Da der ikke er nogen data med hensyn til substitution af RotaTeq med anden rotavirus- vaccine, anbefales det, at spædbørn, som får RotaTeq ved den første vaccination mod rotavirus, får den samme vaccine til de efterfølgende doser.
Mivel a RotaTeq másik rotavírus vakcinával való kicserélhetőségére vonatkozóan nem állnak rendelkezésre adatok, azoknál a csecsemőknél, akik az első rotavírus elleni immunizáláskor RotaTeqet kaptak, ajánlatos ugyanezt a vakcinát alkalmazni a további dózisoknál is.