Ligesom andre antidepressiva, herunder andre SSRI' er, hæmmer paroxetin det cytokrome P450 - leverenzym CYP2D6.
Paroxetin CYP2D6 gátló hatása Mint a többi antidepresszáns - beleértve az egyéb szelektiv szerotonin reuptake – inhibitorokat is - a paroxetin gátolja a máj citochrom P- 450 (CYP 2D6) izoenzimet.