De mest almindelige bivirkninger ved Isentress (set hos mellem 1 og 10 patienter ud af 100) er søvnløshed, svimmelhed, hovedpine, absominal distension (oppustethed), mavesmerter, konstipation, diarré, flatulens (luft i maven), kvalme, opkastninger, hyperhidrose (forøget svedafsondring), natlige hedeture, kløe, udslæt, ledsmerter, kraftesløshed, træthed og øget antal leverenzymer i blodet (alanin aminotransferase og aspartat aminotransferase), triglycerider (en form for fedt), creatinin kinase (et enzym, som findes i muskler) og lipase (et enzym, som findes i pancreas).
Az Isentress alkalmazása során előforduló leggyakoribb mellékhatások (100 beteg közül 1- 10- nél fordult elő) az insomnia (alvászavar), a szédülés, fejfájás, hasi puffadás (felfújódás), hasfájás, székrekedés, hasmenés, haspuffadás (gázképződés), émelygés (hányinger), hányás, túlzott izzadás, éjszakai izzadás, viszketés, kiütés, izületi fájdalom, fáradtság, gyengeség, valamint a vérben magas májenzim- szint (alanin- aminotranszferáz és aszpartát- aminotranszferáz), triglicerid- szint (egyfajta zsírsav), kreatinin- kináz- szint (az izmokban található egyik enzim) és lipáz- szint (a hasnyálmirigyben található egyik enzim).