Miglustat elimineres overvejende ved renal udskillelse, med genfinding i urin af uomdannet lægemiddel på 70- 80% af dosis.
A miglustat főleg a vesén keresztül választódik ki, a változatlan gyógyszer a dózis 70- 80% - át teszi ki a vizeletben való újra kiválasztódáskor.