Det bør overvejes at indstille behandlingen midlertidigt eller nedsætte dosis af filgrastim hos patienter, der får trombocytopeni, d. v. s. trombocyttal vedvarende < 100. 000/ mm3.
Thrombocytopenia kialakulása esetén, vagyis, ha a vérlemezkeszám tartósan 100 000/ mm3 alatti, megfontolandó a kezelés átmeneti felfüggesztése vagy a filgrasztim dózisának csökkentése.