Mange af de protease- aminosyresubstitutioner, som er fundet at være associeret med resistens over for ritonavir og saquinavir, er også forbundet med resistens over for indinavir.
La plupart des substitutions d’ acide aminé de la protéase induisant une résistance au ritonavir et au saquinavir, induisent aussi une résistance à l’ indinavir.