Rotteundersøgelser indikerer at optagelsen i hjernevæv er begrænset, distributionen ind og ud af det lymfatiske system er hurtig og ekskretionen i mælk fra diegivende rotter er ekstensiv.
Patkányokon végzett vizsgálatok szerint az indinavir agyszövetbe való felvétele korlátozott, a nyirokrendszerbe történő eloszlása és abból való kiürülése gyors, a szoptató patkányok tejével való ürülése pedig nagymértékű volt.