Ligesom med andre lægemidler mod hiv kan der ved brug af Ziagen være risiko for, at patienterne får lipodystrofi (forandringer i fordelingen af kropsfedt), knoglenekrose (knoglevævsdød) eller immunreaktiveringssyndrom (symptomer på infektion, der skyldes, at immunsystemet genvinder sin funktion).
Come per altri farmaci anti-HIV, i pazienti che ricevono Ziagen possono essere a rischio di lipodistrofia (alterazioni nella distribuzione del grasso corporeo), osteonecrosi (morte del tessuto osseo) o sindrome da riattivazione immunitaria (sintomi infiammatori causati dalla riattivazione del sistema immunitario).