Der venter store udfordringer forude, som EMEA er parat til at takle, nemlig udvidelsen af EU, gennemførelsen af 2001- revisionen, stigende antal kliniske undersøgelser, lægemiddelovervågning og inspektionstjenester, ansvar for Fællesskabets administrationssystemer for lægemiddelinformation, udvidelse af gennemsigtighedsprocessen til at omfatte samtlige aspekter, forbedring af agenturets evne til at håndhæve lovgivningen samt opfyldelse af dets internationale rolle.
Les défis majeurs de l'avenir, que l'EMEA est déterminée à relever, incluent l'élargissement de la Communauté, la mise en œ uvre de la révision 2001, l'intensification des essais cliniques, la pharmacovigilance et les inspections, la responsabilité des systèmes communautaires de gestion des informations pharmaceutiques, une transparence accrue dans tous les aspects de sa fonction, le renforcement de sa faculté d'appliquer la réglementation et l'exécution de son rôle international.