Zonegran virker desuden på signalstoffet gammaami - nosmørsyre (GABA, et kemisk stof, der anvendes af nervecellerne i deres indbyrdes kommunikation).
A zoniszamid a hatását az idegsejtek felszínén található, nátrium és kálcium csatornáknak nevezett specifikus pórusok blokkolásával fejti ki.