De mest almindelige bivirkninger ved Avonex (der ses hos mere end 1 ud af 10 patienter) er hovedpine, influenzalignende symptomer, feber, kulderystelser og svedudbrud.
Az Avonex- szel kapcsolatban leggyakrabban (10 betegből egynél többször) tapasztalt mellékhatások: a fejfájás, influenzaszerű tünetek, pyrexia (láz), hidegrázás és izzadás.