Mængden af anidulafungin, der passerer blod- hjernebarrieren, er begrænset hos raske rotter, hvorimod det er vist, at anidulafungin kan passere blod- hjernebarrieren og reducere svampemængden i hjernen hos kaniner med dissemineret candidiasis.
En revanche, chez des lapins atteints de candidose disséminée, l’ anidulafungine a traversé la barrière hémato-encéphalique et a diminué la charge fongique dans le cerveau.