Endvidere besidder clofarabin større modstandsevne over for cellulær nedbrydning af adenosin - deaminase og mindre modtagelighed for phosphorolytisk spaltning end andre aktive stoffer i denne klasse, mens clofarabintriphosphats affinitet til DNA- polymerase α and ribonukleotidreduktase svarer til eller overstiger affiniteten til deoxyadenosintriphosphat.
Emellett a klofarabin nagyobb ellenállást mutat az adenozin- deamináz általi lebontással szemben, és kevésbé hajlamos a foszforolitikus hasadásra, mint az osztályába tartozó egyéb hatóanyagok, míg a klofarabin- trifoszfátnak a DNS- polimeráz- α- hoz és a ribonukleotid- reduktázhoz való affinitása hasonló, vagy nagyobb, mint a dezoxiadenozin- trifoszfáté.