Ikke desto mindre er der en potentiel risiko for at vælge HIV- stammer, som er resistente over for adefovir med mulig krydsresistens over for andre antivirale lægemidler.
Ennek ellenére fennáll a veszély, hogy adefovirral szemben rezisztens HIV- törzsek szelektálódnak, más antivirális gyógyszerrel szembeni lehetséges keresztrezisztenciával.