Da sapropterindihydrochlorid er en syntetisk version af det naturligt forekommende 6R- BH4, må det rimeligvis kunne antages at metaboliseres på samme vis, inklusive 6R- BH4- regeneration.
Mivel a szapropterin- dihidroklorid a természetben előforduló 6R- BH4 szintetikus változata, okkal feltételezhető, hogy ugyanúgy metabolizálódik, beleértve a 6R- BH4 regenerációt is.