Kivexa kan ligesom alle andre NRTI' er også medføre ophobning af mælkesyre i kroppen, og nyfødte, hvis mødre har fået Kivexa under graviditeten, kan udvikle mitokondriel dysfunktion (beskadigelse af de energiproducerende cellebestanddele med blodproblemer til følge).
Mint minden más NRTI, a Kivexa is tejsavas acidózist (a tejsav felhalmozódása a szervezetben) okozhat, valamint a terhesség alatt Kivexát szedő anyák csecsemőiben a mitokondriumok rendellenes működését (a sejtek energia termelő komponensének károsodása, ami vérrel kapcsolatos rendellenességeket okozhat) válthatja ki.