Hvis der er mistanke om infektion som et resultat af et positivt IgM- respons, er der brug for ekstra analyser for at kunne afgøre, om dyret var inficeret eller vaccineret.
Mivel azonban az IgM válasz a vakcinázást követően ritka, egy pozitív IgM ELISA teszt eredmény erős indikátora lehet a Nyugat- Nílusi vírussal történt természetes fertőződésnek. Ha a pozitív IgM válasz következtében a fertőződés gyanítható, kiegészítő vizsgálat vezethet annak végső eldöntéséhez, hogy az állat fertőzött vagy vakcinázott.