Som et fluorquinolon- antibiotikum udøver Ciprofloxacin sin baktericide virkning ved at hæmme både type II topo- isomerase (DNA- gyrase) og top- isomerase IV, som er nødvendig for bakteriel DNA - replikation, transskription, genopretning og rekombination.
A ciprofloxacin baktericid hatása - lévén fluorokinolon típusú antibakteriális szer - a DNS replikációban, transzkripcióban, repairben és rekombinációban szerepet játszó topoizomeráz II (DNS - giráz) és a topoizomeráz IV gátlásán keresztül valósul meg.