I afventning af Europa- Parlamentets og Rådets vedtagelse af forslagene om at overdrage ansvaret for finanskontrollen af alle nyligt oprettede EU- agenturer til Kommissionen blev finanskontrollen af EMEA også i 1998 varetaget af den midlertidige finansinspektør, Claus Christiansen, sammen med en underordnet finansinspektør.
En attente de l’ adoption par le Parlement européen et le Conseil des propositions de transfert des responsabilités du contrôle financier de tous les organismes communautaires à la Commission européenne, le contrôleur financier ad interim de l’ Agence, Claus Christiansen, est resté en fonction en 1998, secondé par un assistant.