Topotecan er dog som andre cytostatika genotoksisk, og påvirkning af fertiliteten, inkl. den mandlige fertilitet, kan ikke udelukkes.
Mindazonáltal, más citosztatikus gyógyszerekhez hasonlóan a topotekán genotoxikus, így nem zárható ki, hogy hatással van a fertilitásra, akár a férfiakéra is.