Potentialet for krydsresistens mellem efavirenz og NRTIre er lille på grund af de forskellige bindingssteder på målet og virkningsmekanismen.
De même, la possibilité de résistance croisée entre l'éfavirenz et les INTI est faible en raison des différents sites de liaison utilisés sur la cible et des différents mécanismes d’ action.