De hyppigste bivirkninger af Pandemrix (forekom ved 1 af 10 eller flere doser af vaccinen) er hovedpine, ledsmerter, muskelsmerter, reaktioner på indstiksstedet (hårdhed, hævelse, smerte og rødme), feber og træthed.
A Pandemrix alkalmazása során leggyakrabban (a vakcina 10 vagy több dózisából egy esetében) előforduló mellékhatások a fejfájás, arthralgia (ízületi fájdalom), myalgia (izomfájdalom), reakciók az injekció beadásának helyén (kemény csomó, duzzanat, fájdalom és bőrpír), a láz és a fáradság.