Af disse er M- 1 (katekolform), M- 2 (metoxyform af M- 1) og M- 5 (hydroxylering ved sidekæde) set i den systemiske cirkulation af micafungin.
E’ stato dimostrato che micafungin viene metabolizzato in diversi composti; di questi, i metaboliti di micafungin M-1 (forma catecolica), M-2 (forma metossilica di M-1) e M-5 (idrossilazione di una catena laterale) sono stati identificati nella circolazione sistemica.