Udvikling af resistens mod ciprofloxacin og andre fluorquinoloner er blevet observeret ved staphylokokker, især methicillin - resistent S. aureus, P. aeruginosa, E. coli og E. faecalis (se følsomhedstabellen).
Staphylococcusoknál, különösen a meticillin- rezisztens S. aureus, P. aeruginosa, E. coli és E. faecalis esetén ciprofloxacin - és egyéb fluorokinolon- rezisztencia kialakulását, észlelték (lásd érzékenységi táblázat).