Som for andre stoffer, der virker på renin- angiotensin- systemet skal der udvises forsigtighed, når aliskiren gives til patienter, der er prædisponerede for renal dysfunktion, som hypovolæmi (f. eks. pga. blodtab, alvorlig og vedvarende diarré, vedvarende opkastning), hjertelidelse, leverlidelse eller nyrelidelse.
A renin- angiotenzin rendszerre ható egyéb gyógyszerekhez hasonlóan, az aliszkiren alkalmazásakor is óvatosságra van szükség olyan betegek kezelésekor, akik veseműködési zavar kialakulására hajlamosító betegségben, például hipovolémiában (pl. vérveszteség, súlyos vagy elhúzódó hasmenés, elhúzódó hányás, stb. miatt), szívbetegségben, májbetegségben vagy vesebetegségben szenvednek.