I kliniske studier har den mest almindelige bivirkning, der har ført til afbrydning af behandlingen med entakapon, været symptomer fra mave- tarmkanalen (f. eks. diarré 2, 5%) og øget dopaminerg bivirkning af levodopa (f. eks. dyskinesi 1, 7%).
Tra le reazioni avverse che hanno portato all’ interruzione del trattamento con entacapone sono stati segnalati principalmente i sintomi gastrointestinali (es. diarrea, 2,5%) e l’ aumento delle reazioni avverse dopaminergiche legate alla levodopa (es. discinesia, 1,7%).