Emtricitabin fosforyleres af celleenzymer til at danne emtricitabin 5 '- trifosfat, som kompetitivt hæmmer HIV- 1 reverse transkriptase, som resulterer i DNA- kædeterminering.
L’ emtricitabine 5’ -triphosphate inhibe de façon compétitive la transcriptase inverse du VIH-1, aboutissant à l’ arrêt de l’ élongation de la chaîne d’ ADN.