4% af dosen).
Az emtricitabin biotranszformációja során a tiol csoport oxidálódik és 3 '- szulfoxid diasztereomerekké alakul (a dózis körülbelül 9% - a), illetve glükuronsavval konjugálva 2' - O- glükuronid keletkezik (a dózis körülbelül 4% - a).