En ceftriaxon behandling, kan midlertidigt øge risikoen for en infektion, som er forårsaget af andre sygdoms fremkaldene bakterier, som f. eks. svamp.
A ceftriaxon kezelést követően átmenetileg érzékennyé válhat más kórokozók által okozott fertőzésekre, előfordulhat például szájpenész.