Metabolisme af aprepitant sker hovedsageligt ved oxidation i morfolinringen og i sidekæderne, og de resulterende metabolitter var kun svagt aktive.
Le métabolisme de l’ aprépitant intervient largement via l’ oxydation au niveau du cycle de la morpholine et de ses chaînes latérales, les métabolites qui en résultent n’ étant que faiblement actifs.