Følgende uønskede hændelser, der i det mindste har en mulig sammenhæng med nelfinavir (dvs. bivirkninger) og som rapporteredes hyppigst var: diaré, kvalme og udslæt.
A leggyakrabban jelentett nemkívánatos hatások, melyeknek a nelfinavir alkalmazásával való összefüggése legalábbis lehetséges (vagyis mellékhatások) a következők: hasmenés, hányinger és bőrkiütés.