Cidofovirs forlængede antivirale effekt er relateret til metabolitternes halveringstid; cidofovirdiphosphat bliver i cellerne med en halveringstid på 17- 65 timer.
A cidofovir elhúzódó vírusellenes hatása metabolitjai felezési idejével függ össze; a cidofovir- difoszfát felezési ideje a sejtekben 17- 65 óra és a cidofovir- foszfát- kolin származék felezési ideje 87 óra.