Den intracellulære metabolisme af gemcitabin danner gemcitabin mono -, di - og trifosfater (dFdCMP, dFdCDP og dFdCTP), hvoraf dFdCDP og dFdCTP anses for aktive.
A gemcitabin intracelluláris metabolizmusa gemcitabin mono -, di - és trifoszfátokat eredményez (dFdCMP, dFdCDP és dFdCTP), melyek közül a dFdCDP és dFdCTP tekinthető aktívnak.