Efter oral inhalation omdannes ciclesonid enzymatisk i lungerne til hovedmetabolitten (C21- des- methylpropionyl- ciclesonid), som har en markant antiinflammatorisk aktivitet og således anses for at være den aktive metabolit.
Son principal métabolite, le C21-déméthylpropionyl-ciclésonide, exerçant un effet anti-inflammatoire important est considéré comme le métabolite actif.