In vitro- resistens over for ciprofloxacin kan erhverves gennem en trinvis proces af mutationer på målstedet af både topoisomerase II, DNA gyrase og topoisomerase IV.
A ciprofloxacinnal szembeni lépésenként kialakuló in vitro rezisztenciát okozhatják a DNS- giráz és a topoizomeráz IV enzimen lévő támadáspontok mutációi.