Desuden bør indinavir kombineret med ritonavir ikke administreres sammen med alfuzosin, meperidin, piroxicam, propoxyfen, bepridil, encainid, flecanid, propafenon, quinidin, fusidinsyre, clozapin, clorazepat, diazepam, estazolam og flurazepam.
A ritonavirrel együttesen alkalmazott indinavir továbbá nem adható együtt alfuzozinnal, meperidinnel, piroxikámmal, propoxifennel, bepridillel, enkainiddel, flekainiddel, propafenonnal, kinidinnel, fuzidsavval, klozapinnel, klorazepáttal, diazepámmal, esztazolámmal és flurazepámmal.