Saquinavirs metabolisme medieres af cytokrom P450, med det specifikke isoenzym, CYP3A4, som ansvarlig for 90% af den hepatiske metabolisme.
A szakinavirt a citokróm P450, ami egy specifikus izoenzim, a CYP 3A4 segítségével metabolizálja, mely a májmetabolizmus 90% - ért felelős.