benzisoxazolringen i moderstoffet, så der dannes 2- sulphamoylacetylphenol (SMAP) samt også ved N- acetylering.
La zonisamide è metabolizzata principalmente tramite scissione riduttiva dell’ anello benzisossazolico del farmaco progenitore da parte del CYP3A4 per formare 2-sulfamoilacetilfenolo (SMAP) e anche tramite N-acetilazione.