Som et resultat af denne handlingsmekanisme udviser ciprofloxacin ikke krydsresistens med andre vigtige, kemisk forskellige grupper af stoffer, som f. eks. beta- laktam antibiotika, aminoglycosider, tetracycliner, makrolider og polypeptider, sulfonamider, trimethoprim og nitrofurantoin.
Hatásmechanizmusának köszönhetően, a ciprofloxacin nem mutat keresztrezisztenciát egyéb fontos, kémiailag különböző vegyületcsoportokkal, például a béta- laktám antibiotikumokkal, aminoglikozidokkal, tetraciklinekkel, makrolidekkel és polipeptidekkel, szulfonamidokkal, trimetoprimmel és nitrofurantoinnal.