Den baktericide effekt af moxifloxacin fremkommer ved hæmning afbegge type II - topoisomeraser (DNA- gyrase og topoisomerase IV), som er nødvendig for bakteriel DNA - replikation, - transskription og - reparation.
A moxifloxacin baktericid hatása abból ered, hogy gátolja mindkét II. típusú topoizomerázt (DNS giráz és topoizomeráz IV), melyek a bakteriális DNS replikációhoz, a transzkripcióhoz és a repair mechanizmushoz szükségesek.