Moxifloxacin gennemgår fase II- biotransformation og udskilles dels via renale og galde/ fækale udskillelsesveje som uforandret lægemiddel, dels i form af en sulfoforbindelse (M1) og et glukuronid (M2).
A moxifloxacin II. fázisú biológiai átalakuláson megy keresztül és a vizelettel, ill. az epe- faeces utat követve részben változatlan formában részben egy szulfo (Ml), ill. glukuronid (M2) metabolit formájában ürül.