Der blev vedtaget to tillægs - og ændringsbudgetter i 2000, det første på mødet i oktober og det andet i december, hovedsagelig for at tage hensyn til oprettelsen af en særlig reserve til finansiering af agenturets aktiviteter vedrørende lægemidler til sjældne sygdomme, videreførelsen af Det Paneuropæiske Kontrolforum for Lægemidler (PERF) og antallet af gebyrrelaterede aktiviteter, der var højere end forventet.
Deux budgets rectificatifs et supplémentaires ont été nécessaires en 2000, le premier adopté lors de la réunion d’octobre et le second en décembre, pour tenir compte, en particulier, de la création d’une réserve spéciale pour les activités liées aux médicaments orphelins, de la poursuite du forum réglementaire paneuropéen sur les produits pharmaceutiques (PERF) et d’un niveau d’activités génératrices de redevances supérieur aux prévisions.